MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	TAAA	2	8	186	193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	GCCC	2	8	235	242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017565	CTTT	2	8	1830	1837	0 %	75 %	0 %	25 %	386307332
4	NC_017565	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	386307332
5	NC_017565	ATTT	2	8	2340	2347	25 %	75 %	0 %	0 %	386307333
6	NC_017565	GGGT	2	8	2981	2988	0 %	25 %	75 %	0 %	386307333
7	NC_017565	GCGG	2	8	3616	3623	0 %	0 %	75 %	25 %	386307333
8	NC_017565	GATA	2	8	3953	3960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017565	GATG	2	8	5095	5102	25 %	25 %	50 %	0 %	386307335
10	NC_017565	ATCG	2	8	6064	6071	25 %	25 %	25 %	25 %	386307335
11	NC_017565	CTAT	2	8	6320	6327	25 %	50 %	0 %	25 %	386307335
12	NC_017565	AGAA	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017565	AATA	2	8	7229	7236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017565	CTGT	2	8	7291	7298	0 %	50 %	25 %	25 %	386307336
15	NC_017565	ATAA	2	8	7393	7400	75 %	25 %	0 %	0 %	386307336
16	NC_017565	GGAT	2	8	7520	7527	25 %	25 %	50 %	0 %	386307337
17	NC_017565	AATA	2	8	7596	7603	75 %	25 %	0 %	0 %	386307337
18	NC_017565	TTCT	2	8	8310	8317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017565	TGCC	2	8	8350	8357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017565	AAAG	2	8	8483	8490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017565	TGTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	25 %	0 %	386307338
22	NC_017565	CGAC	2	8	9725	9732	25 %	0 %	25 %	50 %	386307339
23	NC_017565	AACA	2	8	10414	10421	75 %	0 %	0 %	25 %	386307340
24	NC_017565	TATT	2	8	10480	10487	25 %	75 %	0 %	0 %	386307340
25	NC_017565	ACTC	2	8	10628	10635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017565	GGCG	2	8	11565	11572	0 %	0 %	75 %	25 %	386307341
27	NC_017565	CCAA	2	8	12221	12228	50 %	0 %	0 %	50 %	386307342
28	NC_017565	TTTG	2	8	12235	12242	0 %	75 %	25 %	0 %	386307342
29	NC_017565	AAGG	2	8	12267	12274	50 %	0 %	50 %	0 %	386307342
30	NC_017565	TTGG	2	8	12731	12738	0 %	50 %	50 %	0 %	386307344
31	NC_017565	AGTC	2	8	13281	13288	25 %	25 %	25 %	25 %	386307346
32	NC_017565	GGCT	2	8	13511	13518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017565	TTAT	2	8	14021	14028	25 %	75 %	0 %	0 %	386307348
34	NC_017565	GTTC	2	8	15225	15232	0 %	50 %	25 %	25 %	386307351
35	NC_017565	CAGC	2	8	15516	15523	25 %	0 %	25 %	50 %	386307351
36	NC_017565	TTCA	2	8	15776	15783	25 %	50 %	0 %	25 %	386307352
37	NC_017565	CGAC	2	8	16099	16106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017565	AATA	2	8	16503	16510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017565	TAAT	2	8	16832	16839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017565	TAAG	2	8	17224	17231	50 %	25 %	25 %	0 %	386307354
41	NC_017565	AAAG	2	8	17549	17556	75 %	0 %	25 %	0 %	386307354
42	NC_017565	GTAA	2	8	17997	18004	50 %	25 %	25 %	0 %	386307354
43	NC_017565	TGCA	2	8	18880	18887	25 %	25 %	25 %	25 %	386307355
44	NC_017565	ATTT	2	8	19047	19054	25 %	75 %	0 %	0 %	386307355
45	NC_017565	TGAT	2	8	19402	19409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017565	TCAT	2	8	19548	19555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017565	CCAT	2	8	19600	19607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017565	ATTG	2	8	19857	19864	25 %	50 %	25 %	0 %	386307356
49	NC_017565	CCTG	2	8	20547	20554	0 %	25 %	25 %	50 %	386307357
