MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 1539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017562	TGGAT	2	10	758	767	20 %	40 %	40 %	0 %	386083115
2	NC_017562	CTGGA	2	10	3567	3576	20 %	20 %	40 %	20 %	386083116
3	NC_017562	GCAGT	2	10	4164	4173	20 %	20 %	40 %	20 %	386083116
4	NC_017562	GGACG	2	10	4223	4232	20 %	0 %	60 %	20 %	386083116
5	NC_017562	CAGAT	2	10	5306	5315	40 %	20 %	20 %	20 %	386083117
6	NC_017562	GACCA	2	10	6644	6653	40 %	0 %	20 %	40 %	386083118
7	NC_017562	AGCTG	2	10	7978	7987	20 %	20 %	40 %	20 %	386083118
8	NC_017562	TTCGG	2	10	10110	10119	0 %	40 %	40 %	20 %	386083119
9	NC_017562	CAGTG	2	10	12096	12105	20 %	20 %	40 %	20 %	386083120
10	NC_017562	CACTG	2	10	12925	12934	20 %	20 %	20 %	40 %	386083121
11	NC_017562	TTGGA	2	10	16837	16846	20 %	40 %	40 %	0 %	386083125
12	NC_017562	CATGG	2	10	17420	17429	20 %	20 %	40 %	20 %	386083126
13	NC_017562	ACACT	2	10	18632	18641	40 %	20 %	0 %	40 %	386083127
14	NC_017562	ACGCT	2	10	18799	18808	20 %	20 %	20 %	40 %	386083128
15	NC_017562	TATCC	2	10	20407	20416	20 %	40 %	0 %	40 %	386083129
16	NC_017562	CCAAG	2	10	21608	21617	40 %	0 %	20 %	40 %	386083131
17	NC_017562	CAGCG	2	10	22671	22680	20 %	0 %	40 %	40 %	386083132
18	NC_017562	CAAGA	2	10	26624	26633	60 %	0 %	20 %	20 %	386083136
19	NC_017562	CGCTA	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	386083138
20	NC_017562	AATGG	2	10	37820	37829	40 %	20 %	40 %	0 %	386083144
21	NC_017562	GCAAC	2	10	39774	39783	40 %	0 %	20 %	40 %	386083146
22	NC_017562	GACTA	2	10	40325	40334	40 %	20 %	20 %	20 %	386083146
23	NC_017562	TGGAA	2	10	41129	41138	40 %	20 %	40 %	0 %	386083146
24	NC_017562	CACTG	2	10	41541	41550	20 %	20 %	20 %	40 %	386083146
25	NC_017562	ACCGA	2	10	41656	41665	40 %	0 %	20 %	40 %	386083146
26	NC_017562	TCCAG	2	10	41996	42005	20 %	20 %	20 %	40 %	386083147
27	NC_017562	CTACG	2	10	42178	42187	20 %	20 %	20 %	40 %	386083147
28	NC_017562	CGCGC	2	10	43750	43759	0 %	0 %	40 %	60 %	386083149
29	NC_017562	ACCAC	2	10	48059	48068	40 %	0 %	0 %	60 %	386083154
30	NC_017562	TCAAC	2	10	48495	48504	40 %	20 %	0 %	40 %	386083155
31	NC_017562	ACACC	2	10	48571	48580	40 %	0 %	0 %	60 %	386083155
32	NC_017562	GGCCG	2	10	52921	52930	0 %	0 %	60 %	40 %	386083161
33	NC_017562	CGGGG	2	10	55713	55722	0 %	0 %	80 %	20 %	386083164
34	NC_017562	TGGTT	2	10	56781	56790	0 %	60 %	40 %	0 %	386083164
35	NC_017562	CTGCG	2	10	57117	57126	0 %	20 %	40 %	40 %	386083164
36	NC_017562	TGGTG	2	10	57597	57606	0 %	40 %	60 %	0 %	386083165
37	NC_017562	GGCCG	2	10	62645	62654	0 %	0 %	60 %	40 %	386083171
38	NC_017562	TGCCC	2	10	63085	63094	0 %	20 %	20 %	60 %	386083171
39	NC_017562	GGTCA	2	10	63269	63278	20 %	20 %	40 %	20 %	386083171
