MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 426

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076360
2	NC_017555	ACA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076360
3	NC_017555	CGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
4	NC_017555	GGC	2	6	146	151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
5	NC_017555	GAC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
6	NC_017555	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
7	NC_017555	GTC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
8	NC_017555	CGG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
9	NC_017555	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076360
10	NC_017555	GAT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
11	NC_017555	TGG	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
12	NC_017555	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
13	NC_017555	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
14	NC_017555	GAT	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
15	NC_017555	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
16	NC_017555	GCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076361
17	NC_017555	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
18	NC_017555	GAC	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
19	NC_017555	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
20	NC_017555	TTC	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076361
21	NC_017555	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
22	NC_017555	AAC	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
23	NC_017555	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
24	NC_017555	CAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
25	NC_017555	GGT	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
26	NC_017555	GGT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
27	NC_017555	AAG	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
28	NC_017555	GTC	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076361
29	NC_017555	CGA	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
30	NC_017555	TGC	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017555	TCT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017555	GCT	3	9	2136	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017555	GAA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017555	TCC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076362
35	NC_017555	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076362
36	NC_017555	AGC	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
37	NC_017555	AGC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
38	NC_017555	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076362
39	NC_017555	TCG	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
40	NC_017555	CAG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
41	NC_017555	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
42	NC_017555	GCC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017555	TTC	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017555	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017555	GTA	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017555	GCA	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017555	TGC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017555	CGA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017555	TTA	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017555	GCT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076363
51	NC_017555	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076363
52	NC_017555	CGG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017555	GCA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017555	GGC	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
55	NC_017555	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
56	NC_017555	GAA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
57	NC_017555	ATG	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076364
58	NC_017555	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
59	NC_017555	GTC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
60	NC_017555	TCG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
61	NC_017555	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
62	NC_017555	GCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
63	NC_017555	GCG	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
64	NC_017555	CAG	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076364
65	NC_017555	CTA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017555	GCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076365
67	NC_017555	GCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
68	NC_017555	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
69	NC_017555	GCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
70	NC_017555	TGG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076365
71	NC_017555	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
72	NC_017555	CGT	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
73	NC_017555	CGG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
74	NC_017555	GCG	2	6	5183	5188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
75	NC_017555	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
76	NC_017555	GCT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
77	NC_017555	GCC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
78	NC_017555	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
79	NC_017555	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076365
80	NC_017555	GCT	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
81	NC_017555	GCC	3	9	5611	5619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
82	NC_017555	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076365
83	NC_017555	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017555	GGT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017555	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017555	CGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
87	NC_017555	ACG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
88	NC_017555	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076366
89	NC_017555	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076366
90	NC_017555	CGA	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
91	NC_017555	CAT	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017555	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
93	NC_017555	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
94	NC_017555	GAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
95	NC_017555	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076367
96	NC_017555	TGC	2	6	6915	6920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076367
97	NC_017555	AGC	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
98	NC_017555	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017555	CAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017555	CGG	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017555	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017555	AGC	3	9	7182	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017555	GTC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017555	CTG	2	6	7249	7254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017555	GGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017555	AGC	3	9	7343	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
107	NC_017555	CGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076368
108	NC_017555	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
109	NC_017555	CGG	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
110	NC_017555	ACA	2	6	7514	7519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
111	NC_017555	CGG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
112	NC_017555	GCA	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
113	NC_017555	AGT	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076368
114	NC_017555	TCA	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076368
115	NC_017555	CAA	2	6	7689	7694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
116	NC_017555	GCA	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076369
117	NC_017555	TTC	2	6	7785	7790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
118	NC_017555	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
119	NC_017555	TGC	2	6	7936	7941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076369
120	NC_017555	AGC	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017555	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076370
122	NC_017555	CCG	2	6	8164	8169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076370
123	NC_017555	CCA	2	6	8230	8235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076370
124	NC_017555	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076370
125	NC_017555	AGC	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
126	NC_017555	CTG	2	6	8474	8479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076371
127	NC_017555	CGC	3	9	8489	8497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076371
128	NC_017555	AGC	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
129	NC_017555	TTG	2	6	8542	8547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076371
130	NC_017555	CAA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
131	NC_017555	GAG	2	6	8602	8607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076371
132	NC_017555	ACA	2	6	8772	8777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
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259	NC_017555	GAC	2	6	16297	16302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076378
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401	NC_017555	CGT	2	6	25263	25268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_017555	TAG	2	6	25286	25291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
403	NC_017555	TGG	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017555	TGG	2	6	26998	27003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076391
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.