MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica BA175 plasmid pSBAL17501

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017570	TA	3	6	2393	2398	50 %	50 %	0 %	0 %	386322430
2	NC_017570	TA	3	6	3385	3390	50 %	50 %	0 %	0 %	386322431
3	NC_017570	TA	3	6	3529	3534	50 %	50 %	0 %	0 %	386322432
4	NC_017570	AT	3	6	3639	3644	50 %	50 %	0 %	0 %	386322432
5	NC_017570	AT	4	8	3988	3995	50 %	50 %	0 %	0 %	386322433
6	NC_017570	TA	3	6	4702	4707	50 %	50 %	0 %	0 %	386322433
7	NC_017570	CG	3	6	4962	4967	0 %	0 %	50 %	50 %	386322433
8	NC_017570	AG	3	6	6359	6364	50 %	0 %	50 %	0 %	386322434
9	NC_017570	TA	3	6	7207	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	386322434
10	NC_017570	CA	3	6	7314	7319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017570	GT	3	6	7918	7923	0 %	50 %	50 %	0 %	386322435
12	NC_017570	AG	3	6	8484	8489	50 %	0 %	50 %	0 %	386322435
13	NC_017570	GA	3	6	8606	8611	50 %	0 %	50 %	0 %	386322435
14	NC_017570	CG	3	6	11738	11743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017570	TG	3	6	12250	12255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017570	GT	3	6	12724	12729	0 %	50 %	50 %	0 %	386322436
17	NC_017570	AT	3	6	12989	12994	50 %	50 %	0 %	0 %	386322436
18	NC_017570	AG	3	6	13956	13961	50 %	0 %	50 %	0 %	386322437
19	NC_017570	AG	3	6	15049	15054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017570	TA	3	6	15170	15175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017570	AG	3	6	15593	15598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017570	GC	3	6	16241	16246	0 %	0 %	50 %	50 %	386322439
23	NC_017570	AC	4	8	16437	16444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017570	AC	3	6	16732	16737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017570	TA	3	6	17164	17169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017570	AT	3	6	17283	17288	50 %	50 %	0 %	0 %	386322441
27	NC_017570	TG	3	6	18168	18173	0 %	50 %	50 %	0 %	386322443
28	NC_017570	AC	3	6	18806	18811	50 %	0 %	0 %	50 %	386322445
29	NC_017570	CG	3	6	19219	19224	0 %	0 %	50 %	50 %	386322445
30	NC_017570	GC	3	6	19356	19361	0 %	0 %	50 %	50 %	386322446
31	NC_017570	GC	3	6	19556	19561	0 %	0 %	50 %	50 %	386322446
32	NC_017570	CA	3	6	22836	22841	50 %	0 %	0 %	50 %	386322449
33	NC_017570	TG	3	6	24189	24194	0 %	50 %	50 %	0 %	386322449
34	NC_017570	CG	3	6	24553	24558	0 %	0 %	50 %	50 %	386322449
35	NC_017570	CG	3	6	24800	24805	0 %	0 %	50 %	50 %	386322450
36	NC_017570	CG	3	6	25426	25431	0 %	0 %	50 %	50 %	386322451
37	NC_017570	CA	3	6	25579	25584	50 %	0 %	0 %	50 %	386322451
38	NC_017570	GC	3	6	25641	25646	0 %	0 %	50 %	50 %	386322451
39	NC_017570	CG	3	6	26078	26083	0 %	0 %	50 %	50 %	386322452
40	NC_017570	CT	3	6	26884	26889	0 %	50 %	0 %	50 %	386322453
41	NC_017570	CA	3	6	27014	27019	50 %	0 %	0 %	50 %	386322453
42	NC_017570	GT	4	8	29093	29100	0 %	50 %	50 %	0 %	386322454
43	NC_017570	CG	3	6	29142	29147	0 %	0 %	50 %	50 %	386322454
44	NC_017570	CG	3	6	29167	29172	0 %	0 %	50 %	50 %	386322454
45	NC_017570	GC	3	6	29903	29908	0 %	0 %	50 %	50 %	386322455
46	NC_017570	TC	3	6	30175	30180	0 %	50 %	0 %	50 %	386322455
47	NC_017570	CA	3	6	31069	31074	50 %	0 %	0 %	50 %	386322457
48	NC_017570	GC	3	6	32406	32411	0 %	0 %	50 %	50 %	386322459
49	NC_017570	GC	3	6	33977	33982	0 %	0 %	50 %	50 %	386322460
50	NC_017570	CG	3	6	34384	34389	0 %	0 %	50 %	50 %	386322460
51	NC_017570	TA	3	6	34904	34909	50 %	50 %	0 %	0 %	386322460
52	NC_017570	GC	3	6	37203	37208	0 %	0 %	50 %	50 %	386322462
53	NC_017570	CG	3	6	38752	38757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017570	GC	4	8	39375	39382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017570	CG	3	6	39832	39837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017570	CG	3	6	39911	39916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017570	AG	3	6	40050	40055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017570	CA	6	12	40363	40374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017570	AC	3	6	40701	40706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017570	AT	3	6	41360	41365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017570	GC	3	6	41733	41738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017570	AC	3	6	42048	42053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017570	AC	3	6	42095	42100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017570	GC	5	10	42285	42294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017570	CA	3	6	43163	43168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017570	GC	3	6	43306	43311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017570	GC	4	8	43883	43890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017570	AT	3	6	44744	44749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017570	GT	3	6	44900	44905	0 %	50 %	50 %	0 %	386322464
