MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	GAAGTG	2	12	22471	22482	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017563	ACTAAT	2	12	22501	22512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017563	GAAGTG	2	12	77281	77292	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017563	ACTAAT	2	12	77311	77322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017563	TTCGGG	2	12	78197	78208	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017563	TTTATA	2	12	85235	85246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017563	GCAAAA	2	12	86901	86912	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017563	TAAAAA	2	12	118371	118382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017563	TCCAAC	2	12	133548	133559	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017563	GAAGTG	2	12	138979	138990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017563	ACTAAT	2	12	139009	139020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017563	TTAAGT	2	12	139999	140010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017563	TGAAAA	2	12	143775	143786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017563	TACAGC	2	12	145815	145826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017563	ATTTAT	2	12	147058	147069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017563	CAAATA	2	12	161546	161557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017563	CAAAAA	2	12	191866	191877	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017563	GAAAGA	2	12	211549	211560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017563	TTGGTT	2	12	269937	269948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017563	AAGCTA	2	12	289208	289219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017563	AGATAA	2	12	312363	312374	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017563	ATGATA	2	12	312442	312453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017563	ATTTTT	2	12	321357	321368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017563	GAAGTG	2	12	355830	355841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017563	ACTAAT	2	12	355860	355871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017563	TTTCTT	2	12	356623	356634	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017563	ATATCC	2	12	375991	376002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017563	GAATAT	2	12	376067	376078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017563	GTTTTT	2	12	385897	385908	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017563	TGACAA	2	12	392717	392728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017563	AAAAGG	2	12	401545	401556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017563	ATGGGG	2	12	430831	430842	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017563	TCAAGC	2	12	431300	431311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017563	AGTGGG	2	12	435372	435383	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017563	TAGTAA	2	12	474153	474164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017563	CAAAAA	2	12	492043	492054	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017563	CCCCTA	2	12	501819	501830	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017563	TCTATA	2	12	509934	509945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017563	CTATCA	2	12	551613	551624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017563	TTCGGG	2	12	571465	571476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017563	ATTTGA	2	12	604973	604984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017563	CTTAGA	2	12	608031	608042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017563	CTTAGG	2	12	664283	664294	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017563	AAAAGC	2	12	685883	685894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017563	AACTAT	2	12	780051	780062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017563	TATTGC	2	12	787451	787462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017563	CAGTTT	2	12	835790	835801	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017563	GTTCGT	2	12	888843	888854	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017563	AAATGA	2	12	890455	890466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017563	GCTTTT	2	12	891975	891986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017563	CCAAAA	2	12	902636	902647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017563	GTTACT	2	12	931148	931159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017563	ACTCAA	2	12	940933	940944	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017563	CTACCA	2	12	949878	949889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017563	AAAAGC	2	12	966604	966615	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017563	TAAAAT	2	12	976712	976723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017563	ATTTTT	2	12	976932	976943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017563	TAAAAA	2	12	977777	977788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017563	TTTATC	2	12	984266	984277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017563	CTATAT	2	12	1013890	1013901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017563	CTTTTT	2	12	1048716	1048727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017563	TGTAAC	2	12	1054367	1054378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017563	TAGTTG	2	12	1070815	1070826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017563	AAGATT	2	12	1212317	1212328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017563	AATTGT	2	12	1270425	1270436	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017563	TTTTTA	2	12	1349302	1349313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017563	AGATAA	2	12	1353267	1353278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017563	TCGGCT	3	18	1383228	1383245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017563	ATCTCA	2	12	1432643	1432654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017563	CAAAAT	2	12	1451450	1451461	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017563	TTTTTC	2	12	1466121	1466132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017563	ATAAAA	2	12	1477155	1477166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017563	ATAGTA	2	12	1477381	1477392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017563	ATCAAA	2	12	1484156	1484167	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017563	TTGTAT	2	12	1485608	1485619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017563	TTTTAT	2	12	1485934	1485945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017563	ATTATC	2	12	1486059	1486070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017563	ACACAA	2	12	1495080	1495091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017563	TCATAA	2	12	1515463	1515474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017563	TTTATT	2	12	1518812	1518823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017563	AAAAAG	2	12	1521240	1521251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017563	GATTTT	2	12	1528798	1528809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017563	CTTTTA	2	12	1537431	1537442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017563	ACTTGA	2	12	1544615	1544626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017563	TTCGCT	2	12	1544630	1544641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017563	GAAAAA	2	12	1566248	1566259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017563	CCTCTA	2	12	1587075	1587086	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017563	CATAAA	2	12	1587205	1587216	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017563	GCCACT	2	12	1590800	1590811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017563	TCCTGA	2	12	1599123	1599134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017563	AGCTTC	2	12	1621590	1621601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017563	GAACCA	2	12	1628013	1628024	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017563	GAAATA	2	12	1639214	1639225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017563	TATTAG	2	12	1640147	1640158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017563	ATTTTT	2	12	1669907	1669918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017563	TATTTA	2	12	1672384	1672395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017563	ACATTT	2	12	1724416	1724427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017563	AAAATG	2	12	1730950	1730961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017563	CGATAA	2	12	1762414	1762425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017563	GACTAT	2	12	1767465	1767476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017563	CAAGGG	2	12	1767520	1767531	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017563	TTAACC	2	12	1779222	1779233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017563	TAAAAT	2	12	1787200	1787211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017563	TTCCTT	2	12	1787958	1787969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017563	AATAAA	2	12	1823602	1823613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.