MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	TGC	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017555	TCT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017555	GCT	3	9	2136	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017555	GAA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017555	GCC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017555	TTC	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017555	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017555	GTA	2	6	3056	3061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017555	GCA	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017555	TGC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017555	CGA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017555	TTA	2	6	3176	3181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017555	CGG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017555	GCA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017555	CTA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017555	TAA	2	6	5790	5795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017555	GGT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017555	CAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017555	CAT	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017555	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017555	CAT	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017555	CGG	2	6	7104	7109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017555	CGC	2	6	7119	7124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017555	AGC	3	9	7182	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017555	GTC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017555	CTG	2	6	7249	7254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017555	GGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017555	AGC	2	6	8055	8060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017555	AGC	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017555	AGC	2	6	16393	16398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017555	GCA	2	6	16411	16416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017555	CAA	2	6	17566	17571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017555	TGC	2	6	17594	17599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017555	CGC	2	6	23048	23053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017555	CAA	2	6	23095	23100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017555	TAT	2	6	23139	23144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017555	GCG	2	6	23589	23594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017555	GGC	2	6	23611	23616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017555	CTG	2	6	24603	24608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017555	ATG	2	6	24635	24640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017555	AAT	2	6	24641	24646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017555	AGA	2	6	24684	24689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017555	CGG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017555	GCG	2	6	24922	24927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017555	CGA	3	9	24939	24947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017555	GAT	2	6	25097	25102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017555	GTT	2	6	25180	25185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017555	GCT	2	6	25191	25196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017555	GTT	2	6	25203	25208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017555	CGT	2	6	25263	25268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017555	TAG	2	6	25286	25291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017555	TGG	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017555	GGA	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017555	ACC	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017555	TCC	2	6	26383	26388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017555	CCG	2	6	26444	26449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017555	CGC	2	6	26537	26542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017555	CTA	2	6	26594	26599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017555	ACT	2	6	26613	26618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.