MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmI

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017557	GCG	2	6	73	78	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081655
2	NC_017557	ACC	2	6	131	136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081655
3	NC_017557	ACG	2	6	287	292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081655
4	NC_017557	CGC	2	6	308	313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081655
5	NC_017557	CGC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081655
6	NC_017557	TCA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081655
7	NC_017557	CGT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081655
8	NC_017557	CAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081655
9	NC_017557	CGG	2	6	565	570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081655
10	NC_017557	GGT	2	6	591	596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081655
11	NC_017557	GCG	2	6	622	627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081655
12	NC_017557	AGC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081655
13	NC_017557	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081655
14	NC_017557	CGA	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081656
15	NC_017557	GCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081656
16	NC_017557	TGG	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081656
17	NC_017557	GTG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081656
18	NC_017557	GCT	2	6	1490	1495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081656
19	NC_017557	TGC	2	6	1498	1503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081656
20	NC_017557	TCG	2	6	1528	1533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081656
21	NC_017557	GCT	3	9	1535	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081656
22	NC_017557	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081656
23	NC_017557	GAG	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386081656
24	NC_017557	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081657
25	NC_017557	AAG	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081657
26	NC_017557	ACA	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081657
27	NC_017557	GCA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081657
28	NC_017557	GCC	2	6	2434	2439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081657
29	NC_017557	TAC	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081657
30	NC_017557	TCG	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081658
31	NC_017557	TTG	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081658
32	NC_017557	TTG	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081658
33	NC_017557	CGG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081658
34	NC_017557	CCA	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081658
35	NC_017557	CTG	2	6	3987	3992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081658
36	NC_017557	GTG	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081658
37	NC_017557	GCT	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081658
38	NC_017557	GGC	2	6	4178	4183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081658
39	NC_017557	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081658
40	NC_017557	CGG	2	6	4282	4287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081658
41	NC_017557	TCG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081658
42	NC_017557	CCG	2	6	4394	4399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081658
43	NC_017557	TCA	2	6	4432	4437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081658
44	NC_017557	TGA	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081658
45	NC_017557	TGG	2	6	4720	4725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081658
46	NC_017557	CGG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081658
47	NC_017557	CGA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081658
48	NC_017557	CAG	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081658
49	NC_017557	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
50	NC_017557	TAC	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081659
51	NC_017557	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
52	NC_017557	GGT	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081659
53	NC_017557	GAT	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081659
54	NC_017557	GAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081659
55	NC_017557	TGA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081659
56	NC_017557	GCG	2	6	5551	5556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
57	NC_017557	ATC	2	6	5589	5594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081659
58	NC_017557	AGC	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
59	NC_017557	GGC	2	6	5756	5761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
60	NC_017557	CCA	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081659
61	NC_017557	GAA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081659
62	NC_017557	ACG	2	6	5974	5979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
63	NC_017557	GGT	2	6	5996	6001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081659
64	NC_017557	GGC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
65	NC_017557	ACC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081659
66	NC_017557	CCG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081659
67	NC_017557	AGC	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
68	NC_017557	GCG	2	6	6149	6154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
69	NC_017557	GGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
70	NC_017557	GAC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
71	NC_017557	AGC	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
72	NC_017557	GCC	2	6	6289	6294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081659
73	NC_017557	TTG	2	6	6328	6333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081659
74	NC_017557	GCA	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
75	NC_017557	CGC	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081659
76	NC_017557	GCA	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
77	NC_017557	GAC	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
78	NC_017557	GCT	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081659
79	NC_017557	GCA	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
80	NC_017557	ATC	2	6	6912	6917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081659
81	NC_017557	CGC	2	6	6956	6961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081659
82	NC_017557	TCG	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081659
83	NC_017557	ACC	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081659
84	NC_017557	AAG	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081659
85	NC_017557	GAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081659
86	NC_017557	GCG	2	6	7464	7469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
87	NC_017557	AGA	2	6	7532	7537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081659
88	NC_017557	ACG	2	6	7645	7650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
89	NC_017557	CCA	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081659
90	NC_017557	CGA	2	6	7733	7738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081659
91	NC_017557	GCG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
92	NC_017557	CGG	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081659
93	NC_017557	GCC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081659
94	NC_017557	CTG	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081660
95	NC_017557	GTC	2	6	8518	8523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081660
96	NC_017557	AGC	2	6	8694	8699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081661
97	NC_017557	GGC	2	6	8787	8792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081661
98	NC_017557	CGC	2	6	8888	8893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081661
99	NC_017557	GCG	2	6	8914	8919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081661
100	NC_017557	TTG	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081661
101	NC_017557	CTT	2	6	9078	9083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081662
102	NC_017557	CGG	2	6	9118	9123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081662
103	NC_017557	ACC	2	6	9136	9141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081662
104	NC_017557	CGT	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081662
105	NC_017557	GAT	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081662
106	NC_017557	TTC	2	6	9208	9213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081662
107	NC_017557	CGT	2	6	9264	9269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081662
108	NC_017557	AGT	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081662
109	NC_017557	GAT	2	6	9570	9575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081662
110	NC_017557	GCA	2	6	9638	9643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081662
111	NC_017557	CAT	2	6	9707	9712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081662
112	NC_017557	TTG	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081662
113	NC_017557	TTC	2	6	9768	9773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081662
114	NC_017557	GGC	2	6	9838	9843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081662
115	NC_017557	GGT	2	6	10089	10094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081662
116	NC_017557	CGG	2	6	10269	10274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081663
117	NC_017557	CGT	2	6	10296	10301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081663
118	NC_017557	GTT	2	6	10356	10361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081663
119	NC_017557	GCA	2	6	10420	10425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081663
120	NC_017557	GAA	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081663
121	NC_017557	GCC	2	6	10458	10463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386081663
122	NC_017557	TGA	3	9	10508	10516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081663
123	NC_017557	TGC	2	6	10561	10566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081663
124	NC_017557	CTG	2	6	10569	10574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081663
125	NC_017557	AGC	2	6	10618	10623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081663
126	NC_017557	GTC	2	6	10654	10659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081663
127	NC_017557	ATC	2	6	10720	10725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081663
128	NC_017557	GCA	2	6	10733	10738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081663
129	NC_017557	GGA	2	6	10739	10744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386081663
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253	NC_017557	CAG	2	6	19734	19739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081672
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256	NC_017557	GAA	2	6	19822	19827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081672
257	NC_017557	GAC	2	6	19883	19888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081672
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.