MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	TAGCT	2	10	99	108	20 %	40 %	20 %	20 %	386322428
2	NC_017570	CATGG	2	10	165	174	20 %	20 %	40 %	20 %	386322428
3	NC_017570	CATTT	2	10	2015	2024	20 %	60 %	0 %	20 %	386322430
4	NC_017570	ATTAT	2	10	3286	3295	40 %	60 %	0 %	0 %	386322431
5	NC_017570	GATTT	2	10	4027	4036	20 %	60 %	20 %	0 %	386322433
6	NC_017570	AAAGC	2	10	4737	4746	60 %	0 %	20 %	20 %	386322433
7	NC_017570	GAAAA	2	10	4901	4910	80 %	0 %	20 %	0 %	386322433
8	NC_017570	AACTA	2	10	7669	7678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017570	TTTCG	2	10	16378	16387	0 %	60 %	20 %	20 %	386322439
10	NC_017570	TAATG	2	10	16605	16614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017570	TACTA	2	10	17124	17133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017570	CTTAC	2	10	17418	17427	20 %	40 %	0 %	40 %	386322441
13	NC_017570	ACCCC	2	10	17544	17553	20 %	0 %	0 %	80 %	386322441
14	NC_017570	TCGTC	2	10	19173	19182	0 %	40 %	20 %	40 %	386322445
15	NC_017570	GCCAT	2	10	19577	19586	20 %	20 %	20 %	40 %	386322446
16	NC_017570	ATGCA	2	10	20570	20579	40 %	20 %	20 %	20 %	386322447
17	NC_017570	TACCG	2	10	20916	20925	20 %	20 %	20 %	40 %	386322447
18	NC_017570	TGCAT	2	10	22935	22944	20 %	40 %	20 %	20 %	386322449
19	NC_017570	TGGCA	2	10	23881	23890	20 %	20 %	40 %	20 %	386322449
20	NC_017570	CATTT	2	10	25989	25998	20 %	60 %	0 %	20 %	386322452
21	NC_017570	GCAAA	2	10	27079	27088	60 %	0 %	20 %	20 %	386322453
22	NC_017570	CATAC	2	10	27905	27914	40 %	20 %	0 %	40 %	386322454
23	NC_017570	CAAAA	2	10	33929	33938	80 %	0 %	0 %	20 %	386322460
24	NC_017570	AACCA	2	10	37307	37316	60 %	0 %	0 %	40 %	386322462
25	NC_017570	AGCGC	2	10	38314	38323	20 %	0 %	40 %	40 %	386322462
26	NC_017570	AGAGC	2	10	38925	38934	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017570	ACAGC	2	10	41187	41196	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017570	AACAG	2	10	42408	42417	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017570	AATAA	2	10	44618	44627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017570	CTTCT	2	10	45043	45052	0 %	60 %	0 %	40 %	386322464
31	NC_017570	AAACT	2	10	45780	45789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017570	TAAAT	2	10	45998	46007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017570	TTTCC	2	10	48541	48550	0 %	60 %	0 %	40 %	386322467
34	NC_017570	TTTTG	2	10	50459	50468	0 %	80 %	20 %	0 %	386322468
35	NC_017570	TAACG	2	10	51915	51924	40 %	20 %	20 %	20 %	386322469
36	NC_017570	TGTGG	2	10	52107	52116	0 %	40 %	60 %	0 %	386322469
37	NC_017570	TTGAT	2	10	53521	53530	20 %	60 %	20 %	0 %	386322471
38	NC_017570	AGCGA	2	10	54190	54199	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017570	ATCAA	2	10	56908	56917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017570	CATAT	2	10	59103	59112	40 %	40 %	0 %	20 %	386322476
41	NC_017570	AGCGA	2	10	60061	60070	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017570	ACAAG	2	10	61895	61904	60 %	0 %	20 %	20 %	386322482
43	NC_017570	AGCGA	2	10	63954	63963	40 %	0 %	40 %	20 %	386322483
44	NC_017570	AACCA	2	10	64175	64184	60 %	0 %	0 %	40 %	386322484
45	NC_017570	ACCCA	2	10	65068	65077	40 %	0 %	0 %	60 %	386322485
46	NC_017570	TTTTG	2	10	65636	65645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017570	CATAA	2	10	67088	67097	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017570	CAACA	2	10	68892	68901	60 %	0 %	0 %	40 %	386322491
49	NC_017570	GCATG	2	10	69406	69415	20 %	20 %	40 %	20 %	386322492
50	NC_017570	CTTAC	2	10	69959	69968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017570	TCAGA	2	10	70711	70720	40 %	20 %	20 %	20 %	386322493
52	NC_017570	CTAAA	2	10	70750	70759	60 %	20 %	0 %	20 %	386322493
53	NC_017570	AAGAA	2	10	71277	71286	80 %	0 %	20 %	0 %	386322493
54	NC_017570	ATATG	2	10	71387	71396	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017570	CACAT	2	10	71645	71654	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.