40	NC_017562	CGTGC	2	10	64814	64823	0 %	20 %	40 %	40 %	386083171
41	NC_017562	GCTGG	2	10	65004	65013	0 %	20 %	60 %	20 %	386083171
42	NC_017562	GATGG	2	10	65162	65171	20 %	20 %	60 %	0 %	386083171
43	NC_017562	GTGAG	2	10	67085	67094	20 %	20 %	60 %	0 %	386083174
44	NC_017562	CGTTG	2	10	68537	68546	0 %	40 %	40 %	20 %	386083176
45	NC_017562	GCTGA	2	10	71844	71853	20 %	20 %	40 %	20 %	386083179
46	NC_017562	GGGCG	2	10	72281	72290	0 %	0 %	80 %	20 %	386083179
47	NC_017562	CGGTG	2	10	74514	74523	0 %	20 %	60 %	20 %	386083181
48	NC_017562	GCTGC	2	10	78642	78651	0 %	20 %	40 %	40 %	386083185
49	NC_017562	GAATG	2	10	79336	79345	40 %	20 %	40 %	0 %	386083186
50	NC_017562	GCAAG	2	10	79721	79730	40 %	0 %	40 %	20 %	386083187
51	NC_017562	CTGCA	2	10	79886	79895	20 %	20 %	20 %	40 %	386083187
52	NC_017562	CGGCG	3	15	81698	81712	0 %	0 %	60 %	40 %	386083189
53	NC_017562	TGCGG	2	10	82302	82311	0 %	20 %	60 %	20 %	386083190
54	NC_017562	ATGTG	2	10	85060	85069	20 %	40 %	40 %	0 %	386083192
55	NC_017562	CCACG	2	10	86490	86499	20 %	0 %	20 %	60 %	386083194
56	NC_017562	GCCCT	2	10	87127	87136	0 %	20 %	20 %	60 %	386083194
57	NC_017562	CGGAA	2	10	87455	87464	40 %	0 %	40 %	20 %	386083194
58	NC_017562	TCAAA	2	10	87513	87522	60 %	20 %	0 %	20 %	386083194
59	NC_017562	CATTG	2	10	88498	88507	20 %	40 %	20 %	20 %	386083195
60	NC_017562	CTGGG	2	10	88523	88532	0 %	20 %	60 %	20 %	386083195
61	NC_017562	TGGAA	2	10	89382	89391	40 %	20 %	40 %	0 %	386083195
62	NC_017562	AACTG	2	10	94521	94530	40 %	20 %	20 %	20 %	386083199
63	NC_017562	CCCAA	2	10	102979	102988	40 %	0 %	0 %	60 %	386083206
64	NC_017562	GCCAC	2	10	103217	103226	20 %	0 %	20 %	60 %	386083206
65	NC_017562	ATCAA	2	10	104968	104977	60 %	20 %	0 %	20 %	386083207
66	NC_017562	GCCAC	2	10	106164	106173	20 %	0 %	20 %	60 %	386083208
67	NC_017562	AAACA	2	10	109305	109314	80 %	0 %	0 %	20 %	386083210
68	NC_017562	CAAAC	2	10	110500	110509	60 %	0 %	0 %	40 %	386083211
69	NC_017562	ATCCG	2	10	112471	112480	20 %	20 %	20 %	40 %	386083213
70	NC_017562	AACCG	2	10	114703	114712	40 %	0 %	20 %	40 %	386083214
71	NC_017562	CAGAA	2	10	115069	115078	60 %	0 %	20 %	20 %	386083214
72	NC_017562	CCAAA	2	10	117057	117066	60 %	0 %	0 %	40 %	386083216
73	NC_017562	GCCAC	2	10	117658	117667	20 %	0 %	20 %	60 %	386083217
74	NC_017562	GCGAC	2	10	117901	117910	20 %	0 %	40 %	40 %	386083217
75	NC_017562	CAGCG	2	10	118301	118310	20 %	0 %	40 %	40 %	386083218
76	NC_017562	ACGCA	2	10	118818	118827	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
77	NC_017562	GCAAC	2	10	118918	118927	40 %	0 %	20 %	40 %	386083218
78	NC_017562	CCCTT	2	10	119283	119292	0 %	40 %	0 %	60 %	386083218
79	NC_017562	ACCCA	2	10	119990	119999	40 %	0 %	0 %	60 %	386083218
