MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	CTTT	2	8	1830	1837	0 %	75 %	0 %	25 %	386307332
2	NC_017565	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	386307332
3	NC_017565	ATTT	2	8	2340	2347	25 %	75 %	0 %	0 %	386307333
4	NC_017565	GGGT	2	8	2981	2988	0 %	25 %	75 %	0 %	386307333
5	NC_017565	GCGG	2	8	3616	3623	0 %	0 %	75 %	25 %	386307333
6	NC_017565	GATG	2	8	5095	5102	25 %	25 %	50 %	0 %	386307335
7	NC_017565	ATCG	2	8	6064	6071	25 %	25 %	25 %	25 %	386307335
8	NC_017565	CTAT	2	8	6320	6327	25 %	50 %	0 %	25 %	386307335
9	NC_017565	CTGT	2	8	7291	7298	0 %	50 %	25 %	25 %	386307336
10	NC_017565	ATAA	2	8	7393	7400	75 %	25 %	0 %	0 %	386307336
11	NC_017565	GGAT	2	8	7520	7527	25 %	25 %	50 %	0 %	386307337
12	NC_017565	AATA	2	8	7596	7603	75 %	25 %	0 %	0 %	386307337
13	NC_017565	TGTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	25 %	0 %	386307338
14	NC_017565	CGAC	2	8	9725	9732	25 %	0 %	25 %	50 %	386307339
15	NC_017565	AACA	2	8	10414	10421	75 %	0 %	0 %	25 %	386307340
16	NC_017565	TATT	2	8	10480	10487	25 %	75 %	0 %	0 %	386307340
17	NC_017565	GGCG	2	8	11565	11572	0 %	0 %	75 %	25 %	386307341
18	NC_017565	CCAA	2	8	12221	12228	50 %	0 %	0 %	50 %	386307342
19	NC_017565	TTTG	2	8	12235	12242	0 %	75 %	25 %	0 %	386307342
20	NC_017565	AAGG	2	8	12267	12274	50 %	0 %	50 %	0 %	386307342
21	NC_017565	TTGG	2	8	12731	12738	0 %	50 %	50 %	0 %	386307344
22	NC_017565	AGTC	2	8	13281	13288	25 %	25 %	25 %	25 %	386307346
23	NC_017565	TTAT	2	8	14021	14028	25 %	75 %	0 %	0 %	386307348
24	NC_017565	GTTC	2	8	15225	15232	0 %	50 %	25 %	25 %	386307351
25	NC_017565	CAGC	2	8	15516	15523	25 %	0 %	25 %	50 %	386307351
26	NC_017565	TTCA	2	8	15776	15783	25 %	50 %	0 %	25 %	386307352
27	NC_017565	TAAG	2	8	17224	17231	50 %	25 %	25 %	0 %	386307354
28	NC_017565	AAAG	2	8	17549	17556	75 %	0 %	25 %	0 %	386307354
29	NC_017565	GTAA	2	8	17997	18004	50 %	25 %	25 %	0 %	386307354
30	NC_017565	TGCA	2	8	18880	18887	25 %	25 %	25 %	25 %	386307355
31	NC_017565	ATTT	2	8	19047	19054	25 %	75 %	0 %	0 %	386307355
32	NC_017565	ATTG	2	8	19857	19864	25 %	50 %	25 %	0 %	386307356
33	NC_017565	CCTG	2	8	20547	20554	0 %	25 %	25 %	50 %	386307357
34	NC_017565	CAAC	2	8	20995	21002	50 %	0 %	0 %	50 %	386307357
35	NC_017565	CTGA	2	8	21660	21667	25 %	25 %	25 %	25 %	386307358
36	NC_017565	ACGG	2	8	22060	22067	25 %	0 %	50 %	25 %	386307359
37	NC_017565	ACAA	2	8	22283	22290	75 %	0 %	0 %	25 %	386307360
38	NC_017565	CAGG	2	8	22293	22300	25 %	0 %	50 %	25 %	386307360
39	NC_017565	GGCA	2	8	22885	22892	25 %	0 %	50 %	25 %	386307360
40	NC_017565	GCAG	2	8	23625	23632	25 %	0 %	50 %	25 %	386307361
41	NC_017565	ATAA	2	8	25446	25453	75 %	25 %	0 %	0 %	386307365
42	NC_017565	AGCC	2	8	25957	25964	25 %	0 %	25 %	50 %	386307366
43	NC_017565	GACT	2	8	26188	26195	25 %	25 %	25 %	25 %	386307367
44	NC_017565	CTCC	2	8	26743	26750	0 %	25 %	0 %	75 %	386307369
45	NC_017565	CAGC	2	8	26814	26821	25 %	0 %	25 %	50 %	386307369
46	NC_017565	ACTG	2	8	27305	27312	25 %	25 %	25 %	25 %	386307371
47	NC_017565	TCCA	2	8	28326	28333	25 %	25 %	0 %	50 %	386307373
48	NC_017565	ATGG	2	8	28466	28473	25 %	25 %	50 %	0 %	386307373
