MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 10649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017559	TCGC	2	8	656	663	0 %	25 %	25 %	50 %	523408233
2	NC_017559	GCTG	2	8	772	779	0 %	25 %	50 %	25 %	523408233
3	NC_017559	GCCC	2	8	830	837	0 %	0 %	25 %	75 %	523408233
4	NC_017559	CGCC	2	8	993	1000	0 %	0 %	25 %	75 %	523408233
5	NC_017559	CGCA	2	8	1376	1383	25 %	0 %	25 %	50 %	523408233
6	NC_017559	CGGC	2	8	1838	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	523408233
7	NC_017559	TCCT	2	8	2454	2461	0 %	50 %	0 %	50 %	523408234
8	NC_017559	GCGG	2	8	2898	2905	0 %	0 %	75 %	25 %	523408234
9	NC_017559	ACCT	2	8	3303	3310	25 %	25 %	0 %	50 %	523408234
10	NC_017559	GCCC	2	8	3445	3452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017559	CGTG	2	8	3986	3993	0 %	25 %	50 %	25 %	523408235
12	NC_017559	GACC	2	8	4287	4294	25 %	0 %	25 %	50 %	523408235
13	NC_017559	CACC	2	8	4509	4516	25 %	0 %	0 %	75 %	523408235
14	NC_017559	CCAG	2	8	5060	5067	25 %	0 %	25 %	50 %	523408235
15	NC_017559	TAGA	2	8	6115	6122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017559	ACCG	2	8	6293	6300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017559	GCGT	2	8	6338	6345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017559	TCAT	2	8	6554	6561	25 %	50 %	0 %	25 %	523408236
19	NC_017559	CGTC	2	8	6615	6622	0 %	25 %	25 %	50 %	523408236
20	NC_017559	TGCT	2	8	7016	7023	0 %	50 %	25 %	25 %	523408236
21	NC_017559	CATC	2	8	7059	7066	25 %	25 %	0 %	50 %	523408236
22	NC_017559	CGTG	2	8	7179	7186	0 %	25 %	50 %	25 %	523408236
23	NC_017559	TGGG	2	8	7788	7795	0 %	25 %	75 %	0 %	523408237
24	NC_017559	AGCG	2	8	9728	9735	25 %	0 %	50 %	25 %	523408240
25	NC_017559	TGAT	2	8	9755	9762	25 %	50 %	25 %	0 %	523408240
26	NC_017559	GGTT	2	8	9832	9839	0 %	50 %	50 %	0 %	523408240
27	NC_017559	TGCG	2	8	9851	9858	0 %	25 %	50 %	25 %	523408240
28	NC_017559	AGCC	2	8	10949	10956	25 %	0 %	25 %	50 %	523408240
29	NC_017559	CGTA	2	8	11158	11165	25 %	25 %	25 %	25 %	523408240
30	NC_017559	GGTA	2	8	11178	11185	25 %	25 %	50 %	0 %	523408240
31	NC_017559	TCCA	2	8	11896	11903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017559	TTCG	2	8	12508	12515	0 %	50 %	25 %	25 %	523408241
33	NC_017559	TTGC	2	8	13573	13580	0 %	50 %	25 %	25 %	523408241
34	NC_017559	AACA	2	8	13672	13679	75 %	0 %	0 %	25 %	523408241
35	NC_017559	TCGG	2	8	15564	15571	0 %	25 %	50 %	25 %	523408244
36	NC_017559	GCTG	2	8	15687	15694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017559	GAAG	2	8	16113	16120	50 %	0 %	50 %	0 %	523408245
38	NC_017559	GTTT	2	8	16217	16224	0 %	75 %	25 %	0 %	523408245
39	NC_017559	GCAG	2	8	16454	16461	25 %	0 %	50 %	25 %	523408245
40	NC_017559	TCGG	2	8	16611	16618	0 %	25 %	50 %	25 %	523408245
41	NC_017559	CATG	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017559	CCCG	2	8	17147	17154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017559	CCTT	2	8	17285	17292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017559	ACAG	2	8	17632	17639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017559	GGGC	2	8	17943	17950	0 %	0 %	75 %	25 %	523408246
46	NC_017559	ACCG	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	523408247
47	NC_017559	AGGA	2	8	18491	18498	50 %	0 %	50 %	0 %	523408247
