MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	AT	3	6	87	92	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	CA	3	6	367	372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017565	AT	3	6	1419	1424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017565	AC	3	6	2680	2685	50 %	0 %	0 %	50 %	386307333
5	NC_017565	GT	3	6	2904	2909	0 %	50 %	50 %	0 %	386307333
6	NC_017565	CT	3	6	3692	3697	0 %	50 %	0 %	50 %	386307333
7	NC_017565	GA	3	6	3698	3703	50 %	0 %	50 %	0 %	386307333
8	NC_017565	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017565	TG	3	6	3988	3993	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
10	NC_017565	TG	3	6	4076	4081	0 %	50 %	50 %	0 %	386307334
11	NC_017565	GC	3	6	4183	4188	0 %	0 %	50 %	50 %	386307334
12	NC_017565	TC	3	6	4297	4302	0 %	50 %	0 %	50 %	386307334
13	NC_017565	TC	3	6	4628	4633	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
14	NC_017565	AC	3	6	5127	5132	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
15	NC_017565	CT	3	6	5798	5803	0 %	50 %	0 %	50 %	386307335
16	NC_017565	AC	3	6	6113	6118	50 %	0 %	0 %	50 %	386307335
17	NC_017565	GC	3	6	6145	6150	0 %	0 %	50 %	50 %	386307335
18	NC_017565	AG	4	8	6585	6592	50 %	0 %	50 %	0 %	386307335
19	NC_017565	AT	3	6	6685	6690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017565	TA	4	8	6768	6775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017565	GA	4	8	7956	7963	50 %	0 %	50 %	0 %	386307337
22	NC_017565	AT	3	6	8723	8728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017565	TG	3	6	8918	8923	0 %	50 %	50 %	0 %	386307338
24	NC_017565	AG	3	6	10149	10154	50 %	0 %	50 %	0 %	386307340
25	NC_017565	AT	3	6	10322	10327	50 %	50 %	0 %	0 %	386307340
26	NC_017565	AT	3	6	10768	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017565	GA	3	6	11384	11389	50 %	0 %	50 %	0 %	386307341
28	NC_017565	TC	3	6	11828	11833	0 %	50 %	0 %	50 %	386307341
29	NC_017565	TA	3	6	12527	12532	50 %	50 %	0 %	0 %	386307343
30	NC_017565	TA	4	8	12743	12750	50 %	50 %	0 %	0 %	386307344
31	NC_017565	TA	3	6	13554	13559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017565	GT	3	6	13581	13586	0 %	50 %	50 %	0 %	386307347
33	NC_017565	TA	3	6	14692	14697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017565	AC	3	6	14783	14788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017565	TC	3	6	15836	15841	0 %	50 %	0 %	50 %	386307352
36	NC_017565	CA	3	6	16070	16075	50 %	0 %	0 %	50 %	386307353
37	NC_017565	CT	3	6	16377	16382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017565	GA	3	6	16465	16470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017565	AT	3	6	16736	16741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017565	AT	3	6	16838	16843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017565	CA	3	6	17958	17963	50 %	0 %	0 %	50 %	386307354
42	NC_017565	AC	3	6	18088	18093	50 %	0 %	0 %	50 %	386307354
43	NC_017565	TG	4	8	18707	18714	0 %	50 %	50 %	0 %	386307355
44	NC_017565	GA	3	6	18744	18749	50 %	0 %	50 %	0 %	386307355
45	NC_017565	TC	3	6	19195	19200	0 %	50 %	0 %	50 %	386307355
46	NC_017565	TA	3	6	19752	19757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017565	AC	3	6	20032	20037	50 %	0 %	0 %	50 %	386307356
48	NC_017565	TG	3	6	20121	20126	0 %	50 %	50 %	0 %	386307356
49	NC_017565	TA	4	8	20390	20397	50 %	50 %	0 %	0 %	386307357
50	NC_017565	GC	4	8	20508	20515	0 %	0 %	50 %	50 %	386307357
51	NC_017565	AG	3	6	22252	22257	50 %	0 %	50 %	0 %	386307360
52	NC_017565	GA	3	6	22902	22907	50 %	0 %	50 %	0 %	386307360
53	NC_017565	AG	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	386307361
54	NC_017565	CA	3	6	23799	23804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017565	AG	3	6	23966	23971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017565	AC	3	6	25888	25893	50 %	0 %	0 %	50 %	386307366
57	NC_017565	AT	3	6	25915	25920	50 %	50 %	0 %	0 %	386307366
58	NC_017565	TA	3	6	27798	27803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017565	TA	3	6	27996	28001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017565	TC	4	8	29815	29822	0 %	50 %	0 %	50 %	386307374
61	NC_017565	GA	3	6	30044	30049	50 %	0 %	50 %	0 %	386307374
62	NC_017565	GT	3	6	30692	30697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017565	AT	3	6	31009	31014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017565	AT	3	6	31173	31178	50 %	50 %	0 %	0 %	386307377
65	NC_017565	TA	3	6	31529	31534	50 %	50 %	0 %	0 %	386307378
66	NC_017565	TA	3	6	31536	31541	50 %	50 %	0 %	0 %	386307378