50	NC_017565	CAAC	2	8	20995	21002	50 %	0 %	0 %	50 %	386307357
51	NC_017565	ACCG	2	8	21100	21107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017565	AAGT	2	8	21139	21146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017565	CTGA	2	8	21660	21667	25 %	25 %	25 %	25 %	386307358
54	NC_017565	ACGG	2	8	22060	22067	25 %	0 %	50 %	25 %	386307359
55	NC_017565	ACAA	2	8	22283	22290	75 %	0 %	0 %	25 %	386307360
56	NC_017565	CAGG	2	8	22293	22300	25 %	0 %	50 %	25 %	386307360
57	NC_017565	GGCA	2	8	22885	22892	25 %	0 %	50 %	25 %	386307360
58	NC_017565	GCAG	2	8	23625	23632	25 %	0 %	50 %	25 %	386307361
59	NC_017565	ATAA	2	8	25446	25453	75 %	25 %	0 %	0 %	386307365
60	NC_017565	AGCC	2	8	25957	25964	25 %	0 %	25 %	50 %	386307366
61	NC_017565	GACT	2	8	26188	26195	25 %	25 %	25 %	25 %	386307367
62	NC_017565	CTCC	2	8	26743	26750	0 %	25 %	0 %	75 %	386307369
63	NC_017565	CAGC	2	8	26814	26821	25 %	0 %	25 %	50 %	386307369
64	NC_017565	ACTG	2	8	27305	27312	25 %	25 %	25 %	25 %	386307371
65	NC_017565	ACTG	2	8	27721	27728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017565	AAAG	2	8	27834	27841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017565	TCCA	2	8	28326	28333	25 %	25 %	0 %	50 %	386307373
68	NC_017565	ATGG	2	8	28466	28473	25 %	25 %	50 %	0 %	386307373
69	NC_017565	TTGA	2	8	28497	28504	25 %	50 %	25 %	0 %	386307373
70	NC_017565	AGTC	2	8	28765	28772	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
71	NC_017565	AGTC	2	8	29007	29014	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
72	NC_017565	TGGA	2	8	29019	29026	25 %	25 %	50 %	0 %	386307373
73	NC_017565	TGAC	2	8	29080	29087	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
74	NC_017565	AATT	2	8	29281	29288	50 %	50 %	0 %	0 %	386307374
75	NC_017565	GCTT	2	8	29353	29360	0 %	50 %	25 %	25 %	386307374
76	NC_017565	TGGT	2	8	29661	29668	0 %	50 %	50 %	0 %	386307374
77	NC_017565	TAAA	2	8	29925	29932	75 %	25 %	0 %	0 %	386307374
78	NC_017565	TTTC	2	8	30120	30127	0 %	75 %	0 %	25 %	386307374
79	NC_017565	TTTA	2	8	30250	30257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017565	GGCT	2	8	32253	32260	0 %	25 %	50 %	25 %	386307379
81	NC_017565	AAAT	2	8	32403	32410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017565	TATT	2	8	32428	32435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017565	CTTA	2	8	32802	32809	25 %	50 %	0 %	25 %	386307380
84	NC_017565	CAGC	2	8	34318	34325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017565	GAAT	2	8	34361	34368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017565	TTTA	2	8	35245	35252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017565	AATA	2	8	35261	35268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017565	TCAT	2	8	35420	35427	25 %	50 %	0 %	25 %	386307386
89	NC_017565	CATA	2	8	35532	35539	50 %	25 %	0 %	25 %	386307386
90	NC_017565	GTAA	2	8	36027	36034	50 %	25 %	25 %	0 %	386307386
91	NC_017565	TTAA	2	8	36692	36699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017565	TCAT	2	8	36931	36938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017565	ATCC	2	8	37032	37039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017565	CAGC	2	8	37065	37072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017565	TTAT	2	8	37755	37762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017565	ATTT	2	8	37788	37795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017565	ACCT	2	8	38025	38032	25 %	25 %	0 %	50 %	386307388
