MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 5583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	TATT	2	8	822	829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017569	AAAG	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017569	TTTA	2	8	1013	1020	25 %	75 %	0 %	0 %	386320388
4	NC_017569	CATT	2	8	1408	1415	25 %	50 %	0 %	25 %	386320388
5	NC_017569	TAGC	2	8	2601	2608	25 %	25 %	25 %	25 %	386320390
6	NC_017569	GATT	2	8	3109	3116	25 %	50 %	25 %	0 %	386320391
7	NC_017569	TAAA	2	8	3150	3157	75 %	25 %	0 %	0 %	386320391
8	NC_017569	ATAA	2	8	3380	3387	75 %	25 %	0 %	0 %	386320391
9	NC_017569	AAGT	2	8	3406	3413	50 %	25 %	25 %	0 %	386320391
10	NC_017569	ATAG	2	8	3659	3666	50 %	25 %	25 %	0 %	386320391
11	NC_017569	CGTC	2	8	4065	4072	0 %	25 %	25 %	50 %	386320392
12	NC_017569	CCTT	2	8	4454	4461	0 %	50 %	0 %	50 %	386320392
13	NC_017569	CTGT	2	8	4804	4811	0 %	50 %	25 %	25 %	386320392
14	NC_017569	AAGA	2	8	5090	5097	75 %	0 %	25 %	0 %	386320393
15	NC_017569	TGGT	2	8	5138	5145	0 %	50 %	50 %	0 %	386320393
16	NC_017569	TTCT	2	8	5646	5653	0 %	75 %	0 %	25 %	386320394
17	NC_017569	GTTG	2	8	5901	5908	0 %	50 %	50 %	0 %	386320394
18	NC_017569	GTTG	2	8	7111	7118	0 %	50 %	50 %	0 %	386320394
19	NC_017569	AGCT	2	8	7452	7459	25 %	25 %	25 %	25 %	386320394
20	NC_017569	TGAT	2	8	8603	8610	25 %	50 %	25 %	0 %	386320395
21	NC_017569	AAGG	2	8	9335	9342	50 %	0 %	50 %	0 %	386320396
22	NC_017569	TTTC	2	8	9413	9420	0 %	75 %	0 %	25 %	386320396
23	NC_017569	TTTA	2	8	9896	9903	25 %	75 %	0 %	0 %	386320397
24	NC_017569	ATCT	2	8	10813	10820	25 %	50 %	0 %	25 %	386320397
25	NC_017569	CTTT	2	8	10948	10955	0 %	75 %	0 %	25 %	386320397
26	NC_017569	ATAG	2	8	11006	11013	50 %	25 %	25 %	0 %	386320397
27	NC_017569	TTTA	2	8	11023	11030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017569	AATT	2	8	11073	11080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017569	ATTG	2	8	11092	11099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017569	ATTT	2	8	11149	11156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017569	CAAA	2	8	11366	11373	75 %	0 %	0 %	25 %	386320398
32	NC_017569	ATAA	2	8	12034	12041	75 %	25 %	0 %	0 %	386320398
33	NC_017569	CAAT	2	8	12056	12063	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017569	ACAA	2	8	12120	12127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017569	TAGA	2	8	12491	12498	50 %	25 %	25 %	0 %	386320399
36	NC_017569	ACTT	2	8	12606	12613	25 %	50 %	0 %	25 %	386320399
37	NC_017569	CCAA	2	8	12773	12780	50 %	0 %	0 %	50 %	386320399
38	NC_017569	ATAC	2	8	12918	12925	50 %	25 %	0 %	25 %	386320399
39	NC_017569	ACTT	2	8	13167	13174	25 %	50 %	0 %	25 %	386320400
40	NC_017569	AAAG	2	8	13488	13495	75 %	0 %	25 %	0 %	386320400
41	NC_017569	GGTA	2	8	14148	14155	25 %	25 %	50 %	0 %	386320401
42	NC_017569	AGAA	2	8	14733	14740	75 %	0 %	25 %	0 %	386320402
43	NC_017569	ATTT	2	8	14816	14823	25 %	75 %	0 %	0 %	386320402
44	NC_017569	GCAA	2	8	15161	15168	50 %	0 %	25 %	25 %	386320402
45	NC_017569	AATA	2	8	15200	15207	75 %	25 %	0 %	0 %	386320402
46	NC_017569	TTCT	2	8	15274	15281	0 %	75 %	0 %	25 %	386320403
47	NC_017569	TCTA	2	8	15586	15593	25 %	50 %	0 %	25 %	386320403
48	NC_017569	TCTT	2	8	15624	15631	0 %	75 %	0 %	25 %	386320403
