MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	GC	5	10	308	317	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
2	NC_017555	CA	3	6	1379	1384	50 %	0 %	0 %	50 %	386076361
3	NC_017555	GC	3	6	1679	1684	0 %	0 %	50 %	50 %	386076361
4	NC_017555	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	386076362
5	NC_017555	CG	5	10	3579	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	386076363
6	NC_017555	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017555	GC	4	8	3823	3830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017555	GC	6	12	4742	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017555	GC	3	6	4880	4885	0 %	0 %	50 %	50 %	386076365
10	NC_017555	CG	3	6	5962	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
11	NC_017555	GC	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
12	NC_017555	TG	3	6	6124	6129	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
13	NC_017555	CG	4	8	6315	6322	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
14	NC_017555	CG	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
15	NC_017555	CG	3	6	6517	6522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017555	GC	3	6	6676	6681	0 %	0 %	50 %	50 %	386076367
17	NC_017555	GA	3	6	6823	6828	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
18	NC_017555	GT	3	6	7524	7529	0 %	50 %	50 %	0 %	386076368
19	NC_017555	GC	3	6	7661	7666	0 %	0 %	50 %	50 %	386076368
20	NC_017555	CG	3	6	7970	7975	0 %	0 %	50 %	50 %	386076369
21	NC_017555	GT	3	6	8632	8637	0 %	50 %	50 %	0 %	386076371
22	NC_017555	CG	3	6	9390	9395	0 %	0 %	50 %	50 %	386076373
23	NC_017555	GC	3	6	9476	9481	0 %	0 %	50 %	50 %	386076373
24	NC_017555	TG	3	6	9680	9685	0 %	50 %	50 %	0 %	386076373
25	NC_017555	CG	3	6	9760	9765	0 %	0 %	50 %	50 %	386076374
26	NC_017555	CT	3	6	10148	10153	0 %	50 %	0 %	50 %	386076374
27	NC_017555	CG	3	6	10526	10531	0 %	0 %	50 %	50 %	386076374
28	NC_017555	CG	3	6	10714	10719	0 %	0 %	50 %	50 %	386076374
29	NC_017555	CG	3	6	10875	10880	0 %	0 %	50 %	50 %	386076374
30	NC_017555	CG	3	6	11498	11503	0 %	0 %	50 %	50 %	386076375
31	NC_017555	GC	3	6	13592	13597	0 %	0 %	50 %	50 %	386076376
32	NC_017555	CG	4	8	13790	13797	0 %	0 %	50 %	50 %	386076376
33	NC_017555	AT	3	6	14067	14072	50 %	50 %	0 %	0 %	386076376
34	NC_017555	CG	4	8	14623	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	386076377
35	NC_017555	GT	3	6	15034	15039	0 %	50 %	50 %	0 %	386076377
36	NC_017555	CG	3	6	15044	15049	0 %	0 %	50 %	50 %	386076377
37	NC_017555	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	386076379
38	NC_017555	GC	3	6	19056	19061	0 %	0 %	50 %	50 %	386076383
39	NC_017555	GA	3	6	19381	19386	50 %	0 %	50 %	0 %	386076383
40	NC_017555	CG	3	6	20212	20217	0 %	0 %	50 %	50 %	386076384
41	NC_017555	CG	4	8	20947	20954	0 %	0 %	50 %	50 %	386076384
42	NC_017555	CG	3	6	22266	22271	0 %	0 %	50 %	50 %	386076385
43	NC_017555	CG	3	6	22691	22696	0 %	0 %	50 %	50 %	386076386
44	NC_017555	GC	3	6	23416	23421	0 %	0 %	50 %	50 %	386076388
45	NC_017555	GC	3	6	24503	24508	0 %	0 %	50 %	50 %	386076389
46	NC_017555	CG	3	6	25003	25008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017555	CG	3	6	25223	25228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017555	GC	3	6	25441	25446	0 %	0 %	50 %	50 %	386076390
49	NC_017555	CG	3	6	26458	26463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017555	GC	3	6	26467	26472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.