MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 3218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	AGCCG	2	10	418	427	20 %	0 %	40 %	40 %	386322496
2	NC_017571	AGTGA	2	10	4915	4924	40 %	20 %	40 %	0 %	386322499
3	NC_017571	ACCCA	2	10	5588	5597	40 %	0 %	0 %	60 %	386322499
4	NC_017571	TGAAT	2	10	10742	10751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017571	TTTCG	2	10	13700	13709	0 %	60 %	20 %	20 %	386322507
6	NC_017571	ATGGC	2	10	14206	14215	20 %	20 %	40 %	20 %	386322508
7	NC_017571	TGATG	2	10	15733	15742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017571	CATTC	2	10	19011	19020	20 %	40 %	0 %	40 %	386322510
9	NC_017571	GCATC	2	10	22916	22925	20 %	20 %	20 %	40 %	386322515
10	NC_017571	ACATC	2	10	23300	23309	40 %	20 %	0 %	40 %	386322515
11	NC_017571	AGTTT	2	10	24601	24610	20 %	60 %	20 %	0 %	386322515
12	NC_017571	CTATT	2	10	28564	28573	20 %	60 %	0 %	20 %	386322518
13	NC_017571	CATGG	2	10	31543	31552	20 %	20 %	40 %	20 %	386322522
14	NC_017571	TTGTC	2	10	33670	33679	0 %	60 %	20 %	20 %	386322524
15	NC_017571	GCGCC	2	10	34223	34232	0 %	0 %	40 %	60 %	386322524
16	NC_017571	GCGAG	2	10	34928	34937	20 %	0 %	60 %	20 %	386322525
17	NC_017571	GTGAT	2	10	36999	37008	20 %	40 %	40 %	0 %	386322527
18	NC_017571	CTGGG	2	10	37688	37697	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017571	CGAAA	2	10	38276	38285	60 %	0 %	20 %	20 %	386322528
20	NC_017571	TTCGT	2	10	38948	38957	0 %	60 %	20 %	20 %	386322529
21	NC_017571	GGTCA	2	10	44008	44017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017571	TTGAA	2	10	44142	44151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017571	AGTCG	2	10	47520	47529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017571	AGGCT	2	10	47847	47856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017571	ATCCC	2	10	49497	49506	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_017571	TCCGC	2	10	49683	49692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017571	CCGTC	2	10	49768	49777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017571	GATTG	2	10	53723	53732	20 %	40 %	40 %	0 %	386322541
29	NC_017571	GATAG	2	10	56371	56380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017571	AAGTT	2	10	56515	56524	40 %	40 %	20 %	0 %	386322544
31	NC_017571	TGTGA	2	10	57688	57697	20 %	40 %	40 %	0 %	386322545
32	NC_017571	AGAAA	2	10	57867	57876	80 %	0 %	20 %	0 %	386322545
33	NC_017571	AAAGG	2	10	57923	57932	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017571	ACCGC	2	10	59083	59092	20 %	0 %	20 %	60 %	386322546
35	NC_017571	ATTCT	2	10	59855	59864	20 %	60 %	0 %	20 %	386322548
36	NC_017571	TCCAA	2	10	60462	60471	40 %	20 %	0 %	40 %	386322548
37	NC_017571	AGCAG	2	10	63051	63060	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017571	AAGTA	2	10	63194	63203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017571	AGGTC	2	10	64710	64719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017571	TTTGT	2	10	65117	65126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017571	AGTTA	2	10	65275	65284	40 %	40 %	20 %	0 %	386322550
42	NC_017571	AGCGC	2	10	68229	68238	20 %	0 %	40 %	40 %	386322553
43	NC_017571	TTGCA	2	10	68813	68822	20 %	40 %	20 %	20 %	386322553
44	NC_017571	CTTTA	2	10	70437	70446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017571	GGCGG	2	10	72736	72745	0 %	0 %	80 %	20 %	386322556
46	NC_017571	GGCTG	2	10	78870	78879	0 %	20 %	60 %	20 %	386322562
47	NC_017571	TTGAT	2	10	79135	79144	20 %	60 %	20 %	0 %	386322562
48	NC_017571	GATTT	2	10	79230	79239	20 %	60 %	20 %	0 %	386322562
49	NC_017571	ATGGT	2	10	80425	80434	20 %	40 %	40 %	0 %	386322563
50	NC_017571	GTTTG	2	10	80561	80570	0 %	60 %	40 %	0 %	386322563
51	NC_017571	GTGCT	2	10	80976	80985	0 %	40 %	40 %	20 %	386322563
52	NC_017571	ACCTG	2	10	83937	83946	20 %	20 %	20 %	40 %	386322564
53	NC_017571	TTAAT	2	10	84072	84081	40 %	60 %	0 %	0 %	386322564
54	NC_017571	ATAGC	2	10	85495	85504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017571	TTTCA	2	10	85629	85638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017571	AGCAA	2	10	85661	85670	60 %	0 %	20 %	20 %	386322566
57	NC_017571	ATTTA	2	10	88496	88505	40 %	60 %	0 %	0 %	386322567