48	NC_017559	AAGA	2	8	18699	18706	75 %	0 %	25 %	0 %	523408248
49	NC_017559	TTCC	2	8	18782	18789	0 %	50 %	0 %	50 %	523408248
50	NC_017559	GGAC	2	8	18996	19003	25 %	0 %	50 %	25 %	523408248
51	NC_017559	CCGA	2	8	19339	19346	25 %	0 %	25 %	50 %	523408249
52	NC_017559	TCGC	2	8	20497	20504	0 %	25 %	25 %	50 %	523408250
53	NC_017559	CCAC	2	8	21064	21071	25 %	0 %	0 %	75 %	523408250
54	NC_017559	GCTG	2	8	22018	22025	0 %	25 %	50 %	25 %	523408251
55	NC_017559	TGCC	2	8	22207	22214	0 %	25 %	25 %	50 %	523408251
56	NC_017559	CGGT	2	8	23505	23512	0 %	25 %	50 %	25 %	523408251
57	NC_017559	ACGC	2	8	24158	24165	25 %	0 %	25 %	50 %	523408251
58	NC_017559	GCCA	2	8	24312	24319	25 %	0 %	25 %	50 %	523408251
59	NC_017559	GGTG	2	8	24409	24416	0 %	25 %	75 %	0 %	523408251
60	NC_017559	TTCT	2	8	24668	24675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017559	GTAG	2	8	24845	24852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017559	GAGC	2	8	24916	24923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017559	CAAG	2	8	24926	24933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017559	AGAA	2	8	25101	25108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017559	CCGA	2	8	25218	25225	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017559	CTGG	2	8	25257	25264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017559	GCGA	2	8	25503	25510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017559	TGAT	2	8	25516	25523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017559	ATTC	2	8	25880	25887	25 %	50 %	0 %	25 %	523408252
70	NC_017559	CAGC	2	8	25916	25923	25 %	0 %	25 %	50 %	523408252
71	NC_017559	TTGT	2	8	26505	26512	0 %	75 %	25 %	0 %	523408252
72	NC_017559	AGCC	2	8	27208	27215	25 %	0 %	25 %	50 %	523408252
73	NC_017559	TCGG	2	8	27899	27906	0 %	25 %	50 %	25 %	523408253
74	NC_017559	CCGC	2	8	28027	28034	0 %	0 %	25 %	75 %	523408253
75	NC_017559	CTGG	2	8	28786	28793	0 %	25 %	50 %	25 %	523408254
76	NC_017559	CTTG	2	8	29104	29111	0 %	50 %	25 %	25 %	523408254
77	NC_017559	CTGC	2	8	29200	29207	0 %	25 %	25 %	50 %	523408254
78	NC_017559	ACCG	2	8	30120	30127	25 %	0 %	25 %	50 %	523408255
79	NC_017559	TTCA	2	8	30354	30361	25 %	50 %	0 %	25 %	523408255
80	NC_017559	CGCC	2	8	30566	30573	0 %	0 %	25 %	75 %	523408255
81	NC_017559	GGCG	2	8	32326	32333	0 %	0 %	75 %	25 %	523408257
82	NC_017559	GCCT	2	8	32489	32496	0 %	25 %	25 %	50 %	523408257
83	NC_017559	GGTC	2	8	32853	32860	0 %	25 %	50 %	25 %	523408257
84	NC_017559	TCGG	2	8	33388	33395	0 %	25 %	50 %	25 %	523408257
85	NC_017559	CAGG	2	8	33553	33560	25 %	0 %	50 %	25 %	523408257
86	NC_017559	CTTG	2	8	35057	35064	0 %	50 %	25 %	25 %	523408259
87	NC_017559	GCTG	2	8	35750	35757	0 %	25 %	50 %	25 %	523408262
88	NC_017559	GGTC	2	8	36373	36380	0 %	25 %	50 %	25 %	523408263
89	NC_017559	GTCT	2	8	37189	37196	0 %	50 %	25 %	25 %	523408264
90	NC_017559	CCAA	2	8	37237	37244	50 %	0 %	0 %	50 %	523408264
91	NC_017559	GAGT	2	8	38679	38686	25 %	25 %	50 %	0 %	523408265
92	NC_017559	CGTC	2	8	38876	38883	0 %	25 %	25 %	50 %	523408265
93	NC_017559	CCGC	2	8	39365	39372	0 %	0 %	25 %	75 %	523408265
94	NC_017559	GCAG	2	8	39390	39397	25 %	0 %	50 %	25 %	523408265
95	NC_017559	GGCG	2	8	39746	39753	0 %	0 %	75 %	25 %	523408266
96	NC_017559	GCGG	2	8	41281	41288	0 %	0 %	75 %	25 %	523408267
