MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmII

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017556	GC	3	6	1673	1678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017556	GC	3	6	1767	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017556	CT	3	6	2475	2480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017556	GC	3	6	2818	2823	0 %	0 %	50 %	50 %	386081564
5	NC_017556	GC	3	6	3016	3021	0 %	0 %	50 %	50 %	386081564
6	NC_017556	GC	3	6	3131	3136	0 %	0 %	50 %	50 %	386081564
7	NC_017556	GC	3	6	3928	3933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017556	GC	3	6	4317	4322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017556	CG	3	6	4347	4352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017556	GC	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017556	CA	3	6	5137	5142	50 %	0 %	0 %	50 %	386081566
12	NC_017556	GC	4	8	5449	5456	0 %	0 %	50 %	50 %	386081566
13	NC_017556	AC	3	6	6132	6137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017556	GA	3	6	7138	7143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017556	GC	3	6	7588	7593	0 %	0 %	50 %	50 %	386081571
16	NC_017556	GC	3	6	7638	7643	0 %	0 %	50 %	50 %	386081571
17	NC_017556	GC	4	8	7944	7951	0 %	0 %	50 %	50 %	386081571
18	NC_017556	GC	3	6	7953	7958	0 %	0 %	50 %	50 %	386081571
19	NC_017556	CG	3	6	8236	8241	0 %	0 %	50 %	50 %	386081571
20	NC_017556	GC	3	6	8809	8814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017556	GC	3	6	9197	9202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017556	CA	4	8	10108	10115	50 %	0 %	0 %	50 %	386081574
23	NC_017556	CG	3	6	10170	10175	0 %	0 %	50 %	50 %	386081574
24	NC_017556	CA	3	6	10256	10261	50 %	0 %	0 %	50 %	386081574
25	NC_017556	AC	3	6	10465	10470	50 %	0 %	0 %	50 %	386081575
26	NC_017556	CG	3	6	11374	11379	0 %	0 %	50 %	50 %	386081576
27	NC_017556	GC	3	6	11386	11391	0 %	0 %	50 %	50 %	386081576
28	NC_017556	GC	3	6	11706	11711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017556	AT	6	12	11854	11865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017556	CT	3	6	12476	12481	0 %	50 %	0 %	50 %	386081578
31	NC_017556	GA	3	6	13577	13582	50 %	0 %	50 %	0 %	386081578
32	NC_017556	CG	3	6	13814	13819	0 %	0 %	50 %	50 %	386081578
33	NC_017556	GC	3	6	13842	13847	0 %	0 %	50 %	50 %	386081578
34	NC_017556	GC	3	6	14204	14209	0 %	0 %	50 %	50 %	386081579
35	NC_017556	CA	4	8	14352	14359	50 %	0 %	0 %	50 %	386081579
36	NC_017556	GC	4	8	14402	14409	0 %	0 %	50 %	50 %	386081579
37	NC_017556	GC	3	6	14720	14725	0 %	0 %	50 %	50 %	386081579
38	NC_017556	CG	3	6	15295	15300	0 %	0 %	50 %	50 %	386081579
39	NC_017556	GC	3	6	16139	16144	0 %	0 %	50 %	50 %	386081579
40	NC_017556	AC	3	6	16999	17004	50 %	0 %	0 %	50 %	386081580
41	NC_017556	GT	3	6	17132	17137	0 %	50 %	50 %	0 %	386081580
42	NC_017556	GT	3	6	18209	18214	0 %	50 %	50 %	0 %	386081583
43	NC_017556	GC	3	6	18952	18957	0 %	0 %	50 %	50 %	386081583
44	NC_017556	CG	3	6	19264	19269	0 %	0 %	50 %	50 %	386081584
45	NC_017556	CG	3	6	19624	19629	0 %	0 %	50 %	50 %	386081584
46	NC_017556	GC	3	6	21469	21474	0 %	0 %	50 %	50 %	386081586
47	NC_017556	AT	3	6	22117	22122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017556	AT	3	6	22145	22150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017556	GC	3	6	22440	22445	0 %	0 %	50 %	50 %	386081587
50	NC_017556	CA	3	6	22763	22768	50 %	0 %	0 %	50 %	386081587
51	NC_017556	GC	3	6	23512	23517	0 %	0 %	50 %	50 %	386081588
52	NC_017556	GC	3	6	23798	23803	0 %	0 %	50 %	50 %	386081589
53	NC_017556	AC	3	6	24244	24249	50 %	0 %	0 %	50 %	386081589
54	NC_017556	GC	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	386081590
55	NC_017556	CG	3	6	26002	26007	0 %	0 %	50 %	50 %	386081590
56	NC_017556	TC	3	6	27688	27693	0 %	50 %	0 %	50 %	386081593
57	NC_017556	TC	3	6	27750	27755	0 %	50 %	0 %	50 %	386081593
58	NC_017556	GC	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	386081594
59	NC_017556	CG	3	6	28913	28918	0 %	0 %	50 %	50 %	386081595
60	NC_017556	GC	3	6	29712	29717	0 %	0 %	50 %	50 %	386081596
61	NC_017556	GC	3	6	30083	30088	0 %	0 %	50 %	50 %	386081596
62	NC_017556	GC	3	6	30749	30754	0 %	0 %	50 %	50 %	386081597
63	NC_017556	CG	3	6	30761	30766	0 %	0 %	50 %	50 %	386081597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.