49	NC_017569	ATAC	2	8	15669	15676	50 %	25 %	0 %	25 %	386320403
50	NC_017569	TTGT	2	8	15744	15751	0 %	75 %	25 %	0 %	386320403
51	NC_017569	CAAT	2	8	16363	16370	50 %	25 %	0 %	25 %	386320403
52	NC_017569	ATCA	2	8	16434	16441	50 %	25 %	0 %	25 %	386320403
53	NC_017569	CCTC	2	8	16871	16878	0 %	25 %	0 %	75 %	386320404
54	NC_017569	AAAC	2	8	16947	16954	75 %	0 %	0 %	25 %	386320404
55	NC_017569	GAAA	2	8	17264	17271	75 %	0 %	25 %	0 %	386320404
56	NC_017569	AAAC	2	8	19954	19961	75 %	0 %	0 %	25 %	386320407
57	NC_017569	ATCA	2	8	20407	20414	50 %	25 %	0 %	25 %	386320407
58	NC_017569	AAAC	2	8	20634	20641	75 %	0 %	0 %	25 %	386320408
59	NC_017569	TTAA	2	8	21415	21422	50 %	50 %	0 %	0 %	386320408
60	NC_017569	AAGT	2	8	22264	22271	50 %	25 %	25 %	0 %	386320409
61	NC_017569	ATTA	2	8	22366	22373	50 %	50 %	0 %	0 %	386320410
62	NC_017569	CTTC	2	8	22552	22559	0 %	50 %	0 %	50 %	386320410
63	NC_017569	AAGA	2	8	22758	22765	75 %	0 %	25 %	0 %	386320410
64	NC_017569	TATT	2	8	22883	22890	25 %	75 %	0 %	0 %	386320411
65	NC_017569	GTAT	2	8	23146	23153	25 %	50 %	25 %	0 %	386320411
66	NC_017569	CGAT	2	8	23193	23200	25 %	25 %	25 %	25 %	386320411
67	NC_017569	TTTA	2	8	23716	23723	25 %	75 %	0 %	0 %	386320412
68	NC_017569	AATA	2	8	23845	23852	75 %	25 %	0 %	0 %	386320412
69	NC_017569	TTTA	2	8	23872	23879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017569	TTAC	2	8	24313	24320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017569	CAAC	2	8	24548	24555	50 %	0 %	0 %	50 %	386320413
72	NC_017569	TTTG	2	8	24656	24663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017569	AAAT	2	8	25377	25384	75 %	25 %	0 %	0 %	386320414
74	NC_017569	TATT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	386320414
75	NC_017569	ATTC	2	8	26286	26293	25 %	50 %	0 %	25 %	386320414
76	NC_017569	AAAG	2	8	26331	26338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017569	TTCT	2	8	26375	26382	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
78	NC_017569	TCTT	2	8	26485	26492	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
79	NC_017569	TCTG	2	8	26692	26699	0 %	50 %	25 %	25 %	386320415
80	NC_017569	TTTA	2	8	27864	27871	25 %	75 %	0 %	0 %	386320417
81	NC_017569	GATA	2	8	28236	28243	50 %	25 %	25 %	0 %	386320417
82	NC_017569	AAAG	2	8	28249	28256	75 %	0 %	25 %	0 %	386320417
83	NC_017569	TGAT	2	8	28573	28580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017569	TTTG	2	8	28826	28833	0 %	75 %	25 %	0 %	386320418
85	NC_017569	TTAC	2	8	28977	28984	25 %	50 %	0 %	25 %	386320418
86	NC_017569	ATGC	2	8	29267	29274	25 %	25 %	25 %	25 %	386320418
87	NC_017569	ACCT	2	8	29601	29608	25 %	25 %	0 %	50 %	386320419
88	NC_017569	ACCA	2	8	29654	29661	50 %	0 %	0 %	50 %	386320419
89	NC_017569	ATAG	2	8	29942	29949	50 %	25 %	25 %	0 %	386320420
90	NC_017569	TTTC	2	8	30200	30207	0 %	75 %	0 %	25 %	386320421
91	NC_017569	CTTT	2	8	31225	31232	0 %	75 %	0 %	25 %	386320421
92	NC_017569	GGAA	2	8	31873	31880	50 %	0 %	50 %	0 %	386320421
93	NC_017569	TATC	2	8	31949	31956	25 %	50 %	0 %	25 %	386320421
94	NC_017569	GATT	2	8	32117	32124	25 %	50 %	25 %	0 %	386320421
95	NC_017569	CATA	2	8	32270	32277	50 %	25 %	0 %	25 %	386320421
96	NC_017569	ATAG	2	8	32650	32657	50 %	25 %	25 %	0 %	386320421