58	NC_017571	GTGAG	2	10	88618	88627	20 %	20 %	60 %	0 %	386322567
59	NC_017571	TGAGT	2	10	94423	94432	20 %	40 %	40 %	0 %	386322569
60	NC_017571	CTTCA	2	10	95578	95587	20 %	40 %	0 %	40 %	386322570
61	NC_017571	TGCGC	2	10	98984	98993	0 %	20 %	40 %	40 %	386322574
62	NC_017571	CTGTG	2	10	102234	102243	0 %	40 %	40 %	20 %	386322576
63	NC_017571	GCCGA	2	10	103283	103292	20 %	0 %	40 %	40 %	386322577
64	NC_017571	TAAAT	2	10	104664	104673	60 %	40 %	0 %	0 %	386322577
65	NC_017571	CAATT	2	10	106785	106794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017571	CGAAT	2	10	111116	111125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017571	GTTCT	2	10	111912	111921	0 %	60 %	20 %	20 %	386322585
68	NC_017571	AGTGC	2	10	112513	112522	20 %	20 %	40 %	20 %	386322586
69	NC_017571	TGGGT	2	10	114125	114134	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017571	GTTGT	2	10	118571	118580	0 %	60 %	40 %	0 %	386322591
71	NC_017571	CTAAG	2	10	119863	119872	40 %	20 %	20 %	20 %	386322591
72	NC_017571	TATCC	2	10	120383	120392	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017571	TTATT	2	10	122228	122237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017571	GCCAA	2	10	123376	123385	40 %	0 %	20 %	40 %	386322594
75	NC_017571	GCCGC	2	10	124761	124770	0 %	0 %	40 %	60 %	386322596
76	NC_017571	AATTG	2	10	127648	127657	40 %	40 %	20 %	0 %	386322597
77	NC_017571	TTGAG	2	10	127949	127958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017571	GCTCA	2	10	128973	128982	20 %	20 %	20 %	40 %	386322599
79	NC_017571	CAAAC	2	10	129124	129133	60 %	0 %	0 %	40 %	386322599
80	NC_017571	TTGCT	2	10	132610	132619	0 %	60 %	20 %	20 %	386322604
81	NC_017571	GCAAC	2	10	132965	132974	40 %	0 %	20 %	40 %	386322604
82	NC_017571	AGTGA	2	10	133899	133908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017571	TCATG	2	10	135498	135507	20 %	40 %	20 %	20 %	386322606
84	NC_017571	CGAGC	2	10	138664	138673	20 %	0 %	40 %	40 %	386322609
85	NC_017571	TAATG	2	10	139092	139101	40 %	40 %	20 %	0 %	386322610
86	NC_017571	CCGCA	2	10	141174	141183	20 %	0 %	20 %	60 %	386322612
87	NC_017571	AGCGC	2	10	144382	144391	20 %	0 %	40 %	40 %	386322616
88	NC_017571	CTGTG	2	10	144454	144463	0 %	40 %	40 %	20 %	386322616
89	NC_017571	CTGAG	2	10	144666	144675	20 %	20 %	40 %	20 %	386322616
90	NC_017571	AATAT	2	10	145783	145792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017571	CTTTT	2	10	146811	146820	0 %	80 %	0 %	20 %	386322617
92	NC_017571	AATGA	2	10	147192	147201	60 %	20 %	20 %	0 %	386322617
93	NC_017571	GAAAT	2	10	151247	151256	60 %	20 %	20 %	0 %	386322618
94	NC_017571	TTATT	2	10	153391	153400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017571	GTCAG	2	10	154132	154141	20 %	20 %	40 %	20 %	386322621
96	NC_017571	TTCAT	2	10	154243	154252	20 %	60 %	0 %	20 %	386322621
97	NC_017571	AGCCT	2	10	154293	154302	20 %	20 %	20 %	40 %	386322621
98	NC_017571	TTGAT	2	10	154761	154770	20 %	60 %	20 %	0 %	386322621
99	NC_017571	TCCGT	2	10	155014	155023	0 %	40 %	20 %	40 %	386322621
100	NC_017571	TGCGT	2	10	155600	155609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017571	AAAAG	2	10	156601	156610	80 %	0 %	20 %	0 %	386322623
102	NC_017571	GGTCT	2	10	158285	158294	0 %	40 %	40 %	20 %	386322626
103	NC_017571	ACGTC	2	10	158682	158691	20 %	20 %	20 %	40 %	386322626
104	NC_017571	CCACA	2	10	158693	158702	40 %	0 %	0 %	60 %	386322626
105	NC_017571	CTTCA	2	10	158929	158938	20 %	40 %	0 %	40 %	386322626
106	NC_017571	TTCTT	2	10	158971	158980	0 %	80 %	0 %	20 %	386322626
107	NC_017571	GTTCA	2	10	162292	162301	20 %	40 %	20 %	20 %	386322630
108	NC_017571	TGTGA	2	10	163241	163250	20 %	40 %	40 %	0 %	386322630
109	NC_017571	CTGCA	2	10	163506	163515	20 %	20 %	20 %	40 %	386322630
110	NC_017571	TGACC	2	10	164409	164418	20 %	20 %	20 %	40 %	386322630
111	NC_017571	CATTC	2	10	164646	164655	20 %	40 %	0 %	40 %	386322630
112	NC_017571	ATTGG	2	10	167619	167628	20 %	40 %	40 %	0 %	386322631
113	NC_017571	AGAAT	2	10	168227	168236	60 %	20 %	20 %	0 %	386322631
114	NC_017571	CCGCA	2	10	168896	168905	20 %	0 %	20 %	60 %	386322632
115	NC_017571	TGATT	2	10	171623	171632	20 %	60 %	20 %	0 %	386322634
