MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 2489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017560	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	386081835
2	NC_017560	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	386081835
3	NC_017560	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	386081837
4	NC_017560	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	386081838
5	NC_017560	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	386081838
6	NC_017560	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	386081838
7	NC_017560	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	386081838
8	NC_017560	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	386081839
9	NC_017560	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	386081839
10	NC_017560	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	386081839
11	NC_017560	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	386081839
12	NC_017560	ACCT	2	8	6585	6592	25 %	25 %	0 %	50 %	386081840
13	NC_017560	ACCA	2	8	6669	6676	50 %	0 %	0 %	50 %	386081840
14	NC_017560	TAAA	2	8	6677	6684	75 %	25 %	0 %	0 %	386081840
15	NC_017560	ATAA	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	386081840
16	NC_017560	CCTG	2	8	7898	7905	0 %	25 %	25 %	50 %	386081842
17	NC_017560	CAAT	2	8	9863	9870	50 %	25 %	0 %	25 %	386081843
18	NC_017560	CATG	2	8	9886	9893	25 %	25 %	25 %	25 %	386081843
19	NC_017560	ATGA	2	8	9962	9969	50 %	25 %	25 %	0 %	386081843
20	NC_017560	TTGG	2	8	10134	10141	0 %	50 %	50 %	0 %	386081843
21	NC_017560	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	386081843
22	NC_017560	TAAA	2	8	10958	10965	75 %	25 %	0 %	0 %	386081844
23	NC_017560	TAAA	2	8	10985	10992	75 %	25 %	0 %	0 %	386081844
24	NC_017560	AAAG	2	8	11262	11269	75 %	0 %	25 %	0 %	386081844
25	NC_017560	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	386081844
26	NC_017560	TAAT	2	8	12446	12453	50 %	50 %	0 %	0 %	386081846
27	NC_017560	GCTT	2	8	12461	12468	0 %	50 %	25 %	25 %	386081846
28	NC_017560	AATA	2	8	13374	13381	75 %	25 %	0 %	0 %	386081847
29	NC_017560	GCTC	2	8	13578	13585	0 %	25 %	25 %	50 %	386081847
30	NC_017560	TGAT	2	8	21850	21857	25 %	50 %	25 %	0 %	386081852
31	NC_017560	ATAC	2	8	22476	22483	50 %	25 %	0 %	25 %	386081854
32	NC_017560	AACT	2	8	22664	22671	50 %	25 %	0 %	25 %	386081854
33	NC_017560	AAAT	2	8	22898	22905	75 %	25 %	0 %	0 %	386081854
34	NC_017560	CACT	2	8	22994	23001	25 %	25 %	0 %	50 %	386081854
35	NC_017560	AAGT	2	8	23047	23054	50 %	25 %	25 %	0 %	386081854
36	NC_017560	ATTA	2	8	23429	23436	50 %	50 %	0 %	0 %	386081855
37	NC_017560	ATTT	2	8	23488	23495	25 %	75 %	0 %	0 %	386081856
38	NC_017560	TATT	2	8	23735	23742	25 %	75 %	0 %	0 %	386081856
39	NC_017560	AAAT	2	8	25636	25643	75 %	25 %	0 %	0 %	386081858
40	NC_017560	TTAA	2	8	27112	27119	50 %	50 %	0 %	0 %	386081859
41	NC_017560	TAGT	2	8	27275	27282	25 %	50 %	25 %	0 %	386081859
42	NC_017560	ATTT	2	8	27294	27301	25 %	75 %	0 %	0 %	386081859
43	NC_017560	TTGC	2	8	27569	27576	0 %	50 %	25 %	25 %	386081859
44	NC_017560	ATTT	2	8	27719	27726	25 %	75 %	0 %	0 %	386081859
