MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017563	TTCT	2	8	15964	15971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017563	ATTA	2	8	17411	17418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017563	CAGT	2	8	17431	17438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017563	ATTT	2	8	18010	18017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017563	GTGA	2	8	18220	18227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017563	AGCG	2	8	18391	18398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017563	TGGT	2	8	19056	19063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017563	AGCC	2	8	19272	19279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017563	GTAA	2	8	19547	19554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017563	ATAG	2	8	19561	19568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017563	GCGA	2	8	19875	19882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017563	ATTC	2	8	20740	20747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017563	CTAA	2	8	21094	21101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017563	CTGA	2	8	21367	21374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017563	TAGG	2	8	21749	21756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017563	GCGT	2	8	23734	23741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017563	ATTT	2	8	27330	27337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017563	GTTT	2	8	33094	33101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017563	TCGT	2	8	37767	37774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017563	TGAA	2	8	40872	40879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017563	AGAA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017563	CTTT	2	8	42522	42529	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017563	ACCT	2	8	44719	44726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017563	GCGA	2	8	46303	46310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017563	AGTT	2	8	46490	46497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017563	AAAC	2	8	48356	48363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017563	AATA	2	8	49490	49497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017563	AGGA	2	8	51064	51071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017563	TTAA	2	8	55582	55589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017563	GATA	2	8	56896	56903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017563	ATAG	2	8	58035	58042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017563	GGTA	2	8	60001	60008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017563	TGAT	2	8	60468	60475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017563	AGTG	2	8	64240	64247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017563	AGTC	2	8	64919	64926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017563	AAAG	2	8	67904	67911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017563	TTGA	2	8	69086	69093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017563	AAAC	2	8	69121	69128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017563	AGAA	2	8	70460	70467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017563	ATTT	2	8	72821	72828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017563	GTGA	2	8	73031	73038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017563	AGCG	2	8	73202	73209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017563	TGGT	2	8	73867	73874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017563	AGCC	2	8	74083	74090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017563	GTAA	2	8	74358	74365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017563	ATAG	2	8	74372	74379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017563	GCGA	2	8	74686	74693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017563	ATTC	2	8	75550	75557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017563	CTAA	2	8	75904	75911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017563	CTGA	2	8	76177	76184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017563	TAGG	2	8	76559	76566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017563	GCGT	2	8	77946	77953	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017563	ATTT	2	8	78135	78142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017563	TCCC	2	8	78217	78224	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_017563	AGTC	2	8	83044	83051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017563	TTTG	2	8	83063	83070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017563	TGGG	2	8	88480	88487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017563	AAAT	2	8	89397	89404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017563	AATC	2	8	90497	90504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017563	TAGG	2	8	94428	94435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017563	TGGT	2	8	94514	94521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017563	TGTT	2	8	94535	94542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017563	CTTG	2	8	94599	94606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017563	ATGA	2	8	97109	97116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017563	GAAA	2	8	100875	100882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017563	AATT	2	8	101233	101240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017563	TTTA	2	8	107024	107031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017563	TTTA	2	8	107037	107044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017563	TAGC	2	8	107045	107052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017563	GGTA	2	8	108141	108148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017563	ATTC	2	8	109491	109498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017563	GAAT	2	8	110072	110079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017563	AAAT	2	8	110098	110105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017563	ATTG	2	8	110265	110272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017563	TAAG	2	8	110788	110795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017563	ATTT	2	8	110797	110804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017563	ATTA	2	8	119776	119783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017563	TAAA	2	8	120583	120590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017563	TCAA	2	8	120800	120807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017563	GCTA	2	8	124667	124674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017563	AGAA	2	8	128456	128463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017563	AGAA	2	8	130374	130381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017563	CAGC	2	8	134101	134108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017563	ATTT	2	8	134517	134524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017563	GTGA	2	8	134727	134734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017563	AGCG	2	8	134898	134905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017563	TGGT	2	8	135563	135570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017563	AGCC	2	8	135779	135786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017563	GTAA	2	8	136054	136061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017563	ATAG	2	8	136068	136075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017563	GCGA	2	8	136383	136390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017563	ATTC	2	8	137248	137255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017563	CTAA	2	8	137602	137609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017563	CTGA	2	8	137875	137882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017563	TAGG	2	8	138257	138264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017563	AATC	2	8	140048	140055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017563	TTAA	2	8	143160	143167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017563	CAAG	2	8	145722	145729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017563	GTGA	2	8	145772	145779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017563	ATTG	2	8	146528	146535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017563	GTGG	2	8	146932	146939	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017563	TTAT	2	8	146979	146986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017563	GTTT	2	8	147598	147605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017563	AATC	2	8	150881	150888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017563	AAGA	2	8	152608	152615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017563	TTAC	2	8	158583	158590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017563	TTAA	2	8	158610	158617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017563	GAAG	2	8	158625	158632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017563	TAGA	2	8	161416	161423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017563	AAAG	2	8	161617	161624	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017563	AACT	2	8	162510	162517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017563	AATA	2	8	163473	163480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017563	AAAG	2	8	166434	166441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017563	TGAA	2	8	168064	168071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017563	AGCT	2	8	168141	168148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017563	CCTT	2	8	168860	168867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017563	AAAG	2	8	168907	168914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017563	ATCA	2	8	169381	169388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017563	CAAA	2	8	169635	169642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017563	GACA	2	8	169764	169771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017563	ACAT	2	8	173418	173425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017563	TAAA	2	8	179754	179761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017563	GATT	2	8	181307	181314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017563	ATCA	2	8	183072	183079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017563	ATTT	2	8	183097	183104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017563	AAAT	2	8	183467	183474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017563	TTAA	2	8	185765	185772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017563	TCAG	2	8	191829	191836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017563	TGTC	2	8	191847	191854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017563	ATAA	2	8	196130	196137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017563	TTGT	2	8	198500	198507	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017563	ATCT	2	8	203920	203927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017563	AGCT	2	8	204118	204125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017563	ATAA	2	8	204259	204266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017563	GAGT	2	8	207653	207660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017563	AAGA	2	8	209290	209297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017563	AATC	2	8	209989	209996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017563	TTAA	2	8	210569	210576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017563	ATTT	2	8	211057	211064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017563	GTTT	2	8	211301	211308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017563	GAGT	2	8	212317	212324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017563	TGCT	2	8	216006	216013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017563	CATT	2	8	216096	216103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017563	AAAG	2	8	216161	216168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017563	CTGT	2	8	217738	217745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017563	GTTG	2	8	217916	217923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017563	TTTG	2	8	221709	221716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017563	CTAA	2	8	221756	221763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017563	AAGA	2	8	221892	221899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017563	AATC	2	8	221987	221994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017563	TTGA	2	8	222016	222023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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