MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	CGGC	2	8	361	368	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
2	NC_017555	GATC	2	8	431	438	25 %	25 %	25 %	25 %	386076360
3	NC_017555	ATTC	2	8	1317	1324	25 %	50 %	0 %	25 %	386076361
4	NC_017555	AGCC	2	8	1812	1819	25 %	0 %	25 %	50 %	386076361
5	NC_017555	ATGT	2	8	1950	1957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017555	CGAA	2	8	2727	2734	50 %	0 %	25 %	25 %	386076362
7	NC_017555	GGTC	2	8	2867	2874	0 %	25 %	50 %	25 %	386076362
8	NC_017555	TTTC	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017555	TCGT	2	8	3144	3151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017555	ACGT	2	8	3377	3384	25 %	25 %	25 %	25 %	386076363
11	NC_017555	CCTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	0 %	50 %	386076363
12	NC_017555	GCCG	2	8	4081	4088	0 %	0 %	50 %	50 %	386076364
13	NC_017555	GACC	2	8	4186	4193	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
14	NC_017555	CAAG	2	8	4666	4673	50 %	0 %	25 %	25 %	386076364
15	NC_017555	ACCG	2	8	4715	4722	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
16	NC_017555	GAAA	2	8	4796	4803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017555	GCCT	2	8	5677	5684	0 %	25 %	25 %	50 %	386076365
18	NC_017555	TAAA	2	8	5773	5780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017555	CAAA	2	8	5781	5788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017555	CGGC	2	8	6055	6062	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
21	NC_017555	CGCT	2	8	6149	6156	0 %	25 %	25 %	50 %	386076366
22	NC_017555	TTGG	2	8	6164	6171	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
23	NC_017555	CGGC	2	8	6243	6250	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
24	NC_017555	GACG	2	8	6433	6440	25 %	0 %	50 %	25 %	386076366
25	NC_017555	GAAG	2	8	6667	6674	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
26	NC_017555	GCGG	2	8	6763	6770	0 %	0 %	75 %	25 %	386076367
27	NC_017555	TGCG	2	8	6933	6940	0 %	25 %	50 %	25 %	386076367
28	NC_017555	GAAA	2	8	7396	7403	75 %	0 %	25 %	0 %	386076368
29	NC_017555	TTTG	2	8	7667	7674	0 %	75 %	25 %	0 %	386076368
30	NC_017555	TGAA	2	8	7844	7851	50 %	25 %	25 %	0 %	386076369
31	NC_017555	GGCC	2	8	8240	8247	0 %	0 %	50 %	50 %	386076370
32	NC_017555	CGAC	2	8	8922	8929	25 %	0 %	25 %	50 %	386076372
33	NC_017555	GCTG	2	8	9134	9141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017555	AGCA	2	8	9448	9455	50 %	0 %	25 %	25 %	386076373
35	NC_017555	GGAA	2	8	9592	9599	50 %	0 %	50 %	0 %	386076373
36	NC_017555	GGCC	2	8	9642	9649	0 %	0 %	50 %	50 %	386076373
37	NC_017555	AGCC	2	8	10463	10470	25 %	0 %	25 %	50 %	386076374
38	NC_017555	TTGG	2	8	10609	10616	0 %	50 %	50 %	0 %	386076374
39	NC_017555	CGAC	2	8	10886	10893	25 %	0 %	25 %	50 %	386076374
40	NC_017555	CGAG	2	8	11054	11061	25 %	0 %	50 %	25 %	386076374
41	NC_017555	TCTT	2	8	11647	11654	0 %	75 %	0 %	25 %	386076375
42	NC_017555	TTCG	2	8	11952	11959	0 %	50 %	25 %	25 %	386076375
43	NC_017555	CATC	2	8	12152	12159	25 %	25 %	0 %	50 %	386076375
44	NC_017555	CGGC	2	8	12272	12279	0 %	0 %	50 %	50 %	386076375