97	NC_017559	TGCA	2	8	41319	41326	25 %	25 %	25 %	25 %	523408267
98	NC_017559	GCTG	2	8	41683	41690	0 %	25 %	50 %	25 %	523408267
99	NC_017559	CGGC	2	8	41709	41716	0 %	0 %	50 %	50 %	523408267
100	NC_017559	ACCG	2	8	43070	43077	25 %	0 %	25 %	50 %	523408267
101	NC_017559	GTCG	2	8	43911	43918	0 %	25 %	50 %	25 %	523408268
102	NC_017559	GGCC	2	8	43937	43944	0 %	0 %	50 %	50 %	523408268
103	NC_017559	AGCC	2	8	44030	44037	25 %	0 %	25 %	50 %	523408268
104	NC_017559	CAAG	2	8	44835	44842	50 %	0 %	25 %	25 %	523408268
105	NC_017559	CCGG	2	8	45601	45608	0 %	0 %	50 %	50 %	523408269
106	NC_017559	TGAA	2	8	46036	46043	50 %	25 %	25 %	0 %	523408269
107	NC_017559	AGGC	2	8	47737	47744	25 %	0 %	50 %	25 %	523408270
108	NC_017559	TTGC	2	8	48302	48309	0 %	50 %	25 %	25 %	523408271
109	NC_017559	GCGG	2	8	48568	48575	0 %	0 %	75 %	25 %	523408271
110	NC_017559	CGAG	2	8	48667	48674	25 %	0 %	50 %	25 %	523408271
111	NC_017559	TTCG	2	8	49052	49059	0 %	50 %	25 %	25 %	523408272
112	NC_017559	GTCG	2	8	49198	49205	0 %	25 %	50 %	25 %	523408272
113	NC_017559	CCTT	2	8	49562	49569	0 %	50 %	0 %	50 %	523408272
114	NC_017559	CATG	2	8	49719	49726	25 %	25 %	25 %	25 %	523408272
115	NC_017559	CGGT	2	8	49838	49845	0 %	25 %	50 %	25 %	523408272
116	NC_017559	GCCA	2	8	50014	50021	25 %	0 %	25 %	50 %	523408272
117	NC_017559	GGCA	2	8	50485	50492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017559	GACC	2	8	51531	51538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017559	CGCT	2	8	52047	52054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017559	CGCA	2	8	52441	52448	25 %	0 %	25 %	50 %	523408274
121	NC_017559	ATGC	2	8	52687	52694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017559	CCGC	2	8	52716	52723	0 %	0 %	25 %	75 %	523408275
123	NC_017559	CTTG	2	8	53153	53160	0 %	50 %	25 %	25 %	523408276
124	NC_017559	TCGA	2	8	53428	53435	25 %	25 %	25 %	25 %	523408276
125	NC_017559	TGCG	2	8	53873	53880	0 %	25 %	50 %	25 %	523408276
126	NC_017559	CTGC	2	8	54075	54082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017559	CCCT	2	8	54201	54208	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_017559	CGGC	2	8	54686	54693	0 %	0 %	50 %	50 %	523408278
129	NC_017559	GCTC	2	8	54744	54751	0 %	25 %	25 %	50 %	523408278
130	NC_017559	GAGC	2	8	54787	54794	25 %	0 %	50 %	25 %	523408278
131	NC_017559	GGGC	2	8	56934	56941	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017559	GCTC	2	8	56948	56955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017559	CGGC	2	8	57203	57210	0 %	0 %	50 %	50 %	523408280
134	NC_017559	GGAC	2	8	57400	57407	25 %	0 %	50 %	25 %	523408280
135	NC_017559	CAGG	2	8	57533	57540	25 %	0 %	50 %	25 %	523408280
136	NC_017559	CGAT	2	8	57975	57982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017559	CTCG	2	8	58129	58136	0 %	25 %	25 %	50 %	523408281
138	NC_017559	TCCA	2	8	58226	58233	25 %	25 %	0 %	50 %	523408281
139	NC_017559	GGCG	2	8	58270	58277	0 %	0 %	75 %	25 %	523408281
140	NC_017559	CTCG	2	8	58468	58475	0 %	25 %	25 %	50 %	523408281
141	NC_017559	GGCG	2	8	59123	59130	0 %	0 %	75 %	25 %	523408282
142	NC_017559	CACG	2	8	60094	60101	25 %	0 %	25 %	50 %	523408283
143	NC_017559	GCCG	2	8	60172	60179	0 %	0 %	50 %	50 %	523408283
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