MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	AACCGG	2	12	670	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017565	TATGTT	2	12	16536	16547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017565	CAGGCG	2	12	17080	17091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386307354
4	NC_017565	CAATTG	2	12	17416	17427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386307354
5	NC_017565	CGATTA	2	12	18357	18368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017565	CAGAAC	2	12	22831	22842	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386307360
7	NC_017565	ATTTTG	2	12	26758	26769	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386307369
8	NC_017565	GACATC	2	12	28439	28450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386307373
9	NC_017565	GGCAGA	2	12	29800	29811	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386307374
10	NC_017565	ATAGAT	2	12	31587	31598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386307378
11	NC_017565	TGAATG	2	12	36271	36282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386307386
12	NC_017565	ATAACC	2	12	37132	37143	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017565	GCAAAA	2	12	39225	39236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386307390
14	NC_017565	AGTAAC	2	12	44588	44599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386307398
15	NC_017565	ACGTTA	2	12	44881	44892	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386307399
16	NC_017565	AACCAA	2	12	46382	46393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017565	ATTAGC	2	12	48267	48278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386307403
18	NC_017565	AGTTCT	2	12	51336	51347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386307408
19	NC_017565	GTTCTT	2	12	52644	52655	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386307409
20	NC_017565	GACACT	2	12	55845	55856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386307413
21	NC_017565	ATCTTG	2	12	57982	57993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386307416
22	NC_017565	GTTTAA	2	12	62321	62332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386307421
23	NC_017565	AAAGAA	2	12	63104	63115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386307422
24	NC_017565	TGTTAA	2	12	68827	68838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.