MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	GC	3	6	5	10	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017558	CG	3	6	499	504	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
3	NC_017558	CG	3	6	737	742	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
4	NC_017558	GC	3	6	821	826	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
5	NC_017558	TG	3	6	1066	1071	0 %	50 %	50 %	0 %	410683902
6	NC_017558	GC	3	6	1092	1097	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
7	NC_017558	GC	3	6	1111	1116	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
8	NC_017558	GC	3	6	1561	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
9	NC_017558	GC	3	6	2151	2156	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
10	NC_017558	GT	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	410683904
11	NC_017558	GC	3	6	2771	2776	0 %	0 %	50 %	50 %	410683905
12	NC_017558	GT	3	6	3419	3424	0 %	50 %	50 %	0 %	410683906
13	NC_017558	CG	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
14	NC_017558	CG	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
15	NC_017558	GC	3	6	4900	4905	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
16	NC_017558	GC	3	6	5121	5126	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
17	NC_017558	GC	4	8	6126	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017558	CG	4	8	7421	7428	0 %	0 %	50 %	50 %	410683911
19	NC_017558	CG	4	8	7541	7548	0 %	0 %	50 %	50 %	410683912
20	NC_017558	CG	3	6	9145	9150	0 %	0 %	50 %	50 %	410683915
21	NC_017558	GC	3	6	9828	9833	0 %	0 %	50 %	50 %	410683917
22	NC_017558	GC	4	8	9855	9862	0 %	0 %	50 %	50 %	410683917
23	NC_017558	CG	3	6	10296	10301	0 %	0 %	50 %	50 %	410683917
24	NC_017558	GC	3	6	10838	10843	0 %	0 %	50 %	50 %	410683917
25	NC_017558	CG	3	6	11511	11516	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
26	NC_017558	GC	4	8	11696	11703	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
27	NC_017558	GC	3	6	12274	12279	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
28	NC_017558	CG	3	6	12300	12305	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
29	NC_017558	GC	3	6	12332	12337	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
30	NC_017558	CG	4	8	12563	12570	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
31	NC_017558	CA	3	6	12883	12888	50 %	0 %	0 %	50 %	410683918
32	NC_017558	GC	4	8	13015	13022	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
33	NC_017558	CG	3	6	13109	13114	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
34	NC_017558	AC	3	6	13297	13302	50 %	0 %	0 %	50 %	410683918
35	NC_017558	GC	3	6	13628	13633	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
36	NC_017558	GC	4	8	13778	13785	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
37	NC_017558	CG	3	6	13869	13874	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
38	NC_017558	CG	3	6	13997	14002	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
39	NC_017558	CG	3	6	14253	14258	0 %	0 %	50 %	50 %	410683919
40	NC_017558	GC	3	6	14619	14624	0 %	0 %	50 %	50 %	410683920
41	NC_017558	CG	3	6	15068	15073	0 %	0 %	50 %	50 %	410683921
42	NC_017558	CG	3	6	15576	15581	0 %	0 %	50 %	50 %	410683922
43	NC_017558	GC	3	6	16115	16120	0 %	0 %	50 %	50 %	410683922
44	NC_017558	GC	3	6	16245	16250	0 %	0 %	50 %	50 %	410683922
45	NC_017558	CA	3	6	16862	16867	50 %	0 %	0 %	50 %	410683923
46	NC_017558	GC	3	6	17544	17549	0 %	0 %	50 %	50 %	410683924
47	NC_017558	CG	3	6	17552	17557	0 %	0 %	50 %	50 %	410683924
48	NC_017558	TG	3	6	18894	18899	0 %	50 %	50 %	0 %	410683927
49	NC_017558	CG	3	6	19250	19255	0 %	0 %	50 %	50 %	410683928
50	NC_017558	CG	3	6	19687	19692	0 %	0 %	50 %	50 %	410683929
51	NC_017558	TC	3	6	20238	20243	0 %	50 %	0 %	50 %	410683930
52	NC_017558	CG	3	6	20592	20597	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
53	NC_017558	GC	3	6	21015	21020	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
54	NC_017558	CG	3	6	21156	21161	0 %	0 %	50 %	50 %	410683931
55	NC_017558	CG	3	6	21997	22002	0 %	0 %	50 %	50 %	410683931
56	NC_017558	CG	3	6	22566	22571	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
57	NC_017558	GC	3	6	22602	22607	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
58	NC_017558	GC	3	6	22629	22634	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
59	NC_017558	CG	4	8	22765	22772	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
60	NC_017558	CA	3	6	23174	23179	50 %	0 %	0 %	50 %	410683932
61	NC_017558	GC	3	6	23351	23356	0 %	0 %	50 %	50 %	410683933
62	NC_017558	GC	3	6	25754	25759	0 %	0 %	50 %	50 %	410683936
63	NC_017558	GA	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	410683936
64	NC_017558	CA	3	6	25811	25816	50 %	0 %	0 %	50 %	410683936
65	NC_017558	TC	3	6	26291	26296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017558	AC	3	6	27654	27659	50 %	0 %	0 %	50 %	410683939
67	NC_017558	CG	3	6	27964	27969	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
68	NC_017558	CG	3	6	28011	28016	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
69	NC_017558	GC	3	6	29071	29076	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
70	NC_017558	CG	3	6	29386	29391	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
71	NC_017558	CA	3	6	29802	29807	50 %	0 %	0 %	50 %	410683940
72	NC_017558	GC	3	6	29810	29815	0 %	0 %	50 %	50 %	410683940
73	NC_017558	GC	3	6	29971	29976	0 %	0 %	50 %	50 %	410683941
74	NC_017558	GC	4	8	31139	31146	0 %	0 %	50 %	50 %	410683943
75	NC_017558	GA	3	6	31255	31260	50 %	0 %	50 %	0 %	410683943
76	NC_017558	CG	3	6	32253	32258	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
77	NC_017558	GC	3	6	32877	32882	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
78	NC_017558	AG	3	6	33367	33372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017558	CG	3	6	34333	34338	0 %	0 %	50 %	50 %	410683946

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.