MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	TAAC	2	8	24	31	50 %	25 %	0 %	25 %	386322428
2	NC_017570	TTTG	2	8	1411	1418	0 %	75 %	25 %	0 %	386322430
3	NC_017570	ATTC	2	8	1786	1793	25 %	50 %	0 %	25 %	386322430
4	NC_017570	TTTC	2	8	2055	2062	0 %	75 %	0 %	25 %	386322430
5	NC_017570	AGCA	2	8	2142	2149	50 %	0 %	25 %	25 %	386322430
6	NC_017570	AGAT	2	8	2652	2659	50 %	25 %	25 %	0 %	386322431
7	NC_017570	CTAC	2	8	2750	2757	25 %	25 %	0 %	50 %	386322431
8	NC_017570	AGTG	2	8	3248	3255	25 %	25 %	50 %	0 %	386322431
9	NC_017570	TGCT	2	8	3336	3343	0 %	50 %	25 %	25 %	386322431
10	NC_017570	GTAA	2	8	3347	3354	50 %	25 %	25 %	0 %	386322431
11	NC_017570	AAGG	2	8	3836	3843	50 %	0 %	50 %	0 %	386322432
12	NC_017570	TAAA	2	8	3887	3894	75 %	25 %	0 %	0 %	386322432
13	NC_017570	AGAA	2	8	4271	4278	75 %	0 %	25 %	0 %	386322433
14	NC_017570	AAAG	2	8	4431	4438	75 %	0 %	25 %	0 %	386322433
15	NC_017570	AGAT	2	8	4616	4623	50 %	25 %	25 %	0 %	386322433
16	NC_017570	ATCT	2	8	4882	4889	25 %	50 %	0 %	25 %	386322433
17	NC_017570	CAAC	2	8	5000	5007	50 %	0 %	0 %	50 %	386322433
18	NC_017570	ACAA	2	8	5608	5615	75 %	0 %	0 %	25 %	386322433
19	NC_017570	TCTA	2	8	5719	5726	25 %	50 %	0 %	25 %	386322433
20	NC_017570	AAAG	2	8	6497	6504	75 %	0 %	25 %	0 %	386322434
21	NC_017570	ATGT	2	8	6818	6825	25 %	50 %	25 %	0 %	386322434
22	NC_017570	AAAG	2	8	8384	8391	75 %	0 %	25 %	0 %	386322435
23	NC_017570	AGGA	2	8	8816	8823	50 %	0 %	50 %	0 %	386322435
24	NC_017570	CCAC	2	8	8878	8885	25 %	0 %	0 %	75 %	386322435
25	NC_017570	CCTC	2	8	9891	9898	0 %	25 %	0 %	75 %	386322435
26	NC_017570	CAAT	2	8	10123	10130	50 %	25 %	0 %	25 %	386322435
27	NC_017570	ATGA	2	8	10165	10172	50 %	25 %	25 %	0 %	386322435
28	NC_017570	ATCT	2	8	10204	10211	25 %	50 %	0 %	25 %	386322435
29	NC_017570	CGAA	2	8	10376	10383	50 %	0 %	25 %	25 %	386322435
30	NC_017570	CCAT	2	8	11155	11162	25 %	25 %	0 %	50 %	386322435
31	NC_017570	GTTC	2	8	11275	11282	0 %	50 %	25 %	25 %	386322435
32	NC_017570	ACGA	2	8	11319	11326	50 %	0 %	25 %	25 %	386322435
33	NC_017570	ATTT	2	8	12374	12381	25 %	75 %	0 %	0 %	386322436
34	NC_017570	ACTT	2	8	13317	13324	25 %	50 %	0 %	25 %	386322436
35	NC_017570	ATTT	2	8	13380	13387	25 %	75 %	0 %	0 %	386322436
36	NC_017570	TGCT	2	8	13451	13458	0 %	50 %	25 %	25 %	386322437
37	NC_017570	TGAC	2	8	13601	13608	25 %	25 %	25 %	25 %	386322437
38	NC_017570	GAGG	2	8	13890	13897	25 %	0 %	75 %	0 %	386322437
39	NC_017570	AACC	2	8	14001	14008	50 %	0 %	0 %	50 %	386322437
40	NC_017570	CCAT	2	8	14205	14212	25 %	25 %	0 %	50 %	386322437
41	NC_017570	AGCA	2	8	16049	16056	50 %	0 %	25 %	25 %	386322439
42	NC_017570	GCAA	2	8	17433	17440	50 %	0 %	25 %	25 %	386322441
43	NC_017570	TGTT	2	8	17536	17543	0 %	75 %	25 %	0 %	386322441
44	NC_017570	GATG	2	8	18485	18492	25 %	25 %	50 %	0 %	386322444
45	NC_017570	GATT	2	8	19495	19502	25 %	50 %	25 %	0 %	386322446
46	NC_017570	CGGG	2	8	20115	20122	0 %	0 %	75 %	25 %	386322446
47	NC_017570	TGAT	2	8	20348	20355	25 %	50 %	25 %	0 %	386322447
48	NC_017570	AATT	2	8	21655	21662	50 %	50 %	0 %	0 %	386322447
