MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 1665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	AAAAC	2	10	2683	2692	80 %	0 %	0 %	20 %	386320390
2	NC_017569	AAAAT	2	10	6645	6654	80 %	20 %	0 %	0 %	386320394
3	NC_017569	CTTTA	2	10	7071	7080	20 %	60 %	0 %	20 %	386320394
4	NC_017569	AAATA	2	10	8516	8525	80 %	20 %	0 %	0 %	386320395
5	NC_017569	ACAGG	2	10	8963	8972	40 %	0 %	40 %	20 %	386320396
6	NC_017569	CTTAA	2	10	10794	10803	40 %	40 %	0 %	20 %	386320397
7	NC_017569	CTACT	2	10	14423	14432	20 %	40 %	0 %	40 %	386320401
8	NC_017569	TTAGC	2	10	14936	14945	20 %	40 %	20 %	20 %	386320402
9	NC_017569	TTTAA	2	10	17187	17196	40 %	60 %	0 %	0 %	386320404
10	NC_017569	ACAAG	2	10	18306	18315	60 %	0 %	20 %	20 %	386320405
11	NC_017569	AAACA	2	10	19364	19373	80 %	0 %	0 %	20 %	386320406
12	NC_017569	CTATG	2	10	19921	19930	20 %	40 %	20 %	20 %	386320407
13	NC_017569	AAAGA	2	10	20394	20403	80 %	0 %	20 %	0 %	386320407
14	NC_017569	GAAAG	2	10	21101	21110	60 %	0 %	40 %	0 %	386320408
15	NC_017569	ACGCC	2	10	21267	21276	20 %	0 %	20 %	60 %	386320408
16	NC_017569	CCAAA	2	10	21962	21971	60 %	0 %	0 %	40 %	386320409
17	NC_017569	TTCTT	2	10	25174	25183	0 %	80 %	0 %	20 %	386320414
18	NC_017569	TATTT	2	10	25284	25293	20 %	80 %	0 %	0 %	386320414
19	NC_017569	AAATA	2	10	27128	27137	80 %	20 %	0 %	0 %	386320416
20	NC_017569	AACCA	2	10	27143	27152	60 %	0 %	0 %	40 %	386320416
21	NC_017569	GAAAT	2	10	29064	29073	60 %	20 %	20 %	0 %	386320418
22	NC_017569	TCTAC	2	10	30742	30751	20 %	40 %	0 %	40 %	386320421
23	NC_017569	GCATT	2	10	31334	31343	20 %	40 %	20 %	20 %	386320421
24	NC_017569	CATAG	2	10	31719	31728	40 %	20 %	20 %	20 %	386320421
25	NC_017569	CATTG	2	10	33291	33300	20 %	40 %	20 %	20 %	386320421
26	NC_017569	TAAGG	2	10	35683	35692	40 %	20 %	40 %	0 %	386320423
27	NC_017569	AAATT	2	10	38742	38751	60 %	40 %	0 %	0 %	386320425
28	NC_017569	AACCT	2	10	38913	38922	40 %	20 %	0 %	40 %	386320425
29	NC_017569	TCTTT	2	10	39000	39009	0 %	80 %	0 %	20 %	386320425
30	NC_017569	ATTTT	2	10	39779	39788	20 %	80 %	0 %	0 %	386320426
31	NC_017569	CGGAA	2	10	40693	40702	40 %	0 %	40 %	20 %	386320426
32	NC_017569	AAAAT	2	10	41199	41208	80 %	20 %	0 %	0 %	386320427
33	NC_017569	TTAAT	2	10	42045	42054	40 %	60 %	0 %	0 %	386320428
34	NC_017569	CAGGT	2	10	46430	46439	20 %	20 %	40 %	20 %	386320430
35	NC_017569	TTTAT	2	10	47904	47913	20 %	80 %	0 %	0 %	386320430
36	NC_017569	TTCTT	2	10	51778	51787	0 %	80 %	0 %	20 %	386320433
37	NC_017569	TTATG	2	10	52126	52135	20 %	60 %	20 %	0 %	386320433
38	NC_017569	CATTA	2	10	53424	53433	40 %	40 %	0 %	20 %	386320436
39	NC_017569	TGGAA	2	10	53440	53449	40 %	20 %	40 %	0 %	386320436
40	NC_017569	TCTTT	2	10	53786	53795	0 %	80 %	0 %	20 %	386320436
41	NC_017569	AAAAT	2	10	54721	54730	80 %	20 %	0 %	0 %	386320437
42	NC_017569	ACTCA	2	10	57454	57463	40 %	20 %	0 %	40 %	386320438
43	NC_017569	AACTG	2	10	57602	57611	40 %	20 %	20 %	20 %	386320438
44	NC_017569	AATTA	2	10	57952	57961	60 %	40 %	0 %	0 %	386320438
45	NC_017569	CTTTT	2	10	59891	59900	0 %	80 %	0 %	20 %	386320441
