MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 25134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	GTT	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320387
2	NC_017569	TTG	2	6	618	623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320387
3	NC_017569	CCG	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320387
4	NC_017569	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320387
5	NC_017569	CAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320387
6	NC_017569	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
7	NC_017569	AAT	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320388
8	NC_017569	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
9	NC_017569	CCA	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320388
10	NC_017569	ATT	2	6	1079	1084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
11	NC_017569	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320388
12	NC_017569	AAG	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320388
13	NC_017569	CAT	3	9	1306	1314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
14	NC_017569	CAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
15	NC_017569	CTA	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
16	NC_017569	TCT	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320389
17	NC_017569	ATC	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
18	NC_017569	CTT	2	6	1640	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320389
19	NC_017569	TAT	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320389
20	NC_017569	CCA	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320389
21	NC_017569	TCA	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
22	NC_017569	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320389
23	NC_017569	GTC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320389
24	NC_017569	ATC	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
25	NC_017569	TTA	2	6	2407	2412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320390
26	NC_017569	AAT	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320390
27	NC_017569	ATA	2	6	2429	2434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320390
28	NC_017569	AAG	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320390
29	NC_017569	AGC	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320390
30	NC_017569	CTG	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320390
31	NC_017569	CAT	3	9	2738	2746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320390
32	NC_017569	CCT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320390
33	NC_017569	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320391
34	NC_017569	CAT	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320391
35	NC_017569	GTT	2	6	3130	3135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320391
36	NC_017569	TGA	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320391
37	NC_017569	TTA	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320391
38	NC_017569	CAT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320391
39	NC_017569	TAA	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320391
40	NC_017569	TTC	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320391
41	NC_017569	AAT	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320391
42	NC_017569	AAG	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320392
43	NC_017569	TAG	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320392
44	NC_017569	TAA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
45	NC_017569	AAT	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
46	NC_017569	CAT	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320392
47	NC_017569	TAA	2	6	4331	4336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
48	NC_017569	TTC	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
49	NC_017569	TTC	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
50	NC_017569	AAG	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320392
51	NC_017569	ATT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320392
52	NC_017569	CAT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320392
53	NC_017569	AGT	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320392
54	NC_017569	TCT	2	6	4904	4909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
55	NC_017569	ATT	2	6	5018	5023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320392
56	NC_017569	GAA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320393
57	NC_017569	ACA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320393
58	NC_017569	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320393
59	NC_017569	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320393
60	NC_017569	AAC	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320393
61	NC_017569	ATT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320393
62	NC_017569	TAT	3	9	5602	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
63	NC_017569	TCT	2	6	5726	5731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320394
64	NC_017569	TAT	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
65	NC_017569	GTG	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320394
66	NC_017569	TTA	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
67	NC_017569	TTA	2	6	6078	6083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
68	NC_017569	TTC	2	6	6178	6183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320394
69	NC_017569	AGA	2	6	6232	6237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
70	NC_017569	TAA	2	6	6244	6249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320394
71	NC_017569	TAT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
72	NC_017569	CTA	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
73	NC_017569	ATA	2	6	6306	6311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320394
74	NC_017569	ATG	3	9	6438	6446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320394
75	NC_017569	ACT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
76	NC_017569	GAA	2	6	6605	6610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
77	NC_017569	AGA	2	6	6625	6630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
78	NC_017569	AGA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
79	NC_017569	GAT	2	6	6782	6787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320394
80	NC_017569	TAT	2	6	6820	6825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
81	NC_017569	CCT	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320394
82	NC_017569	GAG	2	6	7190	7195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320394
83	NC_017569	ACA	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320394
84	NC_017569	GTA	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320394
85	NC_017569	TTA	2	6	7401	7406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
86	NC_017569	ATT	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
87	NC_017569	TCA	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
88	NC_017569	TAG	2	6	7789	7794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320394
89	NC_017569	GAA	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
90	NC_017569	GCA	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320394
91	NC_017569	CAT	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
92	NC_017569	CTT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320395
93	NC_017569	AAT	2	6	8289	8294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320395
94	NC_017569	TGA	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320395
95	NC_017569	CAA	2	6	8373	8378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320395
96	NC_017569	ACA	2	6	8383	8388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320395
97	NC_017569	TAA	2	6	8486	8491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320395
98	NC_017569	AAC	2	6	8573	8578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320395
99	NC_017569	TAA	2	6	8661	8666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320395
100	NC_017569	CAT	2	6	8685	8690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320395
101	NC_017569	TCC	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320396
102	NC_017569	GTT	2	6	8892	8897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320396
103	NC_017569	GTA	2	6	9052	9057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320396
104	NC_017569	TTA	2	6	9082	9087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320396
105	NC_017569	TAG	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320396
106	NC_017569	CAG	2	6	9136	9141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320396
107	NC_017569	CAA	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320396
108	NC_017569	TGA	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320396
109	NC_017569	AGG	2	6	9251	9256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320396
110	NC_017569	ACC	2	6	9277	9282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320396
111	NC_017569	CAA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320396
112	NC_017569	GCT	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320396
113	NC_017569	TTC	2	6	9770	9775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320397
114	NC_017569	GCA	2	6	9816	9821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320397
115	NC_017569	CAT	2	6	9890	9895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320397
116	NC_017569	TAA	2	6	9911	9916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320397
117	NC_017569	CAT	3	9	10079	10087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320397
118	NC_017569	AAG	2	6	10093	10098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320397
119	NC_017569	CAA	2	6	10116	10121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320397
120	NC_017569	TAT	2	6	10124	10129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320397
121	NC_017569	AAC	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320397
122	NC_017569	TAG	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320397
123	NC_017569	AGA	3	9	10322	10330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320397
124	NC_017569	ATA	2	6	10420	10425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320397
125	NC_017569	AAT	2	6	10449	10454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320397
126	NC_017569	ATT	2	6	10465	10470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320397
127	NC_017569	GAA	2	6	10532	10537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320397
128	NC_017569	AAC	2	6	10630	10635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320397
129	NC_017569	GAT	2	6	10643	10648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320397
130	NC_017569	CAG	2	6	10656	10661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320397
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255	NC_017569	AAC	2	6	19172	19177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320405
256	NC_017569	ATA	2	6	19199	19204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320405
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259	NC_017569	TTA	2	6	19472	19477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320406
260	NC_017569	AAG	2	6	19546	19551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320406
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