MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	ACG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017558	GCG	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017558	GCG	2	6	253	258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017558	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017558	ACT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017558	TGG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683902
7	NC_017558	CGA	2	6	585	590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
8	NC_017558	GAC	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
9	NC_017558	AGC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
10	NC_017558	CAT	2	6	780	785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683902
11	NC_017558	CCG	2	6	793	798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
12	NC_017558	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683902
13	NC_017558	CGT	2	6	843	848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683902
14	NC_017558	CAC	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683902
15	NC_017558	AGC	3	9	1131	1139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683902
16	NC_017558	GCC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683903
17	NC_017558	GAG	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683903
18	NC_017558	TGC	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
19	NC_017558	GAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683903
20	NC_017558	TGG	2	6	1461	1466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
21	NC_017558	GTG	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683903
22	NC_017558	GAC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683903
23	NC_017558	GTA	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683903
24	NC_017558	CCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683903
25	NC_017558	CAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
26	NC_017558	GGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
27	NC_017558	TCG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
28	NC_017558	GCG	2	6	2072	2077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683903
29	NC_017558	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
30	NC_017558	CGT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683903
31	NC_017558	AAC	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683903
32	NC_017558	CGG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017558	GCT	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683904
34	NC_017558	AAG	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683904
35	NC_017558	CTT	2	6	2510	2515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683904
36	NC_017558	GCC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683904
37	NC_017558	AGC	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683905
38	NC_017558	CTA	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683905
39	NC_017558	CGC	2	6	3253	3258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683906
40	NC_017558	GAC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
41	NC_017558	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
42	NC_017558	GCG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683906
43	NC_017558	AGC	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
44	NC_017558	ACG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
45	NC_017558	CGA	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
46	NC_017558	GAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683906
47	NC_017558	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683906
48	NC_017558	CGA	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683907
49	NC_017558	GCC	2	6	4430	4435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017558	GGC	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017558	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683908
52	NC_017558	ACG	3	9	4521	4529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683908
53	NC_017558	GCC	2	6	4602	4607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683908
54	NC_017558	GCC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017558	CGG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017558	ATA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017558	AGA	2	6	4713	4718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017558	AAT	2	6	4724	4729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017558	ATT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017558	TTC	2	6	4740	4745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017558	CCG	2	6	4802	4807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
62	NC_017558	CAT	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683909
63	NC_017558	GCA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
64	NC_017558	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
65	NC_017558	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
66	NC_017558	AGC	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
67	NC_017558	GCC	2	6	5311	5316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
68	NC_017558	AGA	2	6	5387	5392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683909
69	NC_017558	AGC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
70	NC_017558	GCG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683909
71	NC_017558	AGG	2	6	5519	5524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683909
72	NC_017558	CGA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
73	NC_017558	CCG	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
74	NC_017558	GCA	3	9	5640	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683909
75	NC_017558	CGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
76	NC_017558	CGC	2	6	5664	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683909
77	NC_017558	GCC	2	6	5856	5861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017558	GCC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017558	GTT	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
80	NC_017558	CGC	2	6	6314	6319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
81	NC_017558	CTT	2	6	6348	6353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683910
82	NC_017558	CGC	2	6	6422	6427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
83	NC_017558	GCT	2	6	6439	6444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683910
84	NC_017558	CGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
85	NC_017558	GCC	3	9	6522	6530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683910
86	NC_017558	GAT	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683910
87	NC_017558	CCA	2	6	6644	6649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683910
88	NC_017558	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683910
89	NC_017558	GGA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683910
90	NC_017558	GAA	2	6	6927	6932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683910
91	NC_017558	TCG	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683910
92	NC_017558	TCA	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683910
93	NC_017558	AGG	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017558	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
95	NC_017558	CGA	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
96	NC_017558	CAG	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
97	NC_017558	CCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
98	NC_017558	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
99	NC_017558	GCC	2	6	7191	7196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