45	NC_017555	CGAA	2	8	12329	12336	50 %	0 %	25 %	25 %	386076375
46	NC_017555	CCGA	2	8	12523	12530	25 %	0 %	25 %	50 %	386076375
47	NC_017555	GCTT	2	8	13319	13326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017555	TCTT	2	8	13939	13946	0 %	75 %	0 %	25 %	386076376
49	NC_017555	ATCA	2	8	13956	13963	50 %	25 %	0 %	25 %	386076376
50	NC_017555	TTGG	2	8	13975	13982	0 %	50 %	50 %	0 %	386076376
51	NC_017555	TGGT	2	8	14886	14893	0 %	50 %	50 %	0 %	386076377
52	NC_017555	GAGC	2	8	15050	15057	25 %	0 %	50 %	25 %	386076377
53	NC_017555	TTGT	2	8	16121	16128	0 %	75 %	25 %	0 %	386076378
54	NC_017555	GGCC	2	8	16613	16620	0 %	0 %	50 %	50 %	386076379
55	NC_017555	GTTC	2	8	17276	17283	0 %	50 %	25 %	25 %	386076379
56	NC_017555	CATC	2	8	17306	17313	25 %	25 %	0 %	50 %	386076379
57	NC_017555	CAAA	2	8	17520	17527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017555	CCGA	2	8	17735	17742	25 %	0 %	25 %	50 %	386076381
59	NC_017555	GCCG	2	8	17777	17784	0 %	0 %	50 %	50 %	386076381
60	NC_017555	GAGC	2	8	17800	17807	25 %	0 %	50 %	25 %	386076381
61	NC_017555	GCCG	2	8	17876	17883	0 %	0 %	50 %	50 %	386076381
62	NC_017555	GCGA	2	8	17897	17904	25 %	0 %	50 %	25 %	386076381
63	NC_017555	TTTC	2	8	18872	18879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017555	CCGA	2	8	18895	18902	25 %	0 %	25 %	50 %	386076383
65	NC_017555	GCTG	2	8	19136	19143	0 %	25 %	50 %	25 %	386076383
66	NC_017555	GTAG	2	8	19358	19365	25 %	25 %	50 %	0 %	386076383
67	NC_017555	TGCC	2	8	19388	19395	0 %	25 %	25 %	50 %	386076383
68	NC_017555	CGAA	2	8	19520	19527	50 %	0 %	25 %	25 %	386076383
69	NC_017555	TCTT	2	8	19800	19807	0 %	75 %	0 %	25 %	386076384
70	NC_017555	ACGC	2	8	20041	20048	25 %	0 %	25 %	50 %	386076384
71	NC_017555	ATTG	2	8	20375	20382	25 %	50 %	25 %	0 %	386076384
72	NC_017555	CGGA	2	8	20885	20892	25 %	0 %	50 %	25 %	386076384
73	NC_017555	CACT	2	8	21411	21418	25 %	25 %	0 %	50 %	386076384
74	NC_017555	TCAC	2	8	21525	21532	25 %	25 %	0 %	50 %	386076384
75	NC_017555	GATT	2	8	21551	21558	25 %	50 %	25 %	0 %	386076384
76	NC_017555	ATTT	2	8	21757	21764	25 %	75 %	0 %	0 %	386076384
77	NC_017555	CGTG	2	8	22192	22199	0 %	25 %	50 %	25 %	386076385
78	NC_017555	TGCG	2	8	22711	22718	0 %	25 %	50 %	25 %	386076386
79	NC_017555	TGCG	2	8	22845	22852	0 %	25 %	50 %	25 %	386076387
80	NC_017555	GCCG	2	8	23217	23224	0 %	0 %	50 %	50 %	386076388
81	NC_017555	CTTT	2	8	23440	23447	0 %	75 %	0 %	25 %	386076388
82	NC_017555	GGGA	2	8	23656	23663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017555	ATTG	3	12	24299	24310	25 %	50 %	25 %	0 %	386076389
84	NC_017555	AACG	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017555	TAAA	2	8	24662	24669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017555	TCGC	2	8	25119	25126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017555	ACGG	2	8	25685	25692	25 %	0 %	50 %	25 %	386076390
88	NC_017555	TGGA	2	8	26027	26034	25 %	25 %	50 %	0 %	386076390
89	NC_017555	CCCG	2	8	26501	26508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017555	GAAA	2	8	26659	26666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.