MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	TGAAT	2	10	10742	10751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017571	TGATG	2	10	15733	15742	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017571	CTGGG	2	10	37688	37697	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017571	GGTCA	2	10	44008	44017	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017571	TTGAA	2	10	44142	44151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017571	AGTCG	2	10	47520	47529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017571	AGGCT	2	10	47847	47856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017571	ATCCC	2	10	49497	49506	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017571	TCCGC	2	10	49683	49692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017571	CCGTC	2	10	49768	49777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017571	GATAG	2	10	56371	56380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017571	AAAGG	2	10	57923	57932	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017571	AGCAG	2	10	63051	63060	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017571	AAGTA	2	10	63194	63203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017571	AGGTC	2	10	64710	64719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017571	TTTGT	2	10	65117	65126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017571	CTTTA	2	10	70437	70446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017571	ATAGC	2	10	85495	85504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017571	TTTCA	2	10	85629	85638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017571	CAATT	2	10	106785	106794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017571	CGAAT	2	10	111116	111125	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017571	TGGGT	2	10	114125	114134	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017571	TATCC	2	10	120383	120392	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017571	TTATT	2	10	122228	122237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017571	TTGAG	2	10	127949	127958	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017571	AGTGA	2	10	133899	133908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017571	AATAT	2	10	145783	145792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017571	TTATT	2	10	153391	153400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017571	TGCGT	2	10	155600	155609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017571	GTGAT	2	10	177365	177374	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017571	TGCAA	2	10	177451	177460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017571	TTGCA	2	10	184559	184568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017571	CTTGC	2	10	190579	190588	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017571	TATAA	2	10	191095	191104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017571	CGCGA	2	10	195175	195184	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017571	CACTC	2	10	204177	204186	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017571	ATCTA	2	10	204310	204319	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017571	CATTT	2	10	204399	204408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017571	TGTGA	2	10	204412	204421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017571	TCACT	2	10	205367	205376	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017571	ATTGG	2	10	215762	215771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017571	ATTTG	2	10	219268	219277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017571	ATTTT	2	10	219308	219317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017571	TTTGT	2	10	238003	238012	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017571	ATTTA	2	10	246574	246583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017571	TTTTA	2	10	248839	248848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017571	AGTCG	2	10	262423	262432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017571	AGGCT	2	10	262750	262759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017571	ATCCC	2	10	264400	264409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017571	GCTAA	2	10	303118	303127	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017571	TTGAA	2	10	319336	319345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017571	AGTCG	2	10	322747	322756	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017571	AGGCT	2	10	323074	323083	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017571	ATCCC	2	10	324724	324733	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017571	GCATT	2	10	329751	329760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017571	AATAA	2	10	330217	330226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017571	TTGCT	2	10	348695	348704	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017571	TCTGT	2	10	358260	358269	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017571	CATTG	2	10	358404	358413	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017571	TTGCA	2	10	358440	358449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017571	ATAGA	2	10	381603	381612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017571	TTTAG	2	10	406960	406969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017571	GAGCC	2	10	409596	409605	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017571	GACTC	2	10	409615	409624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017571	CCTTC	2	10	413470	413479	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017571	AGTTA	2	10	436381	436390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017571	GTGTT	2	10	443462	443471	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017571	CGTAA	2	10	450551	450560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017571	TAAGT	2	10	456310	456319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017571	GTGTT	2	10	480331	480340	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017571	TGCAC	2	10	482807	482816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017571	GGTCT	2	10	489295	489304	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017571	GGAAT	2	10	499085	499094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017571	AGCTT	2	10	517031	517040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017571	AGCTT	2	10	518062	518071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017571	AGCTT	2	10	519085	519094	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017571	TTTTA	2	10	520156	520165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017571	CTTTT	2	10	530768	530777	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017571	TTCAA	2	10	545366	545375	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017571	AGCTG	2	10	546208	546217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017571	ACTGA	2	10	550178	550187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017571	TTCAA	2	10	554350	554359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017571	CTGAG	2	10	556165	556174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017571	AGCTC	2	10	556177	556186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017571	ACAGT	2	10	563558	563567	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017571	AGTCG	2	10	583474	583483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017571	AGGCT	2	10	583801	583810	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017571	ATCCC	2	10	585451	585460	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017571	GAAAA	2	10	596620	596629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017571	ATTCG	2	10	597352	597361	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017571	TCGGA	2	10	603416	603425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017571	ACGAT	2	10	615178	615187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017571	TGATT	2	10	621339	621348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017571	AGGAT	2	10	624300	624309	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017571	AAGGC	2	10	632158	632167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017571	ATGTG	2	10	645585	645594	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017571	GAGTG	2	10	656170	656179	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017571	