MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	CTTTG	2	10	554	563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017561	AGGGG	2	10	1245	1254	20 %	0 %	80 %	0 %	386085389
3	NC_017561	GCCTG	2	10	3857	3866	0 %	20 %	40 %	40 %	386085390
4	NC_017561	TCACG	2	10	4013	4022	20 %	20 %	20 %	40 %	386085391
5	NC_017561	ACCAA	2	10	5167	5176	60 %	0 %	0 %	40 %	386085391
6	NC_017561	TTGAA	2	10	6170	6179	40 %	40 %	20 %	0 %	386085393
7	NC_017561	ATTGA	2	10	6412	6421	40 %	40 %	20 %	0 %	386085393
8	NC_017561	CGTTG	2	10	12387	12396	0 %	40 %	40 %	20 %	386085399
9	NC_017561	TTGCA	2	10	14078	14087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017561	GCTGC	2	10	14460	14469	0 %	20 %	40 %	40 %	386085404
11	NC_017561	GCAGC	2	10	16896	16905	20 %	0 %	40 %	40 %	386085408
12	NC_017561	TCTAA	2	10	17291	17300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017561	CGAAA	2	10	19712	19721	60 %	0 %	20 %	20 %	386085412
14	NC_017561	GTGAA	2	10	20613	20622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017561	ATTTT	2	10	21086	21095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017561	TGCAG	2	10	22776	22785	20 %	20 %	40 %	20 %	386085417
17	NC_017561	ATTAT	2	10	23330	23339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017561	GTTGG	2	10	25762	25771	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017561	TCATG	2	10	25842	25851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.