49	NC_017570	AGTC	2	8	22003	22010	25 %	25 %	25 %	25 %	386322448
50	NC_017570	CTAT	2	8	22486	22493	25 %	50 %	0 %	25 %	386322449
51	NC_017570	AATC	2	8	22877	22884	50 %	25 %	0 %	25 %	386322449
52	NC_017570	GGCA	2	8	23252	23259	25 %	0 %	50 %	25 %	386322449
53	NC_017570	CTCA	2	8	23631	23638	25 %	25 %	0 %	50 %	386322449
54	NC_017570	AACA	2	8	24411	24418	75 %	0 %	0 %	25 %	386322449
55	NC_017570	GCGG	2	8	24507	24514	0 %	0 %	75 %	25 %	386322449
56	NC_017570	AAGC	2	8	25713	25720	50 %	0 %	25 %	25 %	386322451
57	NC_017570	CGTT	2	8	25877	25884	0 %	50 %	25 %	25 %	386322452
58	NC_017570	AGAT	2	8	26294	26301	50 %	25 %	25 %	0 %	386322452
59	NC_017570	TGCC	2	8	27183	27190	0 %	25 %	25 %	50 %	386322453
60	NC_017570	ACTT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	0 %	25 %	386322453
61	NC_017570	CTCA	2	8	28320	28327	25 %	25 %	0 %	50 %	386322454
62	NC_017570	TAAC	2	8	28418	28425	50 %	25 %	0 %	25 %	386322454
63	NC_017570	ACCG	2	8	29570	29577	25 %	0 %	25 %	50 %	386322455
64	NC_017570	GCCA	2	8	30059	30066	25 %	0 %	25 %	50 %	386322455
65	NC_017570	GTTA	2	8	30125	30132	25 %	50 %	25 %	0 %	386322455
66	NC_017570	CGCT	2	8	30157	30164	0 %	25 %	25 %	50 %	386322455
67	NC_017570	TCAA	2	8	30504	30511	50 %	25 %	0 %	25 %	386322456
68	NC_017570	CGCC	2	8	30591	30598	0 %	0 %	25 %	75 %	386322456
69	NC_017570	CAAA	2	8	30693	30700	75 %	0 %	0 %	25 %	386322456
70	NC_017570	GCCA	2	8	30954	30961	25 %	0 %	25 %	50 %	386322456
71	NC_017570	TTTC	2	8	31128	31135	0 %	75 %	0 %	25 %	386322457
72	NC_017570	TGCA	2	8	31529	31536	25 %	25 %	25 %	25 %	386322458
73	NC_017570	TGCG	2	8	31556	31563	0 %	25 %	50 %	25 %	386322458
74	NC_017570	AAGA	2	8	32253	32260	75 %	0 %	25 %	0 %	386322459
75	NC_017570	CCTT	2	8	32326	32333	0 %	50 %	0 %	50 %	386322459
76	NC_017570	CGAG	2	8	32840	32847	25 %	0 %	50 %	25 %	386322459
77	NC_017570	CAAG	2	8	33055	33062	50 %	0 %	25 %	25 %	386322460
78	NC_017570	TTGC	2	8	33221	33228	0 %	50 %	25 %	25 %	386322460
79	NC_017570	TATG	2	8	33343	33350	25 %	50 %	25 %	0 %	386322460
80	NC_017570	AGCG	2	8	35122	35129	25 %	0 %	50 %	25 %	386322460
81	NC_017570	TCAA	2	8	35292	35299	50 %	25 %	0 %	25 %	386322460
82	NC_017570	GGAA	2	8	35652	35659	50 %	0 %	50 %	0 %	386322460
83	NC_017570	TCAA	2	8	35809	35816	50 %	25 %	0 %	25 %	386322460
84	NC_017570	GATG	2	8	37696	37703	25 %	25 %	50 %	0 %	386322462
85	NC_017570	TAGA	2	8	46755	46762	50 %	25 %	25 %	0 %	386322465
86	NC_017570	TTAA	2	8	46884	46891	50 %	50 %	0 %	0 %	386322465
87	NC_017570	AATG	2	8	47403	47410	50 %	25 %	25 %	0 %	386322466
88	NC_017570	TGGA	2	8	47823	47830	25 %	25 %	50 %	0 %	386322466
89	NC_017570	CCAT	2	8	48208	48215	25 %	25 %	0 %	50 %	386322467
90	NC_017570	TTCC	2	8	48319	48326	0 %	50 %	0 %	50 %	386322467
91	NC_017570	TCAT	2	8	48712	48719	25 %	50 %	0 %	25 %	386322467
92	NC_017570	TGAT	2	8	48905	48912	25 %	50 %	25 %	0 %	386322467
93	NC_017570	TGTT	2	8	50727	50734	0 %	75 %	25 %	0 %	386322468
94	NC_017570	TGAT	2	8	51299	51306	25 %	50 %	25 %	0 %	386322469
