MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 13906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017560	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081835
2	NC_017560	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081835
3	NC_017560	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081835
4	NC_017560	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081835
5	NC_017560	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081835
6	NC_017560	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081835
7	NC_017560	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081835
8	NC_017560	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081835
9	NC_017560	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081835
10	NC_017560	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081835
11	NC_017560	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081836
12	NC_017560	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081836
13	NC_017560	GTG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081836
14	NC_017560	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081836
15	NC_017560	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081836
16	NC_017560	TGT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081836
17	NC_017560	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081836
18	NC_017560	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081836
19	NC_017560	TGC	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081837
20	NC_017560	ATA	3	9	1667	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081837
21	NC_017560	GTA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081837
22	NC_017560	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081837
23	NC_017560	GCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081837
24	NC_017560	GAA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081837
25	NC_017560	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081837
26	NC_017560	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081837
27	NC_017560	AGA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081837
28	NC_017560	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081837
29	NC_017560	GAT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081837
30	NC_017560	ACA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081837
31	NC_017560	TAA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081837
32	NC_017560	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081838
33	NC_017560	TTA	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081838
34	NC_017560	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081838
35	NC_017560	ATA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081838
36	NC_017560	ATG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081838
37	NC_017560	TAA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081838
38	NC_017560	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081838
39	NC_017560	CTC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386081839
40	NC_017560	ATT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
41	NC_017560	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
42	NC_017560	AAG	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
43	NC_017560	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
44	NC_017560	GAA	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
45	NC_017560	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081839
46	NC_017560	TGC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081839
47	NC_017560	TTA	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
48	NC_017560	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081839
49	NC_017560	CAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081839
50	NC_017560	GAT	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
51	NC_017560	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
52	NC_017560	AGC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081839
53	NC_017560	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
54	NC_017560	GCA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081839
55	NC_017560	AGA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
56	NC_017560	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081839
57	NC_017560	TAT	2	6	4013	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
58	NC_017560	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
59	NC_017560	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081839
60	NC_017560	AAT	3	9	4232	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
61	NC_017560	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
62	NC_017560	TGA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
63	NC_017560	ATA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
64	NC_017560	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081839
65	NC_017560	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081839
66	NC_017560	AGA	3	9	4585	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
67	NC_017560	GAA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
68	NC_017560	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
69	NC_017560	GAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
70	NC_017560	TAA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
71	NC_017560	GGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386081839
72	NC_017560	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
73	NC_017560	TAC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081839
74	NC_017560	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
75	NC_017560	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
76	NC_017560	AAG	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081839
77	NC_017560	TTA	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
78	NC_017560	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
79	NC_017560	TAA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
80	NC_017560	TGC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081839
81	NC_017560	ATT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
82	NC_017560	CTA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081839
83	NC_017560	AGT	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
84	NC_017560	ATT	3	9	5489	5497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081839
85	NC_017560	TAA	2	6	5613	5618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
86	NC_017560	TAA	2	6	5685	5690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
87	NC_017560	ATG	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081839
88	NC_017560	AAT	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081839
89	NC_017560	CTA	3	9	6253	6261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081840
90	NC_017560	AAT	2	6	6279	6284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081840
91	NC_017560	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081840
92	NC_017560	CAA	2	6	6338	6343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081840
93	NC_017560	TCT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081840
94	NC_017560	TAC	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081840
95	NC_017560	ATC	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081840
96	NC_017560	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081840
97	NC_017560	ATT	2	6	6571	6576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081840
98	NC_017560	TTA	2	6	6685	6690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081840
99	NC_017560	TAT	2	6	6758	6763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081840
100	NC_017560	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081840
101	NC_017560	TAC	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081840
102	NC_017560	GTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081840
103	NC_017560	CTT	2	6	7217	7222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081841
104	NC_017560	TAG	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081841
105	NC_017560	AGC	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081841
106	NC_017560	TAT	2	6	7368	7373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081841
107	NC_017560	CTA	2	6	7406	7411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081841
108	NC_017560	ACT	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081842
109	NC_017560	ATA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081842
110	NC_017560	CCT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386081842
111	NC_017560	TCC	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386081842
112	NC_017560	ATA	2	6	7913	7918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081842
113	NC_017560	TCT	2	6	7979	7984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081842
114	NC_017560	ATA	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081842
115	NC_017560	TAG	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081842
116	NC_017560	ATT	2	6	8041	8046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081842
117	NC_017560	ATG	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081842
118	NC_017560	CTA	2	6	8136	8141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081842
119	NC_017560	ACG	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081842
120	NC_017560	TCG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081842
121	NC_017560	TGT	2	6	8186	8191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081842
122	NC_017560	TAT	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081842
123	NC_017560	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081842
124	NC_017560	AAT	2	6	8338	8343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081842
125	NC_017560	ATT	2	6	8354	8359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081842
126	NC_017560	TAG	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081842
127	NC_017560	CTT	2	6	8460	8465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081842
128	NC_017560	AGC	2	6	8491	8496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081842
129	NC_017560	CTT	2	6	8565	8570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081842
130	NC_017560	TAG	2	6	8613	8618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081842
131	NC_017560	TAC	2	6	8688	8693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081842
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