MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus ND03 chromosome

Total Repeats: 4124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017563	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017563	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017563	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017563	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017563	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017563	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017563	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017563	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017563	GAT	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017563	TAA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017563	AAT	2	6	12696	12701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017563	ATA	3	9	12706	12714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017563	CTT	2	6	12716	12721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017563	TGA	2	6	14693	14698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017563	TGA	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017563	TGA	2	6	15640	15645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017563	TGG	2	6	15657	15662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017563	GCG	2	6	15724	15729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017563	GAT	2	6	15862	15867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017563	AAT	2	6	15891	15896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017563	ATG	2	6	15905	15910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017563	ATG	2	6	15973	15978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017563	AGC	2	6	16909	16914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017563	TAA	2	6	17493	17498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017563	TTA	2	6	17506	17511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017563	AAG	2	6	17552	17557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017563	GAT	2	6	17559	17564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017563	GAA	2	6	17602	17607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017563	AGA	2	6	17730	17735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017563	GAC	2	6	17771	17776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017563	ATT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017563	GGC	2	6	17848	17853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017563	CTT	2	6	17898	17903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017563	TAG	2	6	18065	18070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017563	CGA	2	6	18093	18098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017563	GCA	2	6	18167	18172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017563	CGC	2	6	18214	18219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017563	TGT	2	6	18253	18258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017563	CAG	2	6	18336	18341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017563	GGA	2	6	18526	18531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017563	GAA	2	6	18790	18795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017563	GGT	2	6	18864	18869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017563	GTC	2	6	18878	18883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017563	CAT	2	6	18946	18951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017563	TAA	2	6	18981	18986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017563	GGA	2	6	18990	18995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017563	ATC	2	6	19014	19019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017563	CGC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017563	CAC	2	6	19225	19230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017563	GAT	2	6	19295	19300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017563	CCT	2	6	19351	19356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017563	AGG	2	6	19453	19458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017563	ACG	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017563	TAG	2	6	19867	19872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017563	AGA	2	6	19954	19959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017563	TCG	2	6	20057	20062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017563	GGA	2	6	20070	20075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017563	ACA	2	6	20188	20193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017563	ATG	2	6	20255	20260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017563	GGA	2	6	20388	20393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017563	ACC	2	6	20653	20658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017563	AGC	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017563	GAA	2	6	20867	20872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017563	GAG	2	6	20883	20888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017563	ACA	2	6	21039	21044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017563	TAG	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017563	GAT	2	6	21442	21447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017563	CGG	2	6	21533	21538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017563	GTT	2	6	21793	21798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017563	TAC	2	6	21803	21808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017563	CCT	2	6	21891	21896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017563	GGT	2	6	22027	22032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017563	TCG	2	6	22142	22147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017563	CGT	2	6	22222	22227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017563	GTT	2	6	22325	22330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017563	GTG	2	6	22817	22822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017563	ACC	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017563	CGT	2	6	23217	23222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017563	GAG	2	6	23229	23234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017563	TAA	3	9	23325	23333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017563	CTC	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017563	CGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017563	GGA	2	6	23675	23680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017563	TCC	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017563	AGC	2	6	23784	23789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017563	TCG	2	6	23798	23803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017563	CGG	2	6	23898	23903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017563	TGT	2	6	23927	23932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017563	TGT	2	6	23975	23980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017563	GGT	2	6	24089	24094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017563	TAT	2	6	24206	24211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017563	TCT	2	6	24285	24290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017563	TCT	2	6	24370	24375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017563	TAA	2	6	25635	25640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017563	AGT	2	6	25687	25692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017563	ACA	2	6	27190	27195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017563	AAT	2	6	27237	27242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017563	AAT	2	6	27259	27264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017563	TAG	2	6	27375	27380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017563	GGA	2	6	27388	27393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017563	TAA	2	6	28628	28633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017563	TAA	2	6	28724	28729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017563	TCT	2	6	28739	28744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017563	TCT	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017563	CTT	2	6	28874	28879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017563	GCT	2	6	28930	28935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017563	GAT	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017563	AAT	2	6	28955	28960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017563	TGG	2	6	29060	29065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017563	TTC	2	6	29132	29137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017563	CGT	2	6	29141	29146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017563	ATG	2	6	29212	29217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017563	ATG	2	6	29270	29275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017563	AAT	2	6	29446	29451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017563	TCT	2	6	31412	31417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017563	TAA	2	6	31490	31495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017563	GAT	2	6	31604	31609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017563	GTT	2	6	32887	32892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017563	ATA	2	6	32908	32913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017563	TGT	2	6	32928	32933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017563	GTC	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017563	GAA	2	6	37738	37743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017563	AGA	2	6	39263	39268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017563	AAG	2	6	43128	43133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017563	TAT	2	6	43504	43509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017563	GAT	2	6	44752	44757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017563	ATG	2	6	44958	44963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017563	TAT	2	6	44989	44994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017563	GTG	2	6	46340	46345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017563	CAC	2	6	46438	46443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017563	ATA	2	6	46467	46472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017563	CGT	3	9	46557	46565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017563	CCA	2	6	48259	48264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017563	TTG	2	6	49173	49178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017563	GTT	2	6	49387	49392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017563	AAG	2	6	49436	49441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017563	CTT	2	6	49595	49600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017563	ATC	2	6	51148	51153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017563	AGC	2	6	51329	51334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017563	CTT	2	6	51416	51421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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