MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	ACGTG	2	10	2382	2391	20 %	20 %	40 %	20 %	386076362
2	NC_017555	TTTTC	2	10	2761	2770	0 %	80 %	0 %	20 %	386076362
3	NC_017555	CGCTT	2	10	5147	5156	0 %	40 %	20 %	40 %	386076365
4	NC_017555	TGCGC	2	10	6097	6106	0 %	20 %	40 %	40 %	386076366
5	NC_017555	CTTGC	2	10	6632	6641	0 %	40 %	20 %	40 %	386076367
6	NC_017555	GTGAA	2	10	6810	6819	40 %	20 %	40 %	0 %	386076367
7	NC_017555	ATTTC	2	10	8266	8275	20 %	60 %	0 %	20 %	386076370
8	NC_017555	GCCTC	2	10	8703	8712	0 %	20 %	20 %	60 %	386076371
9	NC_017555	GCAGG	2	10	9703	9712	20 %	0 %	60 %	20 %	386076373
10	NC_017555	TTCGC	2	10	9775	9784	0 %	40 %	20 %	40 %	386076374
11	NC_017555	CGCAG	2	10	11994	12003	20 %	0 %	40 %	40 %	386076375
12	NC_017555	TCGAT	2	10	13988	13997	20 %	40 %	20 %	20 %	386076376
13	NC_017555	TCGCC	2	10	14839	14848	0 %	20 %	20 %	60 %	386076377
14	NC_017555	GACGG	2	10	17390	17399	20 %	0 %	60 %	20 %	386076380
15	NC_017555	TGGTT	2	10	18238	18247	0 %	60 %	40 %	0 %	386076381
16	NC_017555	GGAAA	2	10	19548	19557	60 %	0 %	40 %	0 %	386076383
17	NC_017555	CCGAA	2	10	20185	20194	40 %	0 %	20 %	40 %	386076384
18	NC_017555	TGCGA	2	10	21804	21813	20 %	20 %	40 %	20 %	386076384
19	NC_017555	CGAAG	2	10	25756	25765	40 %	0 %	40 %	20 %	386076390
20	NC_017555	GAACG	2	10	26967	26976	40 %	0 %	40 %	20 %	386076391

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.