95	NC_017570	ATAA	2	8	51565	51572	75 %	25 %	0 %	0 %	386322469
96	NC_017570	GCAT	2	8	51708	51715	25 %	25 %	25 %	25 %	386322469
97	NC_017570	ATCT	2	8	51926	51933	25 %	50 %	0 %	25 %	386322469
98	NC_017570	TATC	2	8	52123	52130	25 %	50 %	0 %	25 %	386322469
99	NC_017570	TTAA	2	8	52619	52626	50 %	50 %	0 %	0 %	386322470
100	NC_017570	AATG	2	8	54500	54507	50 %	25 %	25 %	0 %	386322472
101	NC_017570	ATCA	2	8	54518	54525	50 %	25 %	0 %	25 %	386322472
102	NC_017570	CAAG	2	8	55017	55024	50 %	0 %	25 %	25 %	386322472
103	NC_017570	CGAG	2	8	55178	55185	25 %	0 %	50 %	25 %	386322472
104	NC_017570	ATGA	2	8	55314	55321	50 %	25 %	25 %	0 %	386322472
105	NC_017570	AGTA	2	8	56047	56054	50 %	25 %	25 %	0 %	386322473
106	NC_017570	GATT	2	8	56059	56066	25 %	50 %	25 %	0 %	386322473
107	NC_017570	CGCA	2	8	56094	56101	25 %	0 %	25 %	50 %	386322473
108	NC_017570	ATGT	2	8	56235	56242	25 %	50 %	25 %	0 %	386322473
109	NC_017570	TCTT	2	8	57948	57955	0 %	75 %	0 %	25 %	386322474
110	NC_017570	AGCG	2	8	58251	58258	25 %	0 %	50 %	25 %	386322475
111	NC_017570	ACGC	2	8	59404	59411	25 %	0 %	25 %	50 %	386322477
112	NC_017570	AAAT	2	8	60319	60326	75 %	25 %	0 %	0 %	386322478
113	NC_017570	TCAA	2	8	60763	60770	50 %	25 %	0 %	25 %	386322480
114	NC_017570	CTGA	2	8	61169	61176	25 %	25 %	25 %	25 %	386322481
115	NC_017570	GCCA	2	8	61346	61353	25 %	0 %	25 %	50 %	386322481
116	NC_017570	TTCA	2	8	61396	61403	25 %	50 %	0 %	25 %	386322481
117	NC_017570	TTTC	2	8	62050	62057	0 %	75 %	0 %	25 %	386322482
118	NC_017570	GGCT	2	8	62131	62138	0 %	25 %	50 %	25 %	386322482
119	NC_017570	ACAG	2	8	62267	62274	50 %	0 %	25 %	25 %	386322482
120	NC_017570	AACT	2	8	62624	62631	50 %	25 %	0 %	25 %	386322482
121	NC_017570	CCCG	2	8	62765	62772	0 %	0 %	25 %	75 %	386322482
122	NC_017570	TTGC	2	8	63571	63578	0 %	50 %	25 %	25 %	386322482
123	NC_017570	TTTG	2	8	63857	63864	0 %	75 %	25 %	0 %	386322483
124	NC_017570	GCTT	2	8	63918	63925	0 %	50 %	25 %	25 %	386322483
125	NC_017570	CCGA	2	8	63969	63976	25 %	0 %	25 %	50 %	386322483
126	NC_017570	TGAG	2	8	64082	64089	25 %	25 %	50 %	0 %	386322484
127	NC_017570	CTAT	2	8	65318	65325	25 %	50 %	0 %	25 %	386322485
128	NC_017570	TAAA	2	8	66017	66024	75 %	25 %	0 %	0 %	386322487
129	NC_017570	CCAA	2	8	66063	66070	50 %	0 %	0 %	50 %	386322487
130	NC_017570	GATT	2	8	66787	66794	25 %	50 %	25 %	0 %	386322489
131	NC_017570	TATT	2	8	67333	67340	25 %	75 %	0 %	0 %	386322490
132	NC_017570	ATCA	2	8	67969	67976	50 %	25 %	0 %	25 %	386322491
133	NC_017570	TCGC	2	8	68242	68249	0 %	25 %	25 %	50 %	386322491
134	NC_017570	ATCA	2	8	68509	68516	50 %	25 %	0 %	25 %	386322491
135	NC_017570	GATT	2	8	68883	68890	25 %	50 %	25 %	0 %	386322491
136	NC_017570	AAAT	2	8	70526	70533	75 %	25 %	0 %	0 %	386322493
137	NC_017570	GGTA	2	8	71121	71128	25 %	25 %	50 %	0 %	386322493
138	NC_017570	CCTA	2	8	71754	71761	25 %	25 %	0 %	50 %	386322494
139	NC_017570	ACTG	2	8	72097	72104	25 %	25 %	25 %	25 %	386322494
140	NC_017570	TGAT	2	8	72111	72118	25 %	50 %	25 %	0 %	386322494

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.