MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmI

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017557	TAAC	2	8	37	44	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017557	GTCG	2	8	147	154	0 %	25 %	50 %	25 %	386081655
3	NC_017557	GCCG	2	8	441	448	0 %	0 %	50 %	50 %	386081655
4	NC_017557	GCCG	2	8	810	817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017557	CGGT	2	8	859	866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017557	GAAC	2	8	917	924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017557	AAGG	2	8	1092	1099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017557	CATC	2	8	1190	1197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017557	GCCA	2	8	1741	1748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017557	GTAA	2	8	2109	2116	50 %	25 %	25 %	0 %	386081657
11	NC_017557	CCGT	2	8	2584	2591	0 %	25 %	25 %	50 %	386081657
12	NC_017557	ATTT	2	8	3090	3097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017557	GACA	2	8	3631	3638	50 %	0 %	25 %	25 %	386081658
14	NC_017557	CTTT	2	8	3715	3722	0 %	75 %	0 %	25 %	386081658
15	NC_017557	GCTG	2	8	3754	3761	0 %	25 %	50 %	25 %	386081658
16	NC_017557	CGAA	2	8	4129	4136	50 %	0 %	25 %	25 %	386081658
17	NC_017557	CGTC	2	8	4504	4511	0 %	25 %	25 %	50 %	386081658
18	NC_017557	CGGC	2	8	4636	4643	0 %	0 %	50 %	50 %	386081658
19	NC_017557	GACC	2	8	4742	4749	25 %	0 %	25 %	50 %	386081658
20	NC_017557	CGTT	2	8	4773	4780	0 %	50 %	25 %	25 %	386081658
21	NC_017557	GGCG	2	8	5566	5573	0 %	0 %	75 %	25 %	386081659
22	NC_017557	CAGC	2	8	5791	5798	25 %	0 %	25 %	50 %	386081659
23	NC_017557	AAGC	2	8	5808	5815	50 %	0 %	25 %	25 %	386081659
24	NC_017557	GCGG	2	8	5855	5862	0 %	0 %	75 %	25 %	386081659
25	NC_017557	GCTG	2	8	6611	6618	0 %	25 %	50 %	25 %	386081659
26	NC_017557	GCGG	2	8	6692	6699	0 %	0 %	75 %	25 %	386081659
27	NC_017557	TGCG	2	8	7440	7447	0 %	25 %	50 %	25 %	386081659
28	NC_017557	GAAG	2	8	7676	7683	50 %	0 %	50 %	0 %	386081659
29	NC_017557	GCCA	2	8	8033	8040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017557	GCGG	2	8	8590	8597	0 %	0 %	75 %	25 %	386081660
31	NC_017557	CGCT	2	8	8700	8707	0 %	25 %	25 %	50 %	386081661
32	NC_017557	CGTT	2	8	9496	9503	0 %	50 %	25 %	25 %	386081662
33	NC_017557	CCAA	2	8	9517	9524	50 %	0 %	0 %	50 %	386081662
34	NC_017557	CATC	2	8	9683	9690	25 %	25 %	0 %	50 %	386081662
35	NC_017557	GCCG	2	8	9753	9760	0 %	0 %	50 %	50 %	386081662
36	NC_017557	CTGG	2	8	10323	10330	0 %	25 %	50 %	25 %	386081663
37	NC_017557	TAAC	2	8	10703	10710	50 %	25 %	0 %	25 %	386081663
38	NC_017557	GATT	2	8	12225	12232	25 %	50 %	25 %	0 %	386081665
39	NC_017557	GATC	2	8	12303	12310	25 %	25 %	25 %	25 %	386081665
40	NC_017557	CGGC	2	8	12892	12899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017557	CGGC	2	8	12916	12923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017557	CAGC	2	8	12991	12998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017557	ATCT	2	8	13049	13056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017557	CCAT	2	8	14391	14398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017557	GCTT	2	8	14650	14657	0 %	50 %	25 %	25 %	386081667
46	NC_017557	TTAG	2	8	15525	15532	25 %	50 %	25 %	0 %	386081668
47	NC_017557	CGGT	2	8	15684	15691	0 %	25 %	50 %	25 %	386081668
48	NC_017557	ACGC	2	8	16424	16431	25 %	0 %	25 %	50 %	386081668
49	NC_017557	GAAA	2	8	16572	16579	75 %	0 %	25 %	0 %	386081668
50	NC_017557	GTTC	2	8	17233	17240	0 %	50 %	25 %	25 %	386081668
51	NC_017557	CCGC	2	8	17374	17381	0 %	0 %	25 %	75 %	386081668
52	NC_017557	CGCC	2	8	17429	17436	0 %	0 %	25 %	75 %	386081668
53	NC_017557	TCGA	2	8	17501	17508	25 %	25 %	25 %	25 %	386081668
54	NC_017557	TCGC	2	8	17595	17602	0 %	25 %	25 %	50 %	386081668
55	NC_017557	GGTA	2	8	17843	17850	25 %	25 %	50 %	0 %	386081669
56	NC_017557	CTCA	2	8	18489	18496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017557	TTTC	2	8	18534	18541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017557	TCGG	2	8	19000	19007	0 %	25 %	50 %	25 %	386081671
59	NC_017557	CCTT	2	8	19112	19119	0 %	50 %	0 %	50 %	386081671
60	NC_017557	TGGC	2	8	19357	19364	0 %	25 %	50 %	25 %	386081671
61	NC_017557	TCGA	2	8	20095	20102	25 %	25 %	25 %	25 %	386081673
62	NC_017557	TTGG	2	8	20258	20265	0 %	50 %	50 %	0 %	386081673
63	NC_017557	TGGC	2	8	20300	20307	0 %	25 %	50 %	25 %	386081673
64	NC_017557	GGAT	2	8	20326	20333	25 %	25 %	50 %	0 %	386081673
65	NC_017557	TAAT	2	8	20463	20470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017557	GGAT	2	8	20570	20577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017557	AGGA	2	8	20713	20720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017557	AGCC	2	8	21316	21323	25 %	0 %	25 %	50 %	386081675
69	NC_017557	GCCG	2	8	21376	21383	0 %	0 %	50 %	50 %	386081675
70	NC_017557	GGCG	2	8	21703	21710	0 %	0 %	75 %	25 %	386081675
71	NC_017557	CTGA	2	8	22570	22577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017557	CGGC	2	8	22736	22743	0 %	0 %	50 %	50 %	386081676
73	NC_017557	GGCC	2	8	22880	22887	0 %	0 %	50 %	50 %	386081676
74	NC_017557	CCAG	2	8	23018	23025	25 %	0 %	25 %	50 %	386081676
75	NC_017557	TGGC	2	8	23275	23282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017557	CGAC	2	8	23348	23355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017557	CCAC	2	8	24050	24057	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_017557	CTGA	2	8	24373	24380	25 %	25 %	25 %	25 %	386081678
79	NC_017557	GCGG	2	8	24627	24634	0 %	0 %	75 %	25 %	386081678
80	NC_017557	CCGG	2	8	24772	24779	0 %	0 %	50 %	50 %	386081678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.