MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	GT	3	6	11	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017561	GA	3	6	3793	3798	50 %	0 %	50 %	0 %	386085390
3	NC_017561	CA	3	6	4354	4359	50 %	0 %	0 %	50 %	386085391
4	NC_017561	GC	3	6	5411	5416	0 %	0 %	50 %	50 %	386085392
5	NC_017561	GT	3	6	5970	5975	0 %	50 %	50 %	0 %	386085392
6	NC_017561	AT	3	6	7360	7365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017561	TG	3	6	8088	8093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017561	GC	3	6	9153	9158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017561	TC	3	6	9768	9773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017561	AG	3	6	10900	10905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017561	CT	3	6	11068	11073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017561	AG	3	6	11077	11082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017561	GT	3	6	12677	12682	0 %	50 %	50 %	0 %	386085400
14	NC_017561	GA	3	6	13542	13547	50 %	0 %	50 %	0 %	386085402
15	NC_017561	AT	3	6	13557	13562	50 %	50 %	0 %	0 %	386085402
16	NC_017561	AT	3	6	13861	13866	50 %	50 %	0 %	0 %	386085403
17	NC_017561	GT	3	6	13917	13922	0 %	50 %	50 %	0 %	386085403
18	NC_017561	GT	3	6	15742	15747	0 %	50 %	50 %	0 %	386085407
19	NC_017561	TG	3	6	16483	16488	0 %	50 %	50 %	0 %	386085408
20	NC_017561	AG	3	6	18194	18199	50 %	0 %	50 %	0 %	386085409
21	NC_017561	CG	3	6	18207	18212	0 %	0 %	50 %	50 %	386085409
22	NC_017561	GC	3	6	18263	18268	0 %	0 %	50 %	50 %	386085409
23	NC_017561	GC	3	6	18324	18329	0 %	0 %	50 %	50 %	386085409
24	NC_017561	AC	3	6	18904	18909	50 %	0 %	0 %	50 %	386085410
25	NC_017561	AC	3	6	20266	20271	50 %	0 %	0 %	50 %	386085413
26	NC_017561	CT	3	6	20977	20982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017561	GA	3	6	21581	21586	50 %	0 %	50 %	0 %	386085415
28	NC_017561	CA	3	6	23107	23112	50 %	0 %	0 %	50 %	386085417
29	NC_017561	TC	3	6	24382	24387	0 %	50 %	0 %	50 %	386085420
30	NC_017561	GT	4	8	24629	24636	0 %	50 %	50 %	0 %	386085420
31	NC_017561	CA	3	6	25363	25368	50 %	0 %	0 %	50 %	386085421
32	NC_017561	GT	3	6	25543	25548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017561	GT	3	6	25971	25976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.