AAATA	2	10	678879	678888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017571	TTCAA	2	10	697874	697883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017571	TGATT	2	10	703072	703081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017571	AGCTT	2	10	703502	703511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017571	ATTTC	2	10	709550	709559	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017571	TAAGT	2	10	713594	713603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017571	TAAAA	2	10	717707	717716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017571	AATCA	2	10	721349	721358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017571	GACGT	2	10	740807	740816	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017571	TTCTT	2	10	764131	764140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017571	TTAAA	2	10	769618	769627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017571	GTGCT	2	10	771020	771029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017571	TAATT	2	10	771115	771124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017571	TGCGG	2	10	772289	772298	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017571	ATATT	3	15	772749	772763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017571	ATTTT	2	10	772778	772787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017571	TATTT	2	10	779904	779913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017571	GTCGA	2	10	802426	802435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017571	ATAAA	2	10	804374	804383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017571	AATAT	2	10	807744	807753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017571	TGAAG	2	10	807892	807901	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017571	GGAAC	2	10	811829	811838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017571	GAAGT	2	10	811978	811987	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017571	ATTGT	2	10	812432	812441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017571	ACTTT	2	10	812443	812452	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017571	TTTAT	2	10	819031	819040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017571	GATCA	2	10	821481	821490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017571	ATATT	2	10	821950	821959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017571	TAAAC	2	10	825744	825753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017571	ATATA	2	10	828724	828733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017571	CTAAT	2	10	828877	828886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017571	TTTGT	2	10	840302	840311	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017571	TAAGA	2	10	841812	841821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017571	ATAGA	2	10	846667	846676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017571	ACTGA	2	10	849863	849872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017571	TTGTT	2	10	855977	855986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017571	TTATT	2	10	868173	868182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017571	GTTTT	2	10	885696	885705	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017571	TTTGC	2	10	889294	889303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017571	TATGT	2	10	889492	889501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017571	GATTT	2	10	897166	897175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017571	TCCCT	2	10	908466	908475	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017571	CAGCG	2	10	909202	909211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017571	TTATT	2	10	916121	916130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017571	GTTTG	2	10	916565	916574	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017571	TTTTA	2	10	917341	917350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017571	ATCAC	2	10	918521	918530	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017571	AGTCG	2	10	918822	918831	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017571	TGCTG	2	10	919293	919302	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017571	CCATT	2	10	955296	955305	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017571	ATTTT	2	10	965618	965627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017571	ATTCG	2	10	973737	973746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017571	AAATC	2	10	995371	995380	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017571	AGTCG	2	10	1014219	1014228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017571	AGGCT	2	10	1014546	1014555	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017571	ATCCC	2	10	1016197	1016206	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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155	NC_017571	CCGTC	2	10	1016468	1016477	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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159	NC_017571	TAACT	2	10	1031094	1031103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_017571	AGAGG	2	10	1031185	1031194	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017571	ACGTT	2	10	1055690	1055699	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_017571	AATTG	2	10	1145294	1145303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017571	ATTTT	2	10	1172494	1172503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017571	ACTTC	2	10	2056938	2056947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_017571	TACCA	2	10	2098763	2098772	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_017571	AGCTC	2	10	2099186	2099195	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_017571	AGCTC	2	10	2099373	2099382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_017571	AAAAT	2	10	2107014	2107023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017571	CTTTT	2	10	2110786	2110795	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_017571	AGCCT	2	10	2123676	2123685	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_017571	ATTCA	2	10	2126623	2126632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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299	NC_017571	GCTTC	2	10	2152475	2152484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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352	NC_017571	AACGA	2	10	2575465	2575474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_017571	TAAAA	2	10	2712138	2712147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_017571	TAATT	2	10	2723203	2723212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_017571	TCAAT	2	10	2763768	2763777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
389	NC_017571	GTTAT	2	10	2786869	2786878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017571	TCCGA	2	10	2787314	2787323	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
391	NC_017571	AAAAT	2	10	2788455	2788464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_017571	ATCAA	2	10	2789559	2789568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
393	NC_017571	AGTTA	2	10	2791942	2791951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_017571	CTTAA	2	10	2815943	2815952	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
399	NC_017571	CCTAT	2	10	2816024	2816033	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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407	NC_017571	TAGTG	2	10	2871313	2871322	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_017571	TCACT	2	10	2880774	2880783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
410	NC_017571	CAAAA	2	10	2890734	2890743	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
411	NC_017571	GCAAT	2	10	2891461	2891470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
412	NC_017571	GAAAA	2	10	2913386	2913395	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_017571	TCCAA	2	10	2980135	2980144	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
421	NC_017571	AGTTA	2	10	2984270	2984279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017571	AAAAG	2	10	2990360	2990369	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_017571	AAAAT	2	10	3265492	3265501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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