45	NC_017560	TTCC	2	8	27809	27816	0 %	50 %	0 %	50 %	386081859
46	NC_017560	GCTT	2	8	27947	27954	0 %	50 %	25 %	25 %	386081859
47	NC_017560	ATTT	2	8	31812	31819	25 %	75 %	0 %	0 %	386081862
48	NC_017560	TTCT	2	8	31854	31861	0 %	75 %	0 %	25 %	386081862
49	NC_017560	TATT	2	8	32716	32723	25 %	75 %	0 %	0 %	386081863
50	NC_017560	ATTT	2	8	32857	32864	25 %	75 %	0 %	0 %	386081863
51	NC_017560	ATTT	2	8	33297	33304	25 %	75 %	0 %	0 %	386081864
52	NC_017560	AAAT	2	8	33321	33328	75 %	25 %	0 %	0 %	386081864
53	NC_017560	ATAA	2	8	33797	33804	75 %	25 %	0 %	0 %	386081864
54	NC_017560	AGCA	2	8	34285	34292	50 %	0 %	25 %	25 %	386081865
55	NC_017560	TTTC	2	8	34953	34960	0 %	75 %	0 %	25 %	386081866
56	NC_017560	ATTT	2	8	35818	35825	25 %	75 %	0 %	0 %	386081866
57	NC_017560	TTGA	2	8	36660	36667	25 %	50 %	25 %	0 %	386081867
58	NC_017560	AGTA	2	8	36779	36786	50 %	25 %	25 %	0 %	386081867
59	NC_017560	TACT	2	8	37129	37136	25 %	50 %	0 %	25 %	386081867
60	NC_017560	TAAA	2	8	38592	38599	75 %	25 %	0 %	0 %	386081868
61	NC_017560	GAGT	2	8	39886	39893	25 %	25 %	50 %	0 %	386081868
62	NC_017560	ATTA	2	8	42011	42018	50 %	50 %	0 %	0 %	386081869
63	NC_017560	ACTT	2	8	42959	42966	25 %	50 %	0 %	25 %	386081870
64	NC_017560	AATA	2	8	43448	43455	75 %	25 %	0 %	0 %	386081870
65	NC_017560	TAAA	2	8	43504	43511	75 %	25 %	0 %	0 %	386081870
66	NC_017560	AAAC	2	8	43801	43808	75 %	0 %	0 %	25 %	386081870
67	NC_017560	ATTT	3	12	43816	43827	25 %	75 %	0 %	0 %	386081870
68	NC_017560	TTTA	2	8	44003	44010	25 %	75 %	0 %	0 %	386081870
69	NC_017560	GTTT	2	8	44787	44794	0 %	75 %	25 %	0 %	386081871
70	NC_017560	AGAA	2	8	45039	45046	75 %	0 %	25 %	0 %	386081871
71	NC_017560	AAAG	2	8	45419	45426	75 %	0 %	25 %	0 %	386081872
72	NC_017560	TAAA	2	8	45486	45493	75 %	25 %	0 %	0 %	386081872
73	NC_017560	AAGA	2	8	46464	46471	75 %	0 %	25 %	0 %	386081874
74	NC_017560	TAAT	2	8	46971	46978	50 %	50 %	0 %	0 %	386081874
75	NC_017560	ATTA	2	8	47047	47054	50 %	50 %	0 %	0 %	386081874
76	NC_017560	TTAT	2	8	47242	47249	25 %	75 %	0 %	0 %	386081874
77	NC_017560	GAAT	2	8	47819	47826	50 %	25 %	25 %	0 %	386081875
78	NC_017560	CTTA	2	8	48093	48100	25 %	50 %	0 %	25 %	386081875
79	NC_017560	ATGG	2	8	48373	48380	25 %	25 %	50 %	0 %	386081875
80	NC_017560	TATG	2	8	49101	49108	25 %	50 %	25 %	0 %	386081875
81	NC_017560	GCTA	2	8	51872	51879	25 %	25 %	25 %	25 %	386081877
82	NC_017560	AATT	2	8	51968	51975	50 %	50 %	0 %	0 %	386081877
83	NC_017560	CGAC	2	8	51991	51998	25 %	0 %	25 %	50 %	386081877
84	NC_017560	AAAT	2	8	52065	52072	75 %	25 %	0 %	0 %	386081878
85	NC_017560	ATAA	2	8	52428	52435	75 %	25 %	0 %	0 %	386081878
86	NC_017560	ATAA	2	8	52757	52764	75 %	25 %	0 %	0 %	386081878
87	NC_017560	TGTT	2	8	53036	53043	0 %	75 %	25 %	0 %	386081880
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89	NC_017560	TTAT	2	8	53172	53179	25 %	75 %	0 %	0 %	386081880
90	NC_017560	AACT	2	8	53561	53568	50 %	25 %	0 %	25 %	386081880
91	NC_017560	TAAT	2	8	54312	54319	50 %	50 %	0 %	0 %	386081881
92	NC_017560	TTGG	2	8	54357	54364	0 %	50 %	50 %	0 %	386081881
