MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	CCG	2	6	827	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
2	NC_017561	CCA	2	6	902	907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
3	NC_017561	CGC	2	6	924	929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
4	NC_017561	GAC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
5	NC_017561	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
6	NC_017561	TGA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
7	NC_017561	CTT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
8	NC_017561	ATC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
9	NC_017561	CAT	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
10	NC_017561	CGT	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
11	NC_017561	TCG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
12	NC_017561	CAG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
13	NC_017561	TGT	2	6	1688	1693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085389
14	NC_017561	ATG	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
15	NC_017561	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
16	NC_017561	AGC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
17	NC_017561	AAG	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
18	NC_017561	CTG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
19	NC_017561	GCT	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
20	NC_017561	ATG	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
21	NC_017561	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
22	NC_017561	CAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
23	NC_017561	CCT	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085389
24	NC_017561	ACC	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
25	NC_017561	GAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
26	NC_017561	ATC	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
27	NC_017561	GTA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
28	NC_017561	CGC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
29	NC_017561	GCA	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
30	NC_017561	ATG	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
31	NC_017561	CTT	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
32	NC_017561	GCG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085389
33	NC_017561	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085390
34	NC_017561	AAC	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
35	NC_017561	GTC	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
36	NC_017561	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085390
37	NC_017561	TCA	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
38	NC_017561	CGT	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
39	NC_017561	GCC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085390
40	NC_017561	TCA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
41	NC_017561	GCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085390
42	NC_017561	CTT	2	6	3746	3751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085390
43	NC_017561	CAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
44	NC_017561	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
45	NC_017561	CCA	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
46	NC_017561	ACC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
47	NC_017561	ATG	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085391
48	NC_017561	GTT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085391
49	NC_017561	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
50	NC_017561	GCT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
51	NC_017561	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085391
52	NC_017561	TGC	3	9	4717	4725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
53	NC_017561	GAA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085391
54	NC_017561	GTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085391
55	NC_017561	TGC	3	9	4858	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
56	NC_017561	GCA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
57	NC_017561	GCA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
58	NC_017561	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
59	NC_017561	TTC	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
60	NC_017561	CTT	3	9	4989	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
61	NC_017561	ATT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085391
62	NC_017561	CCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
63	NC_017561	CAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
64	NC_017561	GAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
65	NC_017561	GAA	2	6	5516	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
66	NC_017561	TCG	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085392
67	NC_017561	GCG	2	6	5580	5585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085392
68	NC_017561	CAC	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085392
69	NC_017561	GCA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085392
70	NC_017561	TCT	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085392
71	NC_017561	TGT	2	6	5848	5853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
72	NC_017561	CAA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
73	NC_017561	AGA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
74	NC_017561	TTG	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
75	NC_017561	TGC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085393
76	NC_017561	TCA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
77	NC_017561	AGT	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085393
78	NC_017561	TTG	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085393
79	NC_017561	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
80	NC_017561	AGT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085393
81	NC_017561	CCA	2	6	6603	6608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085393
82	NC_017561	GCT	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085393
83	NC_017561	TGT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085394
84	NC_017561	CAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085394
85	NC_017561	GAT	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085394
86	NC_017561	TAG	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085395
87	NC_017561	CTG	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085395
88	NC_017561	TGA	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085395
89	NC_017561	AAC	2	6	8401	8406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085396
90	NC_017561	CTC	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085396
91	NC_017561	CGG	2	6	8443	8448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085396
92	NC_017561	GCC	2	6	8565	8570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085396
93	NC_017561	TGC	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
94	NC_017561	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085396
95	NC_017561	TGC	2	6	8883	8888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
