MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	CTTTT	2	10	169	178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017565	GAGCA	2	10	1163	1172	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017565	AGCCA	2	10	4783	4792	40 %	0 %	20 %	40 %	386307335
4	NC_017565	CATGG	2	10	5045	5054	20 %	20 %	40 %	20 %	386307335
5	NC_017565	AACAT	2	10	10844	10853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017565	GCTTG	2	10	12091	12100	0 %	40 %	40 %	20 %	386307342
7	NC_017565	GTCAG	2	10	14029	14038	20 %	20 %	40 %	20 %	386307348
8	NC_017565	TGAGG	2	10	16611	16620	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017565	GAATC	2	10	18027	18036	40 %	20 %	20 %	20 %	386307354
10	NC_017565	AAAAC	2	10	19505	19514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017565	TTTAT	2	10	19681	19690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017565	TCCCA	2	10	20307	20316	20 %	20 %	0 %	60 %	386307357
13	NC_017565	ACGTG	2	10	22180	22189	20 %	20 %	40 %	20 %	386307359
14	NC_017565	AAGCC	2	10	23015	23024	40 %	0 %	20 %	40 %	386307360
15	NC_017565	CGATA	2	10	23059	23068	40 %	20 %	20 %	20 %	386307360
16	NC_017565	GCAGC	2	10	23286	23295	20 %	0 %	40 %	40 %	386307360
17	NC_017565	TTCCC	2	10	23702	23711	0 %	40 %	0 %	60 %	386307361
18	NC_017565	CTGAC	2	10	25436	25445	20 %	20 %	20 %	40 %	386307365
19	NC_017565	GATCC	2	10	27376	27385	20 %	20 %	20 %	40 %	386307371
20	NC_017565	CCAAA	2	10	28375	28384	60 %	0 %	0 %	40 %	386307373
21	NC_017565	AAAGC	2	10	34166	34175	60 %	0 %	20 %	20 %	386307384
22	NC_017565	CTATA	2	10	36724	36733	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017565	CATTC	2	10	40782	40791	20 %	40 %	0 %	40 %	386307393
24	NC_017565	GCAAT	2	10	41023	41032	40 %	20 %	20 %	20 %	386307393
25	NC_017565	ATTCA	2	10	41756	41765	40 %	40 %	0 %	20 %	386307396
26	NC_017565	GGAAT	2	10	42199	42208	40 %	20 %	40 %	0 %	386307396
27	NC_017565	CCGTA	2	10	43147	43156	20 %	20 %	20 %	40 %	386307398
28	NC_017565	GAGAC	2	10	44308	44317	40 %	0 %	40 %	20 %	386307398
29	NC_017565	ACCAA	2	10	44364	44373	60 %	0 %	0 %	40 %	386307398
30	NC_017565	AGAAA	2	10	46768	46777	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017565	ATTTA	2	10	46938	46947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017565	GCTCT	2	10	48251	48260	0 %	40 %	20 %	40 %	386307403
33	NC_017565	AACAA	2	10	49153	49162	80 %	0 %	0 %	20 %	386307404
34	NC_017565	GTGAA	2	10	49462	49471	40 %	20 %	40 %	0 %	386307405
35	NC_017565	GATGC	2	10	57222	57231	20 %	20 %	40 %	20 %	386307416
36	NC_017565	GATGG	2	10	57495	57504	20 %	20 %	60 %	0 %	386307416
37	NC_017565	CCTGC	2	10	57516	57525	0 %	20 %	20 %	60 %	386307416
38	NC_017565	ACTCT	2	10	60750	60759	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017565	CGGCA	2	10	61360	61369	20 %	0 %	40 %	40 %	386307421
40	NC_017565	GGCAT	2	10	61601	61610	20 %	20 %	40 %	20 %	386307421
41	NC_017565	TTTTA	2	10	63301	63310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017565	TAAAA	2	10	63439	63448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017565	CTGAC	2	10	66942	66951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017565	GCATC	2	10	68308	68317	20 %	20 %	20 %	40 %	386307434
45	NC_017565	TCAGC	6	30	68725	68754	20 %	20 %	20 %	40 %	386307435
46	NC_017565	GGCGA	2	10	71320	71329	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017565	TGCGC	2	10	71827	71836	0 %	20 %	40 %	40 %	386307441

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.