49	NC_017565	TTGA	2	8	28497	28504	25 %	50 %	25 %	0 %	386307373
50	NC_017565	AGTC	2	8	28765	28772	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
51	NC_017565	AGTC	2	8	29007	29014	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
52	NC_017565	TGGA	2	8	29019	29026	25 %	25 %	50 %	0 %	386307373
53	NC_017565	TGAC	2	8	29080	29087	25 %	25 %	25 %	25 %	386307373
54	NC_017565	AATT	2	8	29281	29288	50 %	50 %	0 %	0 %	386307374
55	NC_017565	GCTT	2	8	29353	29360	0 %	50 %	25 %	25 %	386307374
56	NC_017565	TGGT	2	8	29661	29668	0 %	50 %	50 %	0 %	386307374
57	NC_017565	TAAA	2	8	29925	29932	75 %	25 %	0 %	0 %	386307374
58	NC_017565	TTTC	2	8	30120	30127	0 %	75 %	0 %	25 %	386307374
59	NC_017565	GGCT	2	8	32253	32260	0 %	25 %	50 %	25 %	386307379
60	NC_017565	CTTA	2	8	32802	32809	25 %	50 %	0 %	25 %	386307380
61	NC_017565	TCAT	2	8	35420	35427	25 %	50 %	0 %	25 %	386307386
62	NC_017565	CATA	2	8	35532	35539	50 %	25 %	0 %	25 %	386307386
63	NC_017565	GTAA	2	8	36027	36034	50 %	25 %	25 %	0 %	386307386
64	NC_017565	ACCT	2	8	38025	38032	25 %	25 %	0 %	50 %	386307388
65	NC_017565	AGCG	2	8	38526	38533	25 %	0 %	50 %	25 %	386307388
66	NC_017565	AGCC	2	8	38732	38739	25 %	0 %	25 %	50 %	386307389
67	NC_017565	TCAC	2	8	39278	39285	25 %	25 %	0 %	50 %	386307390
68	NC_017565	CAGC	2	8	40053	40060	25 %	0 %	25 %	50 %	386307391
69	NC_017565	TTTA	2	8	40348	40355	25 %	75 %	0 %	0 %	386307392
70	NC_017565	ATAA	2	8	40365	40372	75 %	25 %	0 %	0 %	386307392
71	NC_017565	ATTT	2	8	40916	40923	25 %	75 %	0 %	0 %	386307393
72	NC_017565	TTTG	2	8	41278	41285	0 %	75 %	25 %	0 %	386307394
73	NC_017565	GAAT	2	8	42148	42155	50 %	25 %	25 %	0 %	386307396
74	NC_017565	AAAG	2	8	42435	42442	75 %	0 %	25 %	0 %	386307397
75	NC_017565	AGAA	2	8	42713	42720	75 %	0 %	25 %	0 %	386307397
76	NC_017565	ATCA	2	8	43519	43526	50 %	25 %	0 %	25 %	386307398
77	NC_017565	TCGC	2	8	44060	44067	0 %	25 %	25 %	50 %	386307398
78	NC_017565	GCCA	2	8	44226	44233	25 %	0 %	25 %	50 %	386307398
79	NC_017565	TATT	2	8	44729	44736	25 %	75 %	0 %	0 %	386307399
80	NC_017565	GACT	2	8	45550	45557	25 %	25 %	25 %	25 %	386307401
81	NC_017565	TCGC	2	8	45636	45643	0 %	25 %	25 %	50 %	386307401
82	NC_017565	GCAA	2	8	45847	45854	50 %	0 %	25 %	25 %	386307401
83	NC_017565	AGGT	2	8	46599	46606	25 %	25 %	50 %	0 %	386307402
84	NC_017565	GCTT	2	8	47731	47738	0 %	50 %	25 %	25 %	386307403
85	NC_017565	GATT	2	8	48073	48080	25 %	50 %	25 %	0 %	386307403
86	NC_017565	GGGT	2	8	48412	48419	0 %	25 %	75 %	0 %	386307403
87	NC_017565	CAAT	2	8	48978	48985	50 %	25 %	0 %	25 %	386307404
88	NC_017565	GGTT	2	8	49049	49056	0 %	50 %	50 %	0 %	386307404
89	NC_017565	ACTC	2	8	49695	49702	25 %	25 %	0 %	50 %	386307406
90	NC_017565	AGTG	2	8	50301	50308	25 %	25 %	50 %	0 %	386307407
91	NC_017565	ATTT	2	8	50429	50436	25 %	75 %	0 %	0 %	386307407
92	NC_017565	AAAG	2	8	50584	50591	75 %	0 %	25 %	0 %	386307407
93	NC_017565	TCAG	2	8	51555	51562	25 %	25 %	25 %	25 %	386307408
94	NC_017565	GCTG	2	8	51989	51996	0 %	25 %	50 %	25 %	386307408
95	NC_017565	CTGC	2	8	52986	52993	0 %	25 %	25 %	50 %	386307409
96	NC_017565	AAGC	2	8	52994	53001	50 %	0 %	25 %	25 %	386307409
