MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	TAAA	2	8	744	751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017570	GGAA	2	8	1139	1146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017570	GTCT	2	8	7363	7370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017570	GCAA	2	8	7629	7636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017570	TTTA	2	8	7813	7820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017570	GATT	2	8	11720	11727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017570	TATT	2	8	11832	11839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017570	CTTA	2	8	15117	15124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017570	ATAC	2	8	15523	15530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017570	TTAT	2	8	15645	15652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017570	TGAC	2	8	16479	16486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017570	TAAC	2	8	16767	16774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017570	ACAT	2	8	17603	17610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017570	CACT	2	8	39331	39338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017570	TTTG	2	8	39534	39541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017570	AACC	2	8	40038	40045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017570	AAAG	2	8	40137	40144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017570	CAAG	2	8	40527	40534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017570	CAAA	2	8	41121	41128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017570	AGAC	2	8	41818	41825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017570	CAAT	2	8	42372	42379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017570	ATCA	2	8	42563	42570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017570	TAAC	2	8	43293	43300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017570	TTAA	2	8	43724	43731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017570	TCGC	2	8	43928	43935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017570	CAAG	2	8	43951	43958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017570	TTAC	2	8	44088	44095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017570	ATAA	2	8	44132	44139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017570	TAAT	2	8	44738	44745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017570	AATT	2	8	45426	45433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017570	ATAA	2	8	45816	45823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017570	CAAA	2	8	46319	46326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017570	ACAA	2	8	46360	46367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017570	CTAA	2	8	49370	49377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017570	GCTC	2	8	53912	53919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017570	GCTT	2	8	54154	54161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017570	GAAT	2	8	54302	54309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017570	CAAA	2	8	54374	54381	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017570	TCAA	2	8	56885	56892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017570	TGCT	2	8	57295	57302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017570	GCTC	2	8	59782	59789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017570	GCTT	2	8	60025	60032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017570	CCGA	2	8	60076	60083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017570	ATTT	2	8	61656	61663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017570	TGCT	2	8	61670	61677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017570	GACA	2	8	63667	63674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017570	GTCA	2	8	65779	65786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017570	CTTT	2	8	66184	66191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017570	CAAT	2	8	66446	66453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017570	TATC	2	8	66486	66493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017570	AAGA	2	8	66563	66570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017570	CAGC	2	8	69752	69759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017570	ACTT	2	8	70067	70074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017570	TAAA	2	8	72364	72371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.