MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 2808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017560	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	386081835
2	NC_017560	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	386081835
3	NC_017560	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	386081837
4	NC_017560	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	386081837
5	NC_017560	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	386081838
6	NC_017560	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	386081838
7	NC_017560	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	386081838
8	NC_017560	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	386081838
9	NC_017560	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	386081839
10	NC_017560	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	386081839
11	NC_017560	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	386081839
12	NC_017560	AT	4	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	386081839
13	NC_017560	GA	3	6	4226	4231	50 %	0 %	50 %	0 %	386081839
14	NC_017560	TA	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	386081839
15	NC_017560	AT	3	6	5770	5775	50 %	50 %	0 %	0 %	386081839
16	NC_017560	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017560	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017560	TC	3	6	6786	6791	0 %	50 %	0 %	50 %	386081840
19	NC_017560	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017560	TA	3	6	8302	8307	50 %	50 %	0 %	0 %	386081842
21	NC_017560	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017560	TG	3	6	9911	9916	0 %	50 %	50 %	0 %	386081843
23	NC_017560	GA	3	6	10054	10059	50 %	0 %	50 %	0 %	386081843
24	NC_017560	AT	3	6	10971	10976	50 %	50 %	0 %	0 %	386081844
25	NC_017560	AT	4	8	12049	12056	50 %	50 %	0 %	0 %	386081845
26	NC_017560	TA	3	6	12072	12077	50 %	50 %	0 %	0 %	386081845
27	NC_017560	TA	3	6	12497	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	386081846
28	NC_017560	TA	3	6	12846	12851	50 %	50 %	0 %	0 %	386081846
29	NC_017560	CT	3	6	12937	12942	0 %	50 %	0 %	50 %	386081846
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32	NC_017560	TA	3	6	14404	14409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017560	AT	3	6	14572	14577	50 %	50 %	0 %	0 %	386081848
34	NC_017560	TA	3	6	14600	14605	50 %	50 %	0 %	0 %	386081848
35	NC_017560	AT	3	6	15016	15021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017560	AG	3	6	15862	15867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017560	TA	3	6	16993	16998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017560	AT	3	6	17326	17331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017560	TA	3	6	17501	17506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017560	TA	3	6	18630	18635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017560	AT	3	6	18687	18692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017560	AT	3	6	19694	19699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017560	TA	4	8	19881	19888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017560	AT	3	6	19896	19901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017560	TA	3	6	20452	20457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54	NC_017560	AT	3	6	26007	26012	50 %	50 %	0 %	0 %	386081858
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67	NC_017560	AT	3	6	29604	29609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_017560	TA	3	6	29699	29704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017560	TA	3	6	30103	30108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017560	AT	3	6	30926	30931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_017560	AT	3	6	31463	31468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017560	TA	3	6	31560	31565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_017560	TA	3	6	35196	35201	50 %	50 %	0 %	0 %	386081866
91	NC_017560	AT	3	6	36079	36084	50 %	50 %	0 %	0 %	386081866
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114	NC_017560	AT	4	8	46076	46083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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116	NC_017560	AG	3	6	46475	46480	50 %	0 %	50 %	0 %	386081874
117	NC_017560	TA	3	6	46662	46667	50 %	50 %	0 %	0 %	386081874
118	NC_017560	AT	3	6	47123	47128	50 %	50 %	0 %	0 %	386081874
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121	NC_017560	AG	3	6	49666	49671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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