97	NC_017565	AAGC	2	8	53849	53856	50 %	0 %	25 %	25 %	386307410
98	NC_017565	AAAG	2	8	53947	53954	75 %	0 %	25 %	0 %	386307410
99	NC_017565	CACC	2	8	54089	54096	25 %	0 %	0 %	75 %	386307410
100	NC_017565	GTAA	2	8	54239	54246	50 %	25 %	25 %	0 %	386307410
101	NC_017565	TGAG	2	8	54894	54901	25 %	25 %	50 %	0 %	386307411
102	NC_017565	TACC	2	8	55186	55193	25 %	25 %	0 %	50 %	386307411
103	NC_017565	GTGA	2	8	55397	55404	25 %	25 %	50 %	0 %	386307411
104	NC_017565	CGAT	2	8	55675	55682	25 %	25 %	25 %	25 %	386307412
105	NC_017565	TGAG	2	8	55711	55718	25 %	25 %	50 %	0 %	386307412
106	NC_017565	AAGC	2	8	56237	56244	50 %	0 %	25 %	25 %	386307414
107	NC_017565	AGTC	2	8	56349	56356	25 %	25 %	25 %	25 %	386307414
108	NC_017565	GGTT	2	8	56495	56502	0 %	50 %	50 %	0 %	386307415
109	NC_017565	AAAG	2	8	57318	57325	75 %	0 %	25 %	0 %	386307416
110	NC_017565	TGAT	2	8	57898	57905	25 %	50 %	25 %	0 %	386307416
111	NC_017565	CGTG	2	8	58112	58119	0 %	25 %	50 %	25 %	386307416
112	NC_017565	AATT	2	8	58369	58376	50 %	50 %	0 %	0 %	386307416
113	NC_017565	GCTC	2	8	59203	59210	0 %	25 %	25 %	50 %	386307417
114	NC_017565	AGAT	2	8	59787	59794	50 %	25 %	25 %	0 %	386307419
115	NC_017565	CAAC	2	8	59932	59939	50 %	0 %	0 %	50 %	386307419
116	NC_017565	AAGG	2	8	60332	60339	50 %	0 %	50 %	0 %	386307419
117	NC_017565	TTCA	2	8	60581	60588	25 %	50 %	0 %	25 %	386307419
118	NC_017565	CAAA	2	8	61040	61047	75 %	0 %	0 %	25 %	386307420
119	NC_017565	GCCA	2	8	61298	61305	25 %	0 %	25 %	50 %	386307421
120	NC_017565	CGCT	2	8	61416	61423	0 %	25 %	25 %	50 %	386307421
121	NC_017565	CAAG	2	8	61582	61589	50 %	0 %	25 %	25 %	386307421
122	NC_017565	TGGC	2	8	61621	61628	0 %	25 %	50 %	25 %	386307421
123	NC_017565	AATA	2	8	62350	62357	75 %	25 %	0 %	0 %	386307422
124	NC_017565	AGAC	2	8	62361	62368	50 %	0 %	25 %	25 %	386307422
125	NC_017565	GCCG	2	8	62849	62856	0 %	0 %	50 %	50 %	386307422
126	NC_017565	TTGA	2	8	63203	63210	25 %	50 %	25 %	0 %	386307422
127	NC_017565	ACTG	2	8	63528	63535	25 %	25 %	25 %	25 %	386307423
128	NC_017565	AATG	2	8	63888	63895	50 %	25 %	25 %	0 %	386307424
129	NC_017565	ATTT	2	8	63955	63962	25 %	75 %	0 %	0 %	386307424
130	NC_017565	TAAA	2	8	66399	66406	75 %	25 %	0 %	0 %	386307428
131	NC_017565	AGCC	2	8	67463	67470	25 %	0 %	25 %	50 %	386307431
132	NC_017565	GACT	2	8	67693	67700	25 %	25 %	25 %	25 %	386307432
133	NC_017565	CTGG	2	8	68663	68670	0 %	25 %	50 %	25 %	386307435
134	NC_017565	TTGC	2	8	68717	68724	0 %	50 %	25 %	25 %	386307435
135	NC_017565	TGGC	2	8	69399	69406	0 %	25 %	50 %	25 %	386307436
136	NC_017565	GCCA	2	8	70299	70306	25 %	0 %	25 %	50 %	386307439
137	NC_017565	ATTC	2	8	70397	70404	25 %	50 %	0 %	25 %	386307439
138	NC_017565	GACT	2	8	70737	70744	25 %	25 %	25 %	25 %	386307439
139	NC_017565	TTCA	2	8	71031	71038	25 %	50 %	0 %	25 %	386307440
140	NC_017565	CAGA	2	8	71091	71098	50 %	0 %	25 %	25 %	386307440
141	NC_017565	TGAC	2	8	71463	71470	25 %	25 %	25 %	25 %	386307441
142	NC_017565	TACC	2	8	71860	71867	25 %	25 %	0 %	50 %	386307441
143	NC_017565	GATG	2	8	72037	72044	25 %	25 %	50 %	0 %	386307441

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.