100	NC_017558	TTG	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683911
101	NC_017558	TCG	2	6	7354	7359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683911
102	NC_017558	GCA	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683911
103	NC_017558	GCC	2	6	7440	7445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683911
104	NC_017558	TGG	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683912
105	NC_017558	GCA	2	6	7576	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
106	NC_017558	CGA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
107	NC_017558	ACG	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
108	NC_017558	ATC	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683912
109	NC_017558	CGT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683912
110	NC_017558	TTG	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683912
111	NC_017558	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
112	NC_017558	CTG	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683912
113	NC_017558	CTT	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683912
114	NC_017558	ACG	2	6	7875	7880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683912
115	NC_017558	AGT	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683912
116	NC_017558	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683912
117	NC_017558	TCA	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683912
118	NC_017558	CCG	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683912
119	NC_017558	GCG	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683912
120	NC_017558	TCA	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683913
121	NC_017558	GGC	2	6	8342	8347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683913
122	NC_017558	ACC	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683913
123	NC_017558	CGA	2	6	8469	8474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683913
124	NC_017558	GCT	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683913
125	NC_017558	TCG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683913
126	NC_017558	CTA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683914
127	NC_017558	CAT	2	6	8662	8667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683914
128	NC_017558	ACA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017558	CGC	2	6	8864	8869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017558	GAA	2	6	8957	8962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017558	GCG	2	6	8993	8998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017558	CGC	2	6	9045	9050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683915
133	NC_017558	CGG	2	6	9125	9130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683915
134	NC_017558	GAA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683915
135	NC_017558	CGA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683915
136	NC_017558	CGC	2	6	9338	9343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683915
137	NC_017558	GGA	2	6	9383	9388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683915
138	NC_017558	GCT	2	6	9541	9546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683916
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141	NC_017558	ACC	2	6	9782	9787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683917
142	NC_017558	GAC	2	6	9812	9817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683917
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144	NC_017558	GCC	2	6	9958	9963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683917
145	NC_017558	ACC	2	6	10173	10178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683917
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242	NC_017558	GCA	3	9	16401	16409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683922
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245	NC_017558	GCA	2	6	16612	16617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683923
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249	NC_017558	CAA	2	6	16753	16758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683923
250	NC_017558	AGC	2	6	16896	16901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683923
251	NC_017558	CCG	2	6	17012	17017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683923
252	NC_017558	CGA	2	6	17040	17045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683923
253	NC_017558	AAC	2	6	17060	17065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683923
254	NC_017558	GGA	2	6	17089	17094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683923
255	NC_017558	CTG	2	6	17102	17107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683923
256	NC_017558	GAA	2	6	17141	17146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683923
257	NC_017558	CCG	2	6	17254	17259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683923
258	NC_017558	GCT	2	6	17452	17457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683924
259	NC_017558	AGG	2	6	17563	17568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683924
260	NC_017558	TCG	2	6	17656	17661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683924
261	NC_017558	GAA	2	6	17695	17700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017558	GGC	2	6	17742	17747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017558	GCG	2	6	17828	17833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_017558	GCG	2	6	17883	17888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683925
265	NC_017558	AGC	2	6	17945	17950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683925
266	NC_017558	ATG	2	6	17959	17964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683925
267	NC_017558	GTT	2	6	17988	17993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683925
268	NC_017558	TCA	3	9	18017	18025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683925
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272	NC_017558	CCT	2	6	18118	18123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_017558	GGC	2	6	18143	18148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683926
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275	NC_017558	GTC	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683926
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282	NC_017558	TGC	2	6	18630	18635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683927
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284	NC_017558	ACC	2	6	18730	18735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683927
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289	NC_017558	GTT	2	6	18983	18988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683928
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309	NC_017558	CTT	2	6	20117	20122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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378	NC_017558	GTT	2	6	24411	24416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683934
379	NC_017558	CGT	2	6	24440	24445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683934
380	NC_017558	GCC	2	6	24500	24505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683934
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382	NC_017558	CTG	2	6	24600	24605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683934
383	NC_017558	ACC	2	6	24640	24645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683934
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489	NC_017558	TCT	2	6	31673	31678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_017558	GGA	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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