MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017560	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017560	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017560	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017560	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017560	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017560	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017560	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017560	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017560	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017560	TAAG	2	8	14775	14782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017560	ATTA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017560	AAAG	2	8	14865	14872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017560	TTAT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017560	TAAG	2	8	15230	15237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017560	AATA	2	8	15660	15667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017560	GTAA	2	8	15808	15815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017560	AGCA	2	8	16090	16097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017560	AATT	2	8	16703	16710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017560	AAAG	2	8	17173	17180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017560	ATTC	2	8	17266	17273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017560	TTCA	2	8	18318	18325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017560	TAAA	2	8	18957	18964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017560	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017560	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017560	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017560	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017560	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017560	ATAG	2	8	20091	20098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017560	ATTA	2	8	20195	20202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017560	ATCA	2	8	20757	20764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017560	AACA	2	8	21118	21125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017560	GTAT	2	8	21157	21164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017560	TAAT	2	8	22430	22437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017560	TCTT	2	8	25045	25052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017560	TAAA	2	8	26865	26872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017560	ATTT	3	12	28779	28790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017560	TACA	2	8	28921	28928	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017560	ATAA	2	8	29096	29103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017560	AATA	2	8	29726	29733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017560	TTTG	2	8	31047	31054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017560	ATTA	2	8	31257	31264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017560	ATAG	2	8	31396	31403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017560	TTTG	2	8	31486	31493	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017560	AAAT	2	8	32615	32622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017560	TCGT	2	8	36097	36104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017560	AATC	2	8	36408	36415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017560	TGAT	2	8	36480	36487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017560	TCAA	2	8	37990	37997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017560	ATGT	2	8	38050	38057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017560	TTAA	2	8	38316	38323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017560	TTAT	2	8	38382	38389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017560	AATA	2	8	41070	41077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017560	AAAT	2	8	41136	41143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017560	TAAG	2	8	44395	44402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017560	TAAT	2	8	49494	49501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017560	TAAT	2	8	52809	52816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017560	TAAT	2	8	54290	54297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017560	GTTG	2	8	57765	57772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017560	TTCT	2	8	58054	58061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017560	ATTA	2	8	58466	58473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017560	TAGT	2	8	59137	59144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017560	TTCT	2	8	59227	59234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017560	TTTG	2	8	59247	59254	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017560	AAAT	2	8	59291	59298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017560	TAAT	2	8	70114	70121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017560	AAAT	2	8	70646	70653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017560	TCTA	2	8	70923	70930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017560	TCAA	2	8	75604	75611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017560	TAAA	2	8	78009	78016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017560	AAAT	2	8	78017	78024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017560	TTAA	2	8	79617	79624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017560	ATTA	2	8	79799	79806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017560	ATTT	2	8	84827	84834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017560	GAAC	2	8	88041	88048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017560	TTTC	2	8	88068	88075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017560	ATAA	2	8	89049	89056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017560	TGTT	2	8	89257	89264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017560	TGAT	2	8	89410	89417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017560	TTGT	2	8	89869	89876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017560	ATCT	2	8	90133	90140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017560	CTTG	2	8	90639	90646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017560	TATT	2	8	90696	90703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017560	ATAA	2	8	90985	90992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017560	TCAT	2	8	91005	91012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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91	NC_017560	ATTT	2	8	92551	92558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017560	TTAT	2	8	92905	92912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_017560	ATCA	2	8	106228	106235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017560	TAAC	2	8	109690	109697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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115	NC_017560	ATTT	2	8	111275	111282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017560	CATA	2	8	112272	112279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017560	TAAA	2	8	113248	113255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017560	TATT	2	8	116459	116466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017560	GTAA	2	8	116557	116564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017560	GTCA	2	8	124881	124888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017560	GTAA	2	8	124919	124926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017560	CTTA	2	8	131303	131310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017560	TACT	2	8	131340	131347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017560	TTAC	2	8	131601	131608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017560	TAAC	2	8	131647	131654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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132	NC_017560	ACTT	2	8	142387	142394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017560	ACTT	2	8	148412	148419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017560	TTTA	2	8	152233	152240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017560	TAAG	2	8	153125	153132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_017560	TAAT	2	8	156193	156200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017560	AATA	2	8	156216	156223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017560	TAAA	2	8	157346	157353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017560	TAAT	2	8	159341	159348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017560	CTTT	2	8	159923	159930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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