MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 chromosome

Total Repeats: 60524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017571	GAT	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017571	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322496
3	NC_017571	CAG	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322496
4	NC_017571	GTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322496
5	NC_017571	ACG	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322496
6	NC_017571	GCT	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322496
7	NC_017571	GGT	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322496
8	NC_017571	ATT	2	6	562	567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322496
9	NC_017571	TTG	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322496
10	NC_017571	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322496
11	NC_017571	GAA	2	6	719	724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
12	NC_017571	TAC	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322496
13	NC_017571	GAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322496
14	NC_017571	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
15	NC_017571	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
16	NC_017571	AAT	2	6	850	855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322496
17	NC_017571	CCA	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322496
18	NC_017571	CTT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
19	NC_017571	GCC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322496
20	NC_017571	TAC	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322496
21	NC_017571	TGT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322496
22	NC_017571	TGG	2	6	1348	1353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322496
23	NC_017571	CAC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322496
24	NC_017571	AGA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322496
25	NC_017571	TCT	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322496
26	NC_017571	CCT	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386322497
27	NC_017571	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
28	NC_017571	TAC	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322497
29	NC_017571	GCT	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322497
30	NC_017571	AAC	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
31	NC_017571	ATA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322497
32	NC_017571	TGC	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322497
33	NC_017571	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
34	NC_017571	TTA	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322497
35	NC_017571	GAT	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322497
36	NC_017571	GTG	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322497
37	NC_017571	TAA	2	6	2366	2371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322497
38	NC_017571	GAA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
39	NC_017571	ATC	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322497
40	NC_017571	ACA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
41	NC_017571	CAA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322497
42	NC_017571	GAT	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322497
43	NC_017571	GAA	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322497
44	NC_017571	CGG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017571	GCA	2	6	2667	2672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017571	TAA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322498
47	NC_017571	CGA	3	9	2975	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322498
48	NC_017571	GTG	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322498
49	NC_017571	CCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322498
50	NC_017571	CGC	2	6	3249	3254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322498
51	NC_017571	ACT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322498
52	NC_017571	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322498
53	NC_017571	ACA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322498
54	NC_017571	GAT	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322498
55	NC_017571	CTG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322498
56	NC_017571	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322499
57	NC_017571	TTC	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
58	NC_017571	CGA	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
59	NC_017571	CAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322499
60	NC_017571	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
61	NC_017571	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
62	NC_017571	GCA	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
63	NC_017571	CGG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
64	NC_017571	CGA	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
65	NC_017571	TCG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
66	NC_017571	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
67	NC_017571	ACA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
68	NC_017571	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322499
69	NC_017571	TAA	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322499
70	NC_017571	CAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
71	NC_017571	CAA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322499
72	NC_017571	TGG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
73	NC_017571	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
74	NC_017571	CTG	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
75	NC_017571	TTG	2	6	5000	5005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
76	NC_017571	GCG	2	6	5038	5043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
77	NC_017571	CGT	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
78	NC_017571	GGT	2	6	5089	5094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
79	NC_017571	CTG	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
80	NC_017571	TGT	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
81	NC_017571	AAG	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
82	NC_017571	CGA	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
83	NC_017571	CAT	4	12	5364	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322499
84	NC_017571	CTT	3	9	5424	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
85	NC_017571	CCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322499
86	NC_017571	TTG	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322499
87	NC_017571	AGC	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
88	NC_017571	ACC	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322499
89	NC_017571	TGG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322499
90	NC_017571	AGC	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322499
91	NC_017571	CTG	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
92	NC_017571	CTT	2	6	5928	5933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322499
93	NC_017571	GCG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
94	NC_017571	GAA	2	6	5992	5997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
95	NC_017571	GGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322499
96	NC_017571	AAG	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322499
97	NC_017571	CGT	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322499
98	NC_017571	TGA	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322499
99	NC_017571	TCT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322500
100	NC_017571	CAA	2	6	6418	6423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322500
101	NC_017571	TGC	2	6	6483	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322500
102	NC_017571	ACA	2	6	6543	6548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322500
103	NC_017571	CAT	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322500
104	NC_017571	GCA	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322500
105	NC_017571	AGT	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322500