116	NC_017571	CTGCA	2	10	176366	176375	20 %	20 %	20 %	40 %	386322636
117	NC_017571	GTGAT	2	10	177365	177374	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017571	TGCAA	2	10	177451	177460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017571	TGCTT	2	10	178025	178034	0 %	60 %	20 %	20 %	386322639
120	NC_017571	AGTAA	2	10	179801	179810	60 %	20 %	20 %	0 %	386322640
121	NC_017571	GCCGA	2	10	180240	180249	20 %	0 %	40 %	40 %	386322640
122	NC_017571	TCACA	2	10	181591	181600	40 %	20 %	0 %	40 %	386322641
123	NC_017571	TTTAG	2	10	182795	182804	20 %	60 %	20 %	0 %	386322642
124	NC_017571	TTGCA	2	10	184559	184568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017571	ATGGA	2	10	185849	185858	40 %	20 %	40 %	0 %	386322644
126	NC_017571	AAGAA	2	10	185935	185944	80 %	0 %	20 %	0 %	386322644
127	NC_017571	AAATG	2	10	186324	186333	60 %	20 %	20 %	0 %	386322644
128	NC_017571	AAAAT	2	10	187420	187429	80 %	20 %	0 %	0 %	386322645
129	NC_017571	CATGG	2	10	187726	187735	20 %	20 %	40 %	20 %	386322645
130	NC_017571	CTTGC	2	10	190579	190588	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017571	TATAA	2	10	191095	191104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017571	CGCGA	2	10	195175	195184	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017571	CATCG	2	10	198002	198011	20 %	20 %	20 %	40 %	386322656
134	NC_017571	CGTGG	2	10	202118	202127	0 %	20 %	60 %	20 %	386322659
135	NC_017571	CACTC	2	10	204177	204186	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017571	ATCTA	2	10	204310	204319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017571	CATTT	2	10	204399	204408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017571	TGTGA	2	10	204412	204421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017571	TGCCG	2	10	204984	204993	0 %	20 %	40 %	40 %	386322660
140	NC_017571	TCACT	2	10	205367	205376	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017571	AAACA	2	10	207446	207455	80 %	0 %	0 %	20 %	386322661
142	NC_017571	ATTGG	2	10	215762	215771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017571	GTGCG	2	10	215977	215986	0 %	20 %	60 %	20 %	386322669
144	NC_017571	ATTTG	2	10	219268	219277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017571	ATTTT	2	10	219308	219317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017571	GCCGA	2	10	228687	228696	20 %	0 %	40 %	40 %	386322681
147	NC_017571	TGCGC	2	10	233809	233818	0 %	20 %	40 %	40 %	386322688
148	NC_017571	GCTTG	2	10	234907	234916	0 %	40 %	40 %	20 %	386322689
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151	NC_017571	TTTGT	2	10	238003	238012	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017571	ATTTA	2	10	242807	242816	40 %	60 %	0 %	0 %	386322693
153	NC_017571	ATTTA	2	10	246574	246583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017571	TTGTC	2	10	247897	247906	0 %	60 %	20 %	20 %	386322695
155	NC_017571	TTTTA	2	10	248839	248848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017571	TTGCA	2	10	251830	251839	20 %	40 %	20 %	20 %	386322699
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160	NC_017571	AGTCG	2	10	262423	262432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017571	AGGCT	2	10	262750	262759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017571	ATCCC	2	10	264400	264409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_017571	GCATG	2	10	265208	265217	20 %	20 %	40 %	20 %	386322707
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169	NC_017571	TCTGT	2	10	277937	277946	0 %	60 %	20 %	20 %	386322718
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171	NC_017571	GTTCT	2	10	283262	283271	0 %	60 %	20 %	20 %	386322721
172	NC_017571	ACTGA	2	10	284282	284291	40 %	20 %	20 %	20 %	386322721
173	NC_017571	CGTAC	2	10	285724	285733	20 %	20 %	20 %	40 %	386322722
174	NC_017571	TGGCG	2	10	288093	288102	0 %	20 %	60 %	20 %	386322725
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176	NC_017571	GTTGA	2	10	295113	295122	20 %	40 %	40 %	0 %	386322741
177	NC_017571	TCGCG	2	10	295788	295797	0 %	20 %	40 %	40 %	386322743
178	NC_017571	ATGGC	2	10	298049	298058	20 %	20 %	40 %	20 %	386322747
