MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	GTT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	CTT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017565	CAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017565	TTA	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017565	ACA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017565	TCA	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017565	GCC	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017565	TAG	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017565	GGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017565	AAT	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017565	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017565	CCA	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017565	TGT	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017565	AGA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017565	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017565	GTG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017565	AAT	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017565	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017565	CAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017565	TAT	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017565	ACT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017565	TCG	2	6	7102	7107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017565	TAA	3	9	7116	7124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017565	AAT	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017565	GAA	2	6	8361	8366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017565	GGT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017565	ATT	2	6	8565	8570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017565	GTA	2	6	8583	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017565	ATT	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017565	ATC	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017565	ATC	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017565	ACT	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017565	TAA	2	6	10598	10603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017565	ATT	2	6	10736	10741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017565	GTA	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017565	ATT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017565	TAT	2	6	10808	10813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017565	TAA	2	6	10880	10885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017565	ACA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017565	AAT	2	6	11049	11054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017565	AAT	2	6	12624	12629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017565	AGC	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017565	AAT	2	6	12896	12901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017565	TTA	2	6	13387	13392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017565	GTC	2	6	13432	13437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017565	TGG	2	6	14235	14240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017565	ATT	2	6	14677	14682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017565	GAA	2	6	14705	14710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017565	TAA	2	6	14828	14833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017565	GTT	2	6	16166	16171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017565	GCG	2	6	16179	16184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017565	AGA	2	6	16198	16203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017565	TTA	2	6	16437	16442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017565	TAA	2	6	16478	16483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017565	CGA	2	6	16690	16695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017565	ACG	2	6	16709	16714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017565	AGT	2	6	16724	16729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017565	TAA	2	6	19271	19276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017565	TAT	2	6	19288	19293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017565	TTA	2	6	19346	19351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017565	TCA	2	6	19648	19653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017565	CTT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017565	CGT	2	6	21267	21272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017565	GCG	2	6	21282	21287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017565	ATA	2	6	21312	21317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017565	TCA	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017565	AAT	2	6	23555	23560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017565	TGT	2	6	23941	23946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017565	GAA	2	6	23972	23977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017565	GCG	2	6	25033	25038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017565	GGA	2	6	25183	25188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017565	GAA	2	6	25214	25219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017565	CGA	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017565	TAA	2	6	26084	26089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017565	CAC	2	6	26493	26498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017565	GAG	2	6	26703	26708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017565	ATA	2	6	27692	27697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017565	CTG	2	6	27814	27819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017565	CGA	2	6	27824	27829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017565	CAG	2	6	27850	27855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017565	GTC	2	6	27891	27896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017565	GCG	2	6	27973	27978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017565	TGT	2	6	28017	28022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017565	ATA	2	6	28071	28076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017565	TAT	2	6	30267	30272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017565	CTT	2	6	30300	30305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017565	GCG	2	6	30536	30541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017565	GCA	3	9	30965	30973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017565	AGA	2	6	31632	31637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017565	GCT	2	6	32359	32364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017565	GAT	2	6	32411	32416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017565	GGT	2	6	32479	32484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017565	TTG	2	6	33022	33027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017565	TTA	2	6	33030	33035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017565	TGG	2	6	34346	34351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017565	TTG	2	6	34412	34417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017565	TGG	2	6	34443	34448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017565	CGC	2	6	34452	34457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017565	CTC	2	6	34458	34463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017565	GAG	2	6	34473	34478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017565	TGT	2	6	35127	35132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017565	TAA	2	6	35145	35150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017565	CAG	2	6	35159	35164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017565	TAT	2	6	36769	36774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017565	TAA	2	6	36777	36782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017565	ATT	2	6	36818	36823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017565	TAA	2	6	36921	36926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017565	TCA	3	9	36964	36972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017565	AAT	2	6	37057	37062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017565	GAG	2	6	37193	37198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017565	AGG	2	6	37241	37246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017565	TAT	3	9	37249	37257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017565	CTT	2	6	37293	37298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017565	TAT	2	6	37329	37334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017565	ACC	2	6	45202	45207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017565	GAT	2	6	45220	45225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017565	TTA	2	6	46346	46351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017565	TAA	2	6	46396	46401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017565	AGA	2	6	46829	46834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017565	GAT	2	6	46841	46846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017565	GTG	2	6	46870	46875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017565	TAT	2	6	46881	46886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017565	AAC	2	6	46895	46900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017565	TAT	2	6	47069	47074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017565	CAA	2	6	47082	47087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017565	CAT	2	6	47188	47193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017565	TTG	2	6	47218	47223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017565	CAA	2	6	47327	47332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017565	AGC	2	6	54484	54489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017565	AGT	2	6	54580	54585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017565	CAT	2	6	55731	55736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017565	TAA	2	6	59350	59355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017565	AGG	2	6	59359	59364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017565	CAA	2	6	60640	60645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017565	GAC	2	6	60648	60653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017565	AGG	2	6	60696	60701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017565	GTC	2	6	60872	60877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017565	CAA	2	6	61214	61219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017565	GGA	2	6	62333	62338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017565	ATT	2	6	63398	63403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017565	ATA	2	6	63413	63418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017565	ATT	2	6	63450	63455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.