46	NC_017569	TTTAT	2	10	60181	60190	20 %	80 %	0 %	0 %	386320441
47	NC_017569	TTACC	2	10	61917	61926	20 %	40 %	0 %	40 %	386320442
48	NC_017569	TTGCT	2	10	62115	62124	0 %	60 %	20 %	20 %	386320443
49	NC_017569	ATAAA	2	10	62339	62348	80 %	20 %	0 %	0 %	386320443
50	NC_017569	ATGGT	2	10	62615	62624	20 %	40 %	40 %	0 %	386320443
51	NC_017569	ACGAA	2	10	63652	63661	60 %	0 %	20 %	20 %	386320444
52	NC_017569	TTTTG	2	10	66199	66208	0 %	80 %	20 %	0 %	386320448
53	NC_017569	GTATT	2	10	66974	66983	20 %	60 %	20 %	0 %	386320448
54	NC_017569	TCATT	2	10	68485	68494	20 %	60 %	0 %	20 %	386320450
55	NC_017569	TCGTT	2	10	68961	68970	0 %	60 %	20 %	20 %	386320451
56	NC_017569	TAAAG	2	10	70924	70933	60 %	20 %	20 %	0 %	386320453
57	NC_017569	AGAAT	2	10	71493	71502	60 %	20 %	20 %	0 %	386320455
58	NC_017569	TTCCG	2	10	75150	75159	0 %	40 %	20 %	40 %	386320459
59	NC_017569	CCTGT	2	10	75608	75617	0 %	40 %	20 %	40 %	386320460
60	NC_017569	GCATT	2	10	76580	76589	20 %	40 %	20 %	20 %	386320460
61	NC_017569	TCTAT	2	10	76606	76615	20 %	60 %	0 %	20 %	386320460
62	NC_017569	TGCCT	2	10	76707	76716	0 %	40 %	20 %	40 %	386320460
63	NC_017569	CTATT	2	10	78592	78601	20 %	60 %	0 %	20 %	386320461
64	NC_017569	TAAAA	2	10	81641	81650	80 %	20 %	0 %	0 %	386320464
65	NC_017569	AGATA	2	10	81794	81803	60 %	20 %	20 %	0 %	386320464
66	NC_017569	TTAAT	2	10	82471	82480	40 %	60 %	0 %	0 %	386320465
67	NC_017569	TCTGG	2	10	83718	83727	0 %	40 %	40 %	20 %	386320466
68	NC_017569	CTTAT	2	10	84019	84028	20 %	60 %	0 %	20 %	386320467
69	NC_017569	AAACA	2	10	84355	84364	80 %	0 %	0 %	20 %	386320467
70	NC_017569	AACCT	2	10	85019	85028	40 %	20 %	0 %	40 %	386320467
71	NC_017569	TTACT	2	10	86197	86206	20 %	60 %	0 %	20 %	386320469
72	NC_017569	ATATC	2	10	86305	86314	40 %	40 %	0 %	20 %	386320469
73	NC_017569	TTTTA	2	10	87950	87959	20 %	80 %	0 %	0 %	386320471
74	NC_017569	ATAAA	2	10	90342	90351	80 %	20 %	0 %	0 %	386320474
75	NC_017569	ATATG	2	10	90536	90545	40 %	40 %	20 %	0 %	386320474
76	NC_017569	GAATC	2	10	93133	93142	40 %	20 %	20 %	20 %	386320477
77	NC_017569	TACCC	2	10	95060	95069	20 %	20 %	0 %	60 %	386320478
78	NC_017569	TTTTA	2	10	100061	100070	20 %	80 %	0 %	0 %	386320480
79	NC_017569	TTTAT	2	10	101710	101719	20 %	80 %	0 %	0 %	386320482
80	NC_017569	ACAAA	2	10	102225	102234	80 %	0 %	0 %	20 %	386320482
81	NC_017569	CTATG	2	10	104635	104644	20 %	40 %	20 %	20 %	386320484
82	NC_017569	TGGAT	2	10	104860	104869	20 %	40 %	40 %	0 %	386320484
83	NC_017569	ACCAA	2	10	114767	114776	60 %	0 %	0 %	40 %	386320490
84	NC_017569	TTTCT	2	10	115923	115932	0 %	80 %	0 %	20 %	386320490
85	NC_017569	CTTTC	2	10	116998	117007	0 %	60 %	0 %	40 %	386320491
86	NC_017569	TAGTA	2	10	118911	118920	40 %	40 %	20 %	0 %	386320492
87	NC_017569	TTTTC	2	10	119112	119121	0 %	80 %	0 %	20 %	386320492
88	NC_017569	GAAAT	2	10	119248	119257	60 %	20 %	20 %	0 %	386320492
89	NC_017569	AATAT	2	10	120729	120738	60 %	40 %	0 %	0 %	386320493
90	NC_017569	ACTAC	2	10	121079	121088	40 %	20 %	0 %	40 %	386320493
91	NC_017569	GATGT	2	10	122232	122241	20 %	40 %	40 %	0 %	386320494