80	NC_017562	AACGC	2	10	120900	120909	40 %	0 %	20 %	40 %	386083220
81	NC_017562	AACAC	2	10	122074	122083	60 %	0 %	0 %	40 %	386083220
82	NC_017562	CGCCC	2	10	124583	124592	0 %	0 %	20 %	80 %	386083222
83	NC_017562	CATCG	2	10	124823	124832	20 %	20 %	20 %	40 %	386083222
84	NC_017562	AAAAT	2	10	127070	127079	80 %	20 %	0 %	0 %	386083224
85	NC_017562	CACAA	2	10	129133	129142	60 %	0 %	0 %	40 %	386083225
86	NC_017562	AAACT	2	10	130723	130732	60 %	20 %	0 %	20 %	386083226
87	NC_017562	ACACC	2	10	131498	131507	40 %	0 %	0 %	60 %	386083226
88	NC_017562	CATCC	2	10	131768	131777	20 %	20 %	0 %	60 %	386083226
89	NC_017562	CAGCA	2	10	131889	131898	40 %	0 %	20 %	40 %	386083226
90	NC_017562	GCACA	2	10	133075	133084	40 %	0 %	20 %	40 %	386083227
91	NC_017562	GCCTT	2	10	133939	133948	0 %	40 %	20 %	40 %	386083227
92	NC_017562	AGCCA	2	10	139390	139399	40 %	0 %	20 %	40 %	386083232
93	NC_017562	ACGCC	2	10	140100	140109	20 %	0 %	20 %	60 %	386083232
94	NC_017562	CGTTT	2	10	145193	145202	0 %	60 %	20 %	20 %	386083235
95	NC_017562	CTGAT	2	10	145336	145345	20 %	40 %	20 %	20 %	386083235
96	NC_017562	CCGTG	2	10	145850	145859	0 %	20 %	40 %	40 %	386083236
97	NC_017562	CGCCC	2	10	146249	146258	0 %	0 %	20 %	80 %	386083236
98	NC_017562	ACGCA	2	10	146505	146514	40 %	0 %	20 %	40 %	386083236
99	NC_017562	GCAGC	2	10	147334	147343	20 %	0 %	40 %	40 %	386083236
100	NC_017562	CCAAC	2	10	149629	149638	40 %	0 %	0 %	60 %	386083239
101	NC_017562	CAGCC	2	10	150629	150638	20 %	0 %	20 %	60 %	386083240
102	NC_017562	GCTAC	2	10	151034	151043	20 %	20 %	20 %	40 %	386083241
103	NC_017562	TTCCA	2	10	152055	152064	20 %	40 %	0 %	40 %	386083242
104	NC_017562	TTGAT	2	10	152281	152290	20 %	60 %	20 %	0 %	386083242
105	NC_017562	TTTCA	2	10	152999	153008	20 %	60 %	0 %	20 %	386083242
106	NC_017562	CGGAA	2	10	154290	154299	40 %	0 %	40 %	20 %	386083243
107	NC_017562	CCTCC	2	10	155229	155238	0 %	20 %	0 %	80 %	386083244
108	NC_017562	AGGCA	2	10	155327	155336	40 %	0 %	40 %	20 %	386083244
109	NC_017562	TTTGT	2	10	156539	156548	0 %	80 %	20 %	0 %	386083245
110	NC_017562	TGTGA	2	10	157556	157565	20 %	40 %	40 %	0 %	386083247
111	NC_017562	GGCGT	2	10	158066	158075	0 %	20 %	60 %	20 %	386083248
112	NC_017562	GGGCG	2	10	158277	158286	0 %	0 %	80 %	20 %	386083248
113	NC_017562	GCCCC	2	10	158308	158317	0 %	0 %	20 %	80 %	386083248
114	NC_017562	TTGCT	2	10	166517	166526	0 %	60 %	20 %	20 %	386083257
115	NC_017562	CAATT	2	10	168705	168714	40 %	40 %	0 %	20 %	386083260
116	NC_017562	GCAAC	2	10	171202	171211	40 %	0 %	20 %	40 %	386083263
117	NC_017562	GGCGT	2	10	176444	176453	0 %	20 %	60 %	20 %	386083270
118	NC_017562	TTGCG	2	10	177158	177167	0 %	40 %	40 %	20 %	386083271