67	NC_017565	GA	3	6	31636	31641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017565	TA	3	6	32485	32490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017565	AT	3	6	32831	32836	50 %	50 %	0 %	0 %	386307380
70	NC_017565	TA	3	6	32924	32929	50 %	50 %	0 %	0 %	386307380
71	NC_017565	AT	3	6	33498	33503	50 %	50 %	0 %	0 %	386307381
72	NC_017565	TG	3	6	33591	33596	0 %	50 %	50 %	0 %	386307382
73	NC_017565	GA	3	6	34573	34578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017565	CT	3	6	34844	34849	0 %	50 %	0 %	50 %	386307385
75	NC_017565	TA	3	6	35091	35096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017565	TA	3	6	35229	35234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017565	GC	4	8	36098	36105	0 %	0 %	50 %	50 %	386307386
78	NC_017565	CT	3	6	36532	36537	0 %	50 %	0 %	50 %	386307386
79	NC_017565	CT	3	6	36623	36628	0 %	50 %	0 %	50 %	386307386
80	NC_017565	AT	3	6	36859	36864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017565	AT	3	6	36982	36987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017565	TC	3	6	37178	37183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017565	AT	4	8	37353	37360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017565	AT	3	6	37920	37925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017565	GC	3	6	38503	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	386307388
86	NC_017565	CT	3	6	38760	38765	0 %	50 %	0 %	50 %	386307389
87	NC_017565	CG	3	6	42587	42592	0 %	0 %	50 %	50 %	386307397
88	NC_017565	AC	3	6	42851	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	386307398
89	NC_017565	AG	3	6	44381	44386	50 %	0 %	50 %	0 %	386307398
90	NC_017565	TA	3	6	45208	45213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017565	AT	3	6	46201	46206	50 %	50 %	0 %	0 %	386307401
92	NC_017565	TA	3	6	46317	46322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017565	AG	3	6	46527	46532	50 %	0 %	50 %	0 %	386307402
94	NC_017565	TG	3	6	46679	46684	0 %	50 %	50 %	0 %	386307402
95	NC_017565	TA	3	6	47169	47174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017565	AT	3	6	47192	47197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017565	AT	3	6	47811	47816	50 %	50 %	0 %	0 %	386307403
98	NC_017565	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	386307403
99	NC_017565	AG	3	6	48796	48801	50 %	0 %	50 %	0 %	386307404
100	NC_017565	TG	3	6	50307	50312	0 %	50 %	50 %	0 %	386307407
101	NC_017565	CG	3	6	51404	51409	0 %	0 %	50 %	50 %	386307408
102	NC_017565	CG	3	6	51490	51495	0 %	0 %	50 %	50 %	386307408
103	NC_017565	CA	3	6	52017	52022	50 %	0 %	0 %	50 %	386307408
104	NC_017565	CT	3	6	52230	52235	0 %	50 %	0 %	50 %	386307408
105	NC_017565	AG	3	6	53459	53464	50 %	0 %	50 %	0 %	386307410
106	NC_017565	TC	3	6	55870	55875	0 %	50 %	0 %	50 %	386307413
107	NC_017565	GC	3	6	56527	56532	0 %	0 %	50 %	50 %	386307415
108	NC_017565	TC	3	6	57214	57219	0 %	50 %	0 %	50 %	386307416
109	NC_017565	CG	3	6	57303	57308	0 %	0 %	50 %	50 %	386307416
110	NC_017565	AT	3	6	57406	57411	50 %	50 %	0 %	0 %	386307416
111	NC_017565	TC	3	6	58249	58254	0 %	50 %	0 %	50 %	386307416
112	NC_017565	AT	3	6	58529	58534	50 %	50 %	0 %	0 %	386307416
113	NC_017565	TC	3	6	59186	59191	0 %	50 %	0 %	50 %	386307417
114	NC_017565	TG	3	6	59468	59473	0 %	50 %	50 %	0 %	386307418
115	NC_017565	CT	3	6	60818	60823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017565	AG	3	6	62918	62923	50 %	0 %	50 %	0 %	386307422
117	NC_017565	TA	3	6	63340	63345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017565	CT	3	6	64157	64162	0 %	50 %	0 %	50 %	386307425
119	NC_017565	CT	3	6	64860	64865	0 %	50 %	0 %	50 %	386307425
120	NC_017565	AT	8	16	65212	65227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017565	AC	3	6	67394	67399	50 %	0 %	0 %	50 %	386307431
122	NC_017565	AT	3	6	67421	67426	50 %	50 %	0 %	0 %	386307431
123	NC_017565	GC	3	6	69615	69620	0 %	0 %	50 %	50 %	386307437
124	NC_017565	CA	3	6	70096	70101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017565	CT	3	6	70173	70178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017565	GT	3	6	70258	70263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017565	AG	3	6	71119	71124	50 %	0 %	50 %	0 %	386307440
128	NC_017565	CA	3	6	71485	71490	50 %	0 %	0 %	50 %	386307441
129	NC_017565	CG	3	6	71629	71634	0 %	0 %	50 %	50 %	386307441
130	NC_017565	GC	3	6	72134	72139	0 %	0 %	50 %	50 %	386307441

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.