92	NC_017569	CTTTT	2	10	125096	125105	0 %	80 %	0 %	20 %	386320497
93	NC_017569	ATAAG	2	10	125460	125469	60 %	20 %	20 %	0 %	386320498
94	NC_017569	TGTAT	2	10	125965	125974	20 %	60 %	20 %	0 %	386320499
95	NC_017569	AGTAA	2	10	126511	126520	60 %	20 %	20 %	0 %	386320500
96	NC_017569	TATTT	2	10	126583	126592	20 %	80 %	0 %	0 %	386320500
97	NC_017569	ATAAA	2	10	126729	126738	80 %	20 %	0 %	0 %	386320500
98	NC_017569	GTTTT	2	10	128820	128829	0 %	80 %	20 %	0 %	386320502
99	NC_017569	GAAAA	2	10	129893	129902	80 %	0 %	20 %	0 %	386320503
100	NC_017569	AGAAA	2	10	132650	132659	80 %	0 %	20 %	0 %	386320507
101	NC_017569	AATTT	2	10	133920	133929	40 %	60 %	0 %	0 %	386320507
102	NC_017569	GATTT	2	10	134071	134080	20 %	60 %	20 %	0 %	386320507
103	NC_017569	TATAA	2	10	134862	134871	60 %	40 %	0 %	0 %	386320507
104	NC_017569	ATTAT	2	10	135142	135151	40 %	60 %	0 %	0 %	386320507
105	NC_017569	CCTAG	2	10	135654	135663	20 %	20 %	20 %	40 %	386320507
106	NC_017569	TTCTA	2	10	136754	136763	20 %	60 %	0 %	20 %	386320507
107	NC_017569	CAGAA	2	10	137814	137823	60 %	0 %	20 %	20 %	386320508
108	NC_017569	TGATA	2	10	141629	141638	40 %	40 %	20 %	0 %	386320514
109	NC_017569	GCCCT	2	10	141995	142004	0 %	20 %	20 %	60 %	386320514
110	NC_017569	CTATC	2	10	143211	143220	20 %	40 %	0 %	40 %	386320516
111	NC_017569	CCATT	2	10	144176	144185	20 %	40 %	0 %	40 %	386320516
112	NC_017569	TTACT	2	10	146790	146799	20 %	60 %	0 %	20 %	386320517
113	NC_017569	AAGAA	2	10	147708	147717	80 %	0 %	20 %	0 %	386320517
114	NC_017569	GTTTG	2	10	148018	148027	0 %	60 %	40 %	0 %	386320517
115	NC_017569	AATAC	2	10	149775	149784	60 %	20 %	0 %	20 %	386320521
116	NC_017569	AAACT	2	10	150334	150343	60 %	20 %	0 %	20 %	386320521
117	NC_017569	TCCAA	2	10	150956	150965	40 %	20 %	0 %	40 %	386320522
118	NC_017569	TTACT	2	10	151627	151636	20 %	60 %	0 %	20 %	386320523
119	NC_017569	CAAGA	2	10	152365	152374	60 %	0 %	20 %	20 %	386320524
120	NC_017569	TAAAA	2	10	152587	152596	80 %	20 %	0 %	0 %	386320525
121	NC_017569	TGATT	2	10	152851	152860	20 %	60 %	20 %	0 %	386320525
122	NC_017569	ATTTT	2	10	154212	154221	20 %	80 %	0 %	0 %	386320527
123	NC_017569	ATTAA	2	10	154399	154408	60 %	40 %	0 %	0 %	386320527
124	NC_017569	TCCAA	2	10	155973	155982	40 %	20 %	0 %	40 %	386320529
125	NC_017569	AAATA	2	10	156396	156405	80 %	20 %	0 %	0 %	386320530
126	NC_017569	CCCCT	2	10	158478	158487	0 %	20 %	0 %	80 %	386320533
127	NC_017569	AAGAG	2	10	159771	159780	60 %	0 %	40 %	0 %	386320535
128	NC_017569	TTACC	2	10	161888	161897	20 %	40 %	0 %	40 %	386320541
129	NC_017569	TAAGA	2	10	162711	162720	60 %	20 %	20 %	0 %	386320543
130	NC_017569	ACTAA	2	10	163230	163239	60 %	20 %	0 %	20 %	386320544
131	NC_017569	ACAAA	2	10	163351	163360	80 %	0 %	0 %	20 %	386320544
132	NC_017569	TTTTA	2	10	164006	164015	20 %	80 %	0 %	0 %	386320545
133	NC_017569	ACCAA	2	10	164947	164956	60 %	0 %	0 %	40 %	386320547
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135	NC_017569	AAAAT	2	10	168092	168101	80 %	20 %	0 %	0 %	386320555
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