179	NC_017571	ACGTG	2	10	299762	299771	20 %	20 %	40 %	20 %	386322749
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182	NC_017571	CGGCG	2	10	304266	304275	0 %	0 %	60 %	40 %	386322754
183	NC_017571	TCCAT	2	10	305320	305329	20 %	40 %	0 %	40 %	386322754
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185	NC_017571	CGGTA	2	10	308653	308662	20 %	20 %	40 %	20 %	386322757
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191	NC_017571	AGTCG	2	10	322747	322756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017571	AGGCT	2	10	323074	323083	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_017571	ATCCC	2	10	324724	324733	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
194	NC_017571	GGCAA	2	10	326125	326134	40 %	0 %	40 %	20 %	386322767
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197	NC_017571	AATAA	2	10	330217	330226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_017571	GAGCC	2	10	409596	409605	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
247	NC_017571	GACTC	2	10	409615	409624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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249	NC_017571	ATCTT	2	10	412700	412709	20 %	60 %	0 %	20 %	386322847
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251	NC_017571	CGTTG	2	10	413840	413849	0 %	40 %	40 %	20 %	386322848
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262	NC_017571	ATTTT	2	10	438882	438891	20 %	80 %	0 %	0 %	386322868
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266	NC_017571	GTGTT	2	10	443462	443471	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017571	CGAGT	2	10	445490	445499	20 %	20 %	40 %	20 %	386322874
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269	NC_017571	AGGCG	2	10	446955	446964	20 %	0 %	60 %	20 %	386322875
270	NC_017571	TGCCT	2	10	447025	447034	0 %	40 %	20 %	40 %	386322875
271	NC_017571	TGCGA	2	10	449817	449826	20 %	20 %	40 %	20 %	386322878
272	NC_017571	CGTAA	2	10	450551	450560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_017571	CTGAA	2	10	452366	452375	40 %	20 %	20 %	20 %	386322881
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275	NC_017571	TAAGT	2	10	456310	456319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017571	GGTGA	2	10	461923	461932	20 %	20 %	60 %	0 %	386322887
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293	NC_017571	TGCAC	2	10	482807	482816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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319	NC_017571	AGCTT	2	10	519085	519094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_017571	TTCAA	2	10	545366	545375	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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373	NC_017571	ACGAT	2	10	615178	615187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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383	NC_017571	AAGGC	2	10	632158	632167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
384	NC_017571	GGCAA	2	10	632446	632455	40 %	0 %	40 %	20 %	386323029
385	NC_017571	CATTC	2	10	635405	635414	20 %	40 %	0 %	40 %	386323031
386	NC_017571	TTGAG	2	10	635965	635974	20 %	40 %	40 %	0 %	386323031
387	NC_017571	GCGAT	2	10	637561	637570	20 %	20 %	40 %	20 %	386323033
388	NC_017571	ATCTT	2	10	638812	638821	20 %	60 %	0 %	20 %	386323034
389	NC_017571	GGACA	2	10	643715	643724	40 %	0 %	40 %	20 %	386323039
390	NC_017571	CGATG	2	10	643803	643812	20 %	20 %	40 %	20 %	386323039
391	NC_017571	GTGAT	2	10	644407	644416	20 %	40 %	40 %	0 %	386323040
392	NC_017571	TCTTG	2	10	645236	645245	0 %	60 %	20 %	20 %	386323041
393	NC_017571	ATGTG	2	10	645585	645594	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
394	NC_017571	TCGAC	2	10	650892	650901	20 %	20 %	20 %	40 %	386323045
395	NC_017571	CTGTC	2	10	651604	651613	0 %	40 %	20 %	40 %	386323045
396	NC_017571	GAGTG	2	10	656170	656179	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017571	ATGGC	2	10	656886	656895	20 %	20 %	40 %	20 %	386323049
398	NC_017571	AGCTA	2	10	657007	657016	40 %	20 %	20 %	20 %	386323049
399	NC_017571	ATTAA	2	10	658095	658104	60 %	40 %	0 %	0 %	386323051
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