98	NC_017565	AGCG	2	8	38526	38533	25 %	0 %	50 %	25 %	386307388
99	NC_017565	AGCC	2	8	38732	38739	25 %	0 %	25 %	50 %	386307389
100	NC_017565	TCAC	2	8	39278	39285	25 %	25 %	0 %	50 %	386307390
101	NC_017565	CTTC	2	8	39819	39826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017565	CAGC	2	8	40053	40060	25 %	0 %	25 %	50 %	386307391
103	NC_017565	TTTA	2	8	40348	40355	25 %	75 %	0 %	0 %	386307392
104	NC_017565	ATAA	2	8	40365	40372	75 %	25 %	0 %	0 %	386307392
105	NC_017565	ATTT	2	8	40916	40923	25 %	75 %	0 %	0 %	386307393
106	NC_017565	TTTG	2	8	41278	41285	0 %	75 %	25 %	0 %	386307394
107	NC_017565	GAAT	2	8	42148	42155	50 %	25 %	25 %	0 %	386307396
108	NC_017565	AAAG	2	8	42435	42442	75 %	0 %	25 %	0 %	386307397
109	NC_017565	AGAA	2	8	42713	42720	75 %	0 %	25 %	0 %	386307397
110	NC_017565	ATCA	2	8	43519	43526	50 %	25 %	0 %	25 %	386307398
111	NC_017565	TCGC	2	8	44060	44067	0 %	25 %	25 %	50 %	386307398
112	NC_017565	GCCA	2	8	44226	44233	25 %	0 %	25 %	50 %	386307398
113	NC_017565	TATT	2	8	44729	44736	25 %	75 %	0 %	0 %	386307399
114	NC_017565	AAAT	2	8	45108	45115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017565	GACT	2	8	45550	45557	25 %	25 %	25 %	25 %	386307401
116	NC_017565	TCGC	2	8	45636	45643	0 %	25 %	25 %	50 %	386307401
117	NC_017565	GCAA	2	8	45847	45854	50 %	0 %	25 %	25 %	386307401
118	NC_017565	TGCG	2	8	46352	46359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017565	AGGT	2	8	46599	46606	25 %	25 %	50 %	0 %	386307402
120	NC_017565	CTTT	2	8	46990	46997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017565	GAAA	2	8	47001	47008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017565	CAAA	2	8	47035	47042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017565	GCTT	2	8	47731	47738	0 %	50 %	25 %	25 %	386307403
124	NC_017565	GATT	2	8	48073	48080	25 %	50 %	25 %	0 %	386307403
125	NC_017565	GGGT	2	8	48412	48419	0 %	25 %	75 %	0 %	386307403
126	NC_017565	CAAT	2	8	48978	48985	50 %	25 %	0 %	25 %	386307404
127	NC_017565	GGTT	2	8	49049	49056	0 %	50 %	50 %	0 %	386307404
128	NC_017565	ACTC	2	8	49695	49702	25 %	25 %	0 %	50 %	386307406
129	NC_017565	AGTG	2	8	50301	50308	25 %	25 %	50 %	0 %	386307407
130	NC_017565	ATTT	2	8	50429	50436	25 %	75 %	0 %	0 %	386307407
131	NC_017565	AAAG	2	8	50584	50591	75 %	0 %	25 %	0 %	386307407
132	NC_017565	TCAG	2	8	51555	51562	25 %	25 %	25 %	25 %	386307408
133	NC_017565	GCTG	2	8	51989	51996	0 %	25 %	50 %	25 %	386307408
134	NC_017565	CTGC	2	8	52986	52993	0 %	25 %	25 %	50 %	386307409
135	NC_017565	AAGC	2	8	52994	53001	50 %	0 %	25 %	25 %	386307409
136	NC_017565	AAGC	2	8	53849	53856	50 %	0 %	25 %	25 %	386307410
137	NC_017565	AAAG	2	8	53947	53954	75 %	0 %	25 %	0 %	386307410
138	NC_017565	CACC	2	8	54089	54096	25 %	0 %	0 %	75 %	386307410
139	NC_017565	GTAA	2	8	54239	54246	50 %	25 %	25 %	0 %	386307410
140	NC_017565	TGAG	2	8	54894	54901	25 %	25 %	50 %	0 %	386307411
141	NC_017565	TACC	2	8	55186	55193	25 %	25 %	0 %	50 %	386307411
142	NC_017565	GTGA	2	8	55397	55404	25 %	25 %	50 %	0 %	386307411
143	NC_017565	CGAT	2	8	55675	55682	25 %	25 %	25 %	25 %	386307412
144	NC_017565	TGAG	2	8	55711	55718	25 %	25 %	50 %	0 %	386307412
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188	NC_017565	AGTG	2	8	71188	71195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017565	TACC	2	8	71860	71867	25 %	25 %	0 %	50 %	386307441
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.