106	NC_017571	CTA	2	6	7091	7096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017571	CGG	2	6	7341	7346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322501
108	NC_017571	AGC	2	6	7470	7475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322501
109	NC_017571	TCG	2	6	7607	7612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322502
110	NC_017571	TTA	2	6	7618	7623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322502
111	NC_017571	CCG	2	6	7794	7799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322502
112	NC_017571	CTG	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322502
113	NC_017571	CTT	2	6	8024	8029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322502
114	NC_017571	AAT	2	6	8055	8060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322502
115	NC_017571	GGC	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322502
116	NC_017571	TGG	2	6	8306	8311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322502
117	NC_017571	GCG	2	6	8337	8342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322502
118	NC_017571	TAA	2	6	8360	8365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322502
119	NC_017571	ATG	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322502
120	NC_017571	TGA	2	6	8441	8446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322502
121	NC_017571	GAA	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322502
122	NC_017571	GCA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322502
123	NC_017571	TAT	2	6	8697	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322502
124	NC_017571	GTG	2	6	8814	8819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322502
125	NC_017571	TGA	2	6	8820	8825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322502
126	NC_017571	GAT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322503
127	NC_017571	TAA	2	6	9393	9398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322504
128	NC_017571	TCG	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322504
129	NC_017571	AAT	2	6	9770	9775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322505
130	NC_017571	CTG	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322505
131	NC_017571	CTT	2	6	10074	10079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322505
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247	NC_017571	GAG	2	6	19324	19329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_017571	CAG	2	6	19993	19998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322512
255	NC_017571	CAT	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322512
256	NC_017571	CGT	2	6	20103	20108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322512
257	NC_017571	ATG	2	6	20260	20265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017571	TGC	2	6	20364	20369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322513
259	NC_017571	TGT	2	6	20380	20385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322513
260	NC_017571	CTT	2	6	20450	20455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322513
261	NC_017571	AAT	2	6	20478	20483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322513
262	NC_017571	TGA	2	6	20540	20545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322513
263	NC_017571	TTC	2	6	20562	20567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322513
264	NC_017571	CCA	2	6	20602	20607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322513
265	NC_017571	ATC	2	6	20718	20723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322513
266	NC_017571	TTC	2	6	20847	20852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322513
267	NC_017571	CTG	2	6	20856	20861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322513
268	NC_017571	TCT	2	6	21198	21203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322513
269	NC_017571	CAG	2	6	21246	21251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322513
270	NC_017571	CGA	2	6	21293	21298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322513
271	NC_017571	ATG	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322513
272	NC_017571	AGA	2	6	21368	21373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322513
273	NC_017571	AAC	2	6	21465	21470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_017571	TGA	2	6	21507	21512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017571	TGT	2	6	21522	21527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017571	CAG	2	6	21590	21595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017571	ATT	2	6	21672	21677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017571	CGT	2	6	21788	21793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322514
279	NC_017571	AAC	2	6	21811	21816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322514
280	NC_017571	GCC	2	6	21842	21847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322514
281	NC_017571	TCA	2	6	21864	21869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322514
282	NC_017571	AGC	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322514
283	NC_017571	ATA	2	6	22014	22019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322514
284	NC_017571	TTC	2	6	22094	22099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322514
285	NC_017571	AGA	2	6	22136	22141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322514
286	NC_017571	CAG	2	6	22147	22152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322514
287	NC_017571	GCA	2	6	22317	22322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322514
288	NC_017571	CAT	2	6	22412	22417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322514
289	NC_017571	GTT	2	6	22436	22441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322514
290	NC_017571	CCA	2	6	22503	22508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322514
291	NC_017571	ATA	2	6	22509	22514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322514
292	NC_017571	TGG	2	6	22554	22559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322514
293	NC_017571	TGA	2	6	22571	22576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322514
294	NC_017571	CAG	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322514
295	NC_017571	GTA	2	6	22884	22889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
296	NC_017571	GCT	2	6	22903	22908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322515
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298	NC_017571	CTT	2	6	23090	23095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322515
299	NC_017571	GAT	2	6	23115	23120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
300	NC_017571	AAT	2	6	23142	23147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322515
301	NC_017571	TGA	2	6	23374	23379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322515
302	NC_017571	GCA	2	6	23461	23466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322515
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304	NC_017571	AAC	2	6	23553	23558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322515
305	NC_017571	TTC	2	6	23610	23615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322515
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322	NC_017571	CCA	2	6	25057	25062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
323	NC_017571	CAG	2	6	25097	25102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_017571	CAT	2	6	25110	25115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
325	NC_017571	ACA	2	6	25158	25163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
326	NC_017571	TGT	2	6	25436	25441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
327	NC_017571	ATT	2	6	25482	25487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_017571	TCA	2	6	25530	25535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322516
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330	NC_017571	TTG	2	6	25716	25721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322516
331	NC_017571	GCT	2	6	25836	25841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322516
332	NC_017571	TGA	2	6	25961	25966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322516
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342	NC_017571	TGA	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322516
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