96	NC_017561	CTG	2	6	8903	8908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085396
97	NC_017561	TTC	2	6	9039	9044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085396
98	NC_017561	GTT	2	6	11501	11506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085397
99	NC_017561	CCG	2	6	11525	11530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085397
100	NC_017561	AAG	2	6	11560	11565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085397
101	NC_017561	CAA	2	6	11682	11687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085397
102	NC_017561	CCA	2	6	11856	11861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085398
103	NC_017561	CAC	2	6	11872	11877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085398
104	NC_017561	TCT	2	6	11926	11931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085398
105	NC_017561	ACC	2	6	12041	12046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085398
106	NC_017561	TCC	2	6	12050	12055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085398
107	NC_017561	GAC	2	6	12075	12080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085398
108	NC_017561	GTA	2	6	12081	12086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085398
109	NC_017561	ATG	2	6	12110	12115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085398
110	NC_017561	ATT	2	6	12131	12136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085398
111	NC_017561	TTC	2	6	12208	12213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085399
112	NC_017561	AGC	2	6	12337	12342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085399
113	NC_017561	TCG	2	6	12344	12349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085399
114	NC_017561	ATC	2	6	12502	12507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085399
115	NC_017561	AAT	2	6	12584	12589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085399
116	NC_017561	TTC	2	6	12604	12609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085399
117	NC_017561	CAA	2	6	12665	12670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085400
118	NC_017561	TGA	2	6	12765	12770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085400
119	NC_017561	GAA	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085401
120	NC_017561	ATC	2	6	12963	12968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085401
121	NC_017561	CGT	2	6	12985	12990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085401
122	NC_017561	GCA	3	9	13495	13503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085402
123	NC_017561	AAG	2	6	13575	13580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085402
124	NC_017561	TAA	2	6	13594	13599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386085402
125	NC_017561	TGT	2	6	13780	13785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085403
126	NC_017561	GTG	2	6	13881	13886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085403
127	NC_017561	TGA	2	6	13903	13908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
128	NC_017561	ATG	2	6	13911	13916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
129	NC_017561	ATG	2	6	13994	13999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
130	NC_017561	CGC	2	6	14135	14140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085404
131	NC_017561	CAA	2	6	14200	14205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085404
132	NC_017561	ATG	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085404
133	NC_017561	ATC	2	6	14236	14241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085404
134	NC_017561	CAC	2	6	14259	14264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085404
135	NC_017561	AGA	2	6	14335	14340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085404
136	NC_017561	CCA	2	6	14347	14352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085404
137	NC_017561	CGG	2	6	14395	14400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085404
138	NC_017561	CAG	2	6	14415	14420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085404
139	NC_017561	TTC	2	6	14428	14433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085404
140	NC_017561	AAG	2	6	14523	14528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085404
141	NC_017561	CGG	2	6	14983	14988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085405
142	NC_017561	TGC	2	6	15032	15037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085405
143	NC_017561	TGC	2	6	15110	15115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085405
144	NC_017561	ACG	2	6	15209	15214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085405
145	NC_017561	CTT	2	6	15249	15254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085406
146	NC_017561	TCT	2	6	15320	15325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085406
147	NC_017561	GTC	2	6	15328	15333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085406
148	NC_017561	CCA	2	6	15354	15359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085406
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150	NC_017561	TCA	2	6	15419	15424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085406
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153	NC_017561	GTG	2	6	15901	15906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085407
154	NC_017561	GCC	2	6	16038	16043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085407
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159	NC_017561	GCA	2	6	16297	16302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085408
160	NC_017561	GCG	2	6	16335	16340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085408
161	NC_017561	CAG	2	6	16517	16522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085408
162	NC_017561	AAG	2	6	16574	16579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085408
163	NC_017561	ACG	2	6	16606	16611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085408
164	NC_017561	CGA	2	6	16684	16689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085408
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167	NC_017561	GCC	2	6	17010	17015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085408
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211	NC_017561	CTT	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085417
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215	NC_017561	GTT	2	6	22620	22625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085417
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247	NC_017561	TCA	2	6	24831	24836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085420
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250	NC_017561	GAA	2	6	25217	25222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085421
251	NC_017561	TAC	2	6	25232	25237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085421
252	NC_017561	TGC	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085421
253	NC_017561	TCA	2	6	25296	25301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085421
254	NC_017561	TGA	2	6	25354	25359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085421
255	NC_017561	CGA	2	6	25375	25380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085421

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.