MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	ACGA	2	8	1135	1142	50 %	0 %	25 %	25 %	386085389
2	NC_017561	TGCT	2	8	1209	1216	0 %	50 %	25 %	25 %	386085389
3	NC_017561	CGAA	2	8	1994	2001	50 %	0 %	25 %	25 %	386085389
4	NC_017561	ATGG	2	8	2596	2603	25 %	25 %	50 %	0 %	386085389
5	NC_017561	CAGG	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	386085389
6	NC_017561	TGGA	2	8	3165	3172	25 %	25 %	50 %	0 %	386085390
7	NC_017561	ATCA	2	8	3404	3411	50 %	25 %	0 %	25 %	386085390
8	NC_017561	GCAG	2	8	3668	3675	25 %	0 %	50 %	25 %	386085390
9	NC_017561	GGGA	2	8	4068	4075	25 %	0 %	75 %	0 %	386085391
10	NC_017561	TTGA	2	8	4143	4150	25 %	50 %	25 %	0 %	386085391
11	NC_017561	TCAA	2	8	4426	4433	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
12	NC_017561	TCAA	2	8	5017	5024	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
13	NC_017561	GATG	2	8	5098	5105	25 %	25 %	50 %	0 %	386085391
14	NC_017561	AATC	2	8	5282	5289	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
15	NC_017561	GTTT	2	8	5451	5458	0 %	75 %	25 %	0 %	386085392
16	NC_017561	GTTT	2	8	5788	5795	0 %	75 %	25 %	0 %	386085392
17	NC_017561	CCAA	2	8	6471	6478	50 %	0 %	0 %	50 %	386085393
18	NC_017561	TGCT	2	8	6769	6776	0 %	50 %	25 %	25 %	386085393
19	NC_017561	ATCA	2	8	7575	7582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017561	AATC	2	8	8584	8591	50 %	25 %	0 %	25 %	386085396
21	NC_017561	AGGC	2	8	9129	9136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017561	GCAG	2	8	9434	9441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017561	CACC	2	8	9951	9958	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017561	TTGC	2	8	10320	10327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017561	GAAC	2	8	10457	10464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017561	ACTG	2	8	10961	10968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017561	TCAT	2	8	11083	11090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017561	GAAT	2	8	11102	11109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017561	GAAT	2	8	11366	11373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017561	CCCA	2	8	11902	11909	25 %	0 %	0 %	75 %	386085398
31	NC_017561	ACCA	2	8	11981	11988	50 %	0 %	0 %	50 %	386085398
32	NC_017561	CCAT	2	8	12620	12627	25 %	25 %	0 %	50 %	386085399
33	NC_017561	CTTT	2	8	12713	12720	0 %	75 %	0 %	25 %	386085400
34	NC_017561	AATA	2	8	12771	12778	75 %	25 %	0 %	0 %	386085400
35	NC_017561	AAGC	2	8	13983	13990	50 %	0 %	25 %	25 %	386085403
36	NC_017561	TTGC	2	8	14292	14299	0 %	50 %	25 %	25 %	386085404
37	NC_017561	TGCC	2	8	14496	14503	0 %	25 %	25 %	50 %	386085404
38	NC_017561	ATCC	2	8	14545	14552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017561	GAAA	2	8	14651	14658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017561	TCCT	2	8	14744	14751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017561	GAAA	2	8	15996	16003	75 %	0 %	25 %	0 %	386085407
42	NC_017561	CGGG	2	8	16023	16030	0 %	0 %	75 %	25 %	386085407
43	NC_017561	CATC	2	8	16437	16444	25 %	25 %	0 %	50 %	386085408
44	NC_017561	GCAA	2	8	16627	16634	50 %	0 %	25 %	25 %	386085408
45	NC_017561	CGAA	2	8	17977	17984	50 %	0 %	25 %	25 %	386085409
46	NC_017561	AAGC	2	8	18153	18160	50 %	0 %	25 %	25 %	386085409
47	NC_017561	AATA	2	8	20276	20283	75 %	25 %	0 %	0 %	386085413
48	NC_017561	TTCC	2	8	20286	20293	0 %	50 %	0 %	50 %	386085413
49	NC_017561	TTCC	2	8	20383	20390	0 %	50 %	0 %	50 %	386085413
50	NC_017561	TTTC	2	8	20424	20431	0 %	75 %	0 %	25 %	386085413
51	NC_017561	ATTT	2	8	20432	20439	25 %	75 %	0 %	0 %	386085413
52	NC_017561	CATC	2	8	20535	20542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017561	CTTT	2	8	20728	20735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017561	AATT	2	8	21117	21124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017561	AAAT	2	8	21929	21936	75 %	25 %	0 %	0 %	386085415
56	NC_017561	GCCA	2	8	22023	22030	25 %	0 %	25 %	50 %	386085416
57	NC_017561	CTGA	2	8	22231	22238	25 %	25 %	25 %	25 %	386085417
58	NC_017561	GTGG	2	8	22324	22331	0 %	25 %	75 %	0 %	386085417
59	NC_017561	GCAG	2	8	22473	22480	25 %	0 %	50 %	25 %	386085417
60	NC_017561	AACC	2	8	22701	22708	50 %	0 %	0 %	50 %	386085417
61	NC_017561	AGGG	2	8	23262	23269	25 %	0 %	75 %	0 %	386085417
62	NC_017561	CTCG	2	8	23872	23879	0 %	25 %	25 %	50 %	386085419
63	NC_017561	AAAT	2	8	24551	24558	75 %	25 %	0 %	0 %	386085420
64	NC_017561	TCGT	2	8	24861	24868	0 %	50 %	25 %	25 %	386085420
65	NC_017561	CCAT	2	8	25124	25131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017561	CCAA	2	8	25265	25272	50 %	0 %	0 %	50 %	386085421
67	NC_017561	GTGC	2	8	25335	25342	0 %	25 %	50 %	25 %	386085421
68	NC_017561	TTCT	2	8	25462	25469	0 %	75 %	0 %	25 %	386085421
69	NC_017561	TTGT	2	8	25639	25646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.