MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	GCCCG	2	10	136	145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017558	TGCGC	2	10	1612	1621	0 %	20 %	40 %	40 %	410683903
3	NC_017558	GGCGT	2	10	2415	2424	0 %	20 %	60 %	20 %	410683904
4	NC_017558	CCCGG	2	10	2965	2974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017558	GGCCG	2	10	4066	4075	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017558	CGGGC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017558	CGGGC	2	10	6103	6112	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017558	GCTGC	2	10	7181	7190	0 %	20 %	40 %	40 %	410683911
9	NC_017558	CGGGT	2	10	8236	8245	0 %	20 %	60 %	20 %	410683913
10	NC_017558	GATGC	2	10	9555	9564	20 %	20 %	40 %	20 %	410683916
11	NC_017558	CGCTG	2	10	9709	9718	0 %	20 %	40 %	40 %	410683917
12	NC_017558	GGCCG	2	10	12314	12323	0 %	0 %	60 %	40 %	410683918
13	NC_017558	TACCG	2	10	12816	12825	20 %	20 %	20 %	40 %	410683918
14	NC_017558	CGAAG	2	10	14260	14269	40 %	0 %	40 %	20 %	410683919
15	NC_017558	GCAGC	2	10	17724	17733	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017558	CGGCG	2	10	20251	20260	0 %	0 %	60 %	40 %	410683930
17	NC_017558	CCGCG	2	10	21313	21322	0 %	0 %	40 %	60 %	410683931
18	NC_017558	TTGCG	2	10	21438	21447	0 %	40 %	40 %	20 %	410683931
19	NC_017558	AATCG	2	10	23888	23897	40 %	20 %	20 %	20 %	410683933
20	NC_017558	CGGTG	2	10	26338	26347	0 %	20 %	60 %	20 %	410683938
21	NC_017558	CAGCT	2	10	28979	28988	20 %	20 %	20 %	40 %	410683939
22	NC_017558	AAAGC	2	10	30627	30636	60 %	0 %	20 %	20 %	410683942
23	NC_017558	CGAAT	2	10	31353	31362	40 %	20 %	20 %	20 %	410683943
24	NC_017558	CCGAA	2	10	31811	31820	40 %	0 %	20 %	40 %	410683944

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.