70	NC_017570	CG	3	6	45014	45019	0 %	0 %	50 %	50 %	386322464
71	NC_017570	AC	3	6	45268	45273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017570	TA	3	6	45991	45996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017570	AT	3	6	46342	46347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017570	AG	3	6	46487	46492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017570	AC	3	6	46614	46619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017570	TA	3	6	46766	46771	50 %	50 %	0 %	0 %	386322465
77	NC_017570	AT	3	6	46983	46988	50 %	50 %	0 %	0 %	386322466
78	NC_017570	TC	3	6	47326	47331	0 %	50 %	0 %	50 %	386322466
79	NC_017570	AG	3	6	47498	47503	50 %	0 %	50 %	0 %	386322466
80	NC_017570	AT	3	6	48762	48767	50 %	50 %	0 %	0 %	386322467
81	NC_017570	AT	3	6	48949	48954	50 %	50 %	0 %	0 %	386322467
82	NC_017570	TG	3	6	49074	49079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017570	AC	3	6	49472	49477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017570	GC	3	6	49527	49532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017570	CG	3	6	49713	49718	0 %	0 %	50 %	50 %	386322468
86	NC_017570	GT	3	6	50779	50784	0 %	50 %	50 %	0 %	386322468
87	NC_017570	GT	4	8	51101	51108	0 %	50 %	50 %	0 %	386322469
88	NC_017570	AG	3	6	51885	51890	50 %	0 %	50 %	0 %	386322469
89	NC_017570	TA	3	6	52761	52766	50 %	50 %	0 %	0 %	386322470
90	NC_017570	AC	3	6	53647	53652	50 %	0 %	0 %	50 %	386322471
91	NC_017570	GT	3	6	53851	53856	0 %	50 %	50 %	0 %	386322471
92	NC_017570	GC	3	6	53942	53947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017570	AC	3	6	54960	54965	50 %	0 %	0 %	50 %	386322472
94	NC_017570	AT	3	6	55626	55631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017570	TA	3	6	56707	56712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017570	GT	3	6	56784	56789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017570	TG	3	6	57901	57906	0 %	50 %	50 %	0 %	386322474
98	NC_017570	CG	3	6	58084	58089	0 %	0 %	50 %	50 %	386322475
99	NC_017570	TG	3	6	58183	58188	0 %	50 %	50 %	0 %	386322475
100	NC_017570	CT	3	6	58759	58764	0 %	50 %	0 %	50 %	386322476
101	NC_017570	GT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	50 %	0 %	386322477
102	NC_017570	GC	3	6	59812	59817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017570	AC	3	6	61634	61639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017570	AC	3	6	61644	61649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017570	CG	3	6	62655	62660	0 %	0 %	50 %	50 %	386322482
106	NC_017570	GC	3	6	63678	63683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017570	GC	4	8	64758	64765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017570	GA	3	6	64795	64800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017570	AT	3	6	66172	66177	50 %	50 %	0 %	0 %	386322487
110	NC_017570	CA	3	6	66300	66305	50 %	0 %	0 %	50 %	386322488
111	NC_017570	CT	3	6	67387	67392	0 %	50 %	0 %	50 %	386322490
112	NC_017570	CA	3	6	68046	68051	50 %	0 %	0 %	50 %	386322491
113	NC_017570	CA	4	8	68596	68603	50 %	0 %	0 %	50 %	386322491
114	NC_017570	AG	3	6	69210	69215	50 %	0 %	50 %	0 %	386322492
115	NC_017570	CA	3	6	70061	70066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017570	CA	3	6	70116	70121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017570	TA	3	6	70440	70445	50 %	50 %	0 %	0 %	386322493
118	NC_017570	CT	3	6	70619	70624	0 %	50 %	0 %	50 %	386322493
119	NC_017570	CA	3	6	70935	70940	50 %	0 %	0 %	50 %	386322493
120	NC_017570	AC	3	6	71177	71182	50 %	0 %	0 %	50 %	386322493
121	NC_017570	TG	3	6	71228	71233	0 %	50 %	50 %	0 %	386322493
122	NC_017570	AC	3	6	71515	71520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017570	TA	3	6	71670	71675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017570	TA	3	6	72380	72385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.