97	NC_017569	GCGT	2	8	33385	33392	0 %	25 %	50 %	25 %	386320421
98	NC_017569	TAGA	2	8	33461	33468	50 %	25 %	25 %	0 %	386320421
99	NC_017569	ATTT	2	8	33778	33785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017569	AACC	2	8	33811	33818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017569	ATTT	2	8	33874	33881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017569	AAAC	3	12	34121	34132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017569	TTAT	2	8	34192	34199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017569	TTAC	2	8	34211	34218	25 %	50 %	0 %	25 %	386320422
105	NC_017569	AGTA	2	8	34419	34426	50 %	25 %	25 %	0 %	386320422
106	NC_017569	CACT	2	8	35036	35043	25 %	25 %	0 %	50 %	386320422
107	NC_017569	TGAT	2	8	35493	35500	25 %	50 %	25 %	0 %	386320423
108	NC_017569	TGTA	2	8	36515	36522	25 %	50 %	25 %	0 %	386320424
109	NC_017569	TTTC	2	8	36578	36585	0 %	75 %	0 %	25 %	386320424
110	NC_017569	AAAG	2	8	36772	36779	75 %	0 %	25 %	0 %	386320424
111	NC_017569	GATA	2	8	37056	37063	50 %	25 %	25 %	0 %	386320424
112	NC_017569	AGAA	2	8	37235	37242	75 %	0 %	25 %	0 %	386320424
113	NC_017569	TGAA	2	8	37259	37266	50 %	25 %	25 %	0 %	386320424
114	NC_017569	ACCA	2	8	37500	37507	50 %	0 %	0 %	50 %	386320424
115	NC_017569	AAGA	2	8	37815	37822	75 %	0 %	25 %	0 %	386320424
116	NC_017569	CAAA	2	8	38048	38055	75 %	0 %	0 %	25 %	386320424
117	NC_017569	AGAT	2	8	38096	38103	50 %	25 %	25 %	0 %	386320424
118	NC_017569	TTAA	2	8	38816	38823	50 %	50 %	0 %	0 %	386320425
119	NC_017569	ATCT	2	8	38961	38968	25 %	50 %	0 %	25 %	386320425
120	NC_017569	GAAA	2	8	38969	38976	75 %	0 %	25 %	0 %	386320425
121	NC_017569	ATTT	2	8	39156	39163	25 %	75 %	0 %	0 %	386320425
122	NC_017569	ATTT	2	8	39461	39468	25 %	75 %	0 %	0 %	386320426
123	NC_017569	TTCT	2	8	39561	39568	0 %	75 %	0 %	25 %	386320426
124	NC_017569	TGGT	2	8	39692	39699	0 %	50 %	50 %	0 %	386320426
125	NC_017569	CCTA	2	8	39748	39755	25 %	25 %	0 %	50 %	386320426
126	NC_017569	CAAA	2	8	39990	39997	75 %	0 %	0 %	25 %	386320426
127	NC_017569	TATC	2	8	40029	40036	25 %	50 %	0 %	25 %	386320426
128	NC_017569	CATC	2	8	40422	40429	25 %	25 %	0 %	50 %	386320426
129	NC_017569	GATT	2	8	40869	40876	25 %	50 %	25 %	0 %	386320426
130	NC_017569	CTTG	2	8	41045	41052	0 %	50 %	25 %	25 %	386320426
131	NC_017569	TATC	2	8	41219	41226	25 %	50 %	0 %	25 %	386320427
132	NC_017569	AACA	2	8	41346	41353	75 %	0 %	0 %	25 %	386320427
133	NC_017569	GTTT	2	8	42299	42306	0 %	75 %	25 %	0 %	386320428
134	NC_017569	TACA	2	8	42455	42462	50 %	25 %	0 %	25 %	386320429
135	NC_017569	TACT	2	8	42526	42533	25 %	50 %	0 %	25 %	386320429
136	NC_017569	CATA	2	8	42742	42749	50 %	25 %	0 %	25 %	386320429
137	NC_017569	TACC	2	8	43535	43542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017569	TGAT	2	8	43950	43957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017569	CGAA	2	8	44031	44038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017569	AGTA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017569	AATC	2	8	44096	44103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017569	CCTT	2	8	44128	44135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017569	TGAT	2	8	44592	44599	25 %	50 %	25 %	0 %	386320430
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