93	NC_017560	TAAA	2	8	54435	54442	75 %	25 %	0 %	0 %	386081881
94	NC_017560	TAGT	2	8	54678	54685	25 %	50 %	25 %	0 %	386081881
95	NC_017560	ATTT	2	8	54768	54775	25 %	75 %	0 %	0 %	386081881
96	NC_017560	TAAG	2	8	55035	55042	50 %	25 %	25 %	0 %	386081881
97	NC_017560	TGTA	2	8	55638	55645	25 %	50 %	25 %	0 %	386081881
98	NC_017560	ATCT	2	8	55689	55696	25 %	50 %	0 %	25 %	386081881
99	NC_017560	TTAT	2	8	55880	55887	25 %	75 %	0 %	0 %	386081881
100	NC_017560	TAAT	2	8	55975	55982	50 %	50 %	0 %	0 %	386081881
101	NC_017560	TAGT	2	8	56291	56298	25 %	50 %	25 %	0 %	386081882
102	NC_017560	ATAG	2	8	57266	57273	50 %	25 %	25 %	0 %	386081884
103	NC_017560	TCTT	2	8	57482	57489	0 %	75 %	0 %	25 %	386081884
104	NC_017560	TATT	2	8	58689	58696	25 %	75 %	0 %	0 %	386081885
105	NC_017560	AAGA	2	8	59350	59357	75 %	0 %	25 %	0 %	386081886
106	NC_017560	GATG	2	8	60024	60031	25 %	25 %	50 %	0 %	386081886
107	NC_017560	TAAA	2	8	60765	60772	75 %	25 %	0 %	0 %	386081886
108	NC_017560	TAAA	2	8	60789	60796	75 %	25 %	0 %	0 %	386081886
109	NC_017560	TTGG	2	8	61065	61072	0 %	50 %	50 %	0 %	386081887
110	NC_017560	TCAA	2	8	61258	61265	50 %	25 %	0 %	25 %	386081887
111	NC_017560	CTCA	2	8	61292	61299	25 %	25 %	0 %	50 %	386081887
112	NC_017560	TGTT	2	8	61618	61625	0 %	75 %	25 %	0 %	386081887
113	NC_017560	TGTT	2	8	61635	61642	0 %	75 %	25 %	0 %	386081887
114	NC_017560	TATG	2	8	61827	61834	25 %	50 %	25 %	0 %	386081887
115	NC_017560	TGCC	2	8	63258	63265	0 %	25 %	25 %	50 %	386081889
116	NC_017560	AAAT	2	8	63801	63808	75 %	25 %	0 %	0 %	386081889
117	NC_017560	TGAT	2	8	63984	63991	25 %	50 %	25 %	0 %	386081889
118	NC_017560	ATTT	2	8	64413	64420	25 %	75 %	0 %	0 %	386081889
119	NC_017560	ATTT	2	8	64583	64590	25 %	75 %	0 %	0 %	386081889
120	NC_017560	AAGT	2	8	64843	64850	50 %	25 %	25 %	0 %	386081890
121	NC_017560	TAAT	2	8	64924	64931	50 %	50 %	0 %	0 %	386081890
122	NC_017560	TGGT	2	8	66991	66998	0 %	50 %	50 %	0 %	386081893
123	NC_017560	AAAC	2	8	67036	67043	75 %	0 %	0 %	25 %	386081893
124	NC_017560	ATGG	2	8	67378	67385	25 %	25 %	50 %	0 %	386081893
125	NC_017560	TGCT	2	8	67414	67421	0 %	50 %	25 %	25 %	386081893
126	NC_017560	ATCA	2	8	68146	68153	50 %	25 %	0 %	25 %	386081893
127	NC_017560	TAGA	2	8	68482	68489	50 %	25 %	25 %	0 %	386081893
128	NC_017560	AAAT	2	8	68793	68800	75 %	25 %	0 %	0 %	386081894
129	NC_017560	TTTA	2	8	68802	68809	25 %	75 %	0 %	0 %	386081894
130	NC_017560	ATTT	2	8	69131	69138	25 %	75 %	0 %	0 %	386081895
131	NC_017560	TGCT	2	8	71932	71939	0 %	50 %	25 %	25 %	386081897
132	NC_017560	AATG	2	8	72258	72265	50 %	25 %	25 %	0 %	386081897
133	NC_017560	TTAT	2	8	72652	72659	25 %	75 %	0 %	0 %	386081897
134	NC_017560	GAAA	2	8	72713	72720	75 %	0 %	25 %	0 %	386081897
135	NC_017560	TAAA	2	8	72724	72731	75 %	25 %	0 %	0 %	386081897
136	NC_017560	AAAG	2	8	73244	73251	75 %	0 %	25 %	0 %	386081898
137	NC_017560	AAAT	2	8	73596	73603	75 %	25 %	0 %	0 %	386081898
138	NC_017560	TAGT	2	8	73608	73615	25 %	50 %	25 %	0 %	386081898
139	NC_017560	ATGA	2	8	73745	73752	50 %	25 %	25 %	0 %	386081898
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