119	NC_017562	CATCG	2	10	178355	178364	20 %	20 %	20 %	40 %	386083272
120	NC_017562	CACAC	2	10	178690	178699	40 %	0 %	0 %	60 %	386083273
121	NC_017562	CGAGC	2	10	182509	182518	20 %	0 %	40 %	40 %	386083281
122	NC_017562	GTACT	2	10	184281	184290	20 %	40 %	20 %	20 %	386083283
123	NC_017562	GCGAT	2	10	184325	184334	20 %	20 %	40 %	20 %	386083283
124	NC_017562	ACGTG	2	10	185374	185383	20 %	20 %	40 %	20 %	386083283
125	NC_017562	GATCA	2	10	187340	187349	40 %	20 %	20 %	20 %	386083286
126	NC_017562	CATTC	2	10	187795	187804	20 %	40 %	0 %	40 %	386083286
127	NC_017562	CCGTA	2	10	188570	188579	20 %	20 %	20 %	40 %	386083287
128	NC_017562	CCAAA	2	10	189757	189766	60 %	0 %	0 %	40 %	386083288
129	NC_017562	ACGCA	2	10	190565	190574	40 %	0 %	20 %	40 %	386083288
130	NC_017562	GCTAA	2	10	192181	192190	40 %	20 %	20 %	20 %	386083290
131	NC_017562	GGCAC	2	10	194315	194324	20 %	0 %	40 %	40 %	386083292
132	NC_017562	CAATC	2	10	194819	194828	40 %	20 %	0 %	40 %	386083293
133	NC_017562	ACACC	2	10	195457	195466	40 %	0 %	0 %	60 %	386083293
134	NC_017562	TGCCC	2	10	195665	195674	0 %	20 %	20 %	60 %	386083293
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251	NC_017562	CCTTG	2	10	357864	357873	0 %	40 %	20 %	40 %	386083433
252	NC_017562	TCGTG	2	10	358155	358164	0 %	40 %	40 %	20 %	386083433
253	NC_017562	TCGTG	2	10	358707	358716	0 %	40 %	40 %	20 %	386083433
254	NC_017562	CCTTG	2	10	358914	358923	0 %	40 %	20 %	40 %	386083433
255	NC_017562	TCGTG	2	10	359205	359214	0 %	40 %	40 %	20 %	386083433
256	NC_017562	CATCC	2	10	359760	359769	20 %	20 %	0 %	60 %	386083433
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259	NC_017562	CTGAA	2	10	361590	361599	40 %	20 %	20 %	20 %	386083433
260	NC_017562	AAGAA	2	10	361833	361842	80 %	0 %	20 %	0 %	386083434
261	NC_017562	AGAAC	2	10	362137	362146	60 %	0 %	20 %	20 %	386083434
262	NC_017562	CATCT	2	10	363314	363323	20 %	40 %	0 %	40 %	386083437
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265	NC_017562	CAATC	2	10	366971	366980	40 %	20 %	0 %	40 %	386083441
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383	NC_017562	CGTAT	2	10	560664	560673	20 %	40 %	20 %	20 %	386083623
384	NC_017562	GATTG	2	10	563443	563452	20 %	40 %	40 %	0 %	386083626
385	NC_017562	CACTG	2	10	567269	567278	20 %	20 %	20 %	40 %	386083628
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389	NC_017562	CGAAT	2	10	577229	577238	40 %	20 %	20 %	20 %	386083635
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499	NC_017562	ACACC	2	10	737564	737573	40 %	0 %	0 %	60 %	386083778
500	NC_017562	TGCAC	2	10	740643	740652	20 %	20 %	20 %	40 %	386083779

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