MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 1003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	386076038
2	NC_017552	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
3	NC_017552	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	386076038
4	NC_017552	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	386076038
5	NC_017552	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	386076038
6	NC_017552	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	386076038
7	NC_017552	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	386076038
8	NC_017552	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
9	NC_017552	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	386076039
10	NC_017552	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	386076039
11	NC_017552	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	386076039
12	NC_017552	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017552	TTCT	2	8	3698	3705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017552	GAAA	2	8	3875	3882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017552	AGTT	2	8	3947	3954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017552	TTTG	2	8	4056	4063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017552	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	386076040
18	NC_017552	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
19	NC_017552	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	386076040
20	NC_017552	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	386076041
21	NC_017552	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
22	NC_017552	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
23	NC_017552	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	386076041
24	NC_017552	AAAT	2	8	6801	6808	75 %	25 %	0 %	0 %	386076042
25	NC_017552	TCAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
26	NC_017552	CTTT	2	8	7920	7927	0 %	75 %	0 %	25 %	386076043
27	NC_017552	CAAA	2	8	8252	8259	75 %	0 %	0 %	25 %	386076043
28	NC_017552	TTAC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
29	NC_017552	TATC	2	8	8791	8798	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
30	NC_017552	GATA	2	8	9186	9193	50 %	25 %	25 %	0 %	386076044
31	NC_017552	TTCT	2	8	9533	9540	0 %	75 %	0 %	25 %	386076044
32	NC_017552	GTTC	2	8	9924	9931	0 %	50 %	25 %	25 %	386076045
33	NC_017552	ATTC	2	8	10908	10915	25 %	50 %	0 %	25 %	386076045
34	NC_017552	TTTC	2	8	11660	11667	0 %	75 %	0 %	25 %	386076046
35	NC_017552	TGTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	25 %	0 %	386076046
36	NC_017552	GAAA	2	8	12258	12265	75 %	0 %	25 %	0 %	386076047
37	NC_017552	GGCG	2	8	12303	12310	0 %	0 %	75 %	25 %	386076047
38	NC_017552	GAAA	2	8	12553	12560	75 %	0 %	25 %	0 %	386076047
39	NC_017552	ATTT	2	8	13212	13219	25 %	75 %	0 %	0 %	386076048
40	NC_017552	TTGG	2	8	13662	13669	0 %	50 %	50 %	0 %	386076048
41	NC_017552	CTTT	2	8	13906	13913	0 %	75 %	0 %	25 %	386076049
42	NC_017552	TACT	2	8	14103	14110	25 %	50 %	0 %	25 %	386076049
43	NC_017552	TATT	2	8	15249	15256	25 %	75 %	0 %	0 %	386076050
44	NC_017552	CAAA	2	8	15347	15354	75 %	0 %	0 %	25 %	386076050
45	NC_017552	GATG	2	8	15988	15995	25 %	25 %	50 %	0 %	386076050
46	NC_017552	AATT	2	8	16191	16198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017552	TTTA	2	8	16328	16335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017552	TCCA	2	8	16515	16522	25 %	25 %	0 %	50 %	386076051
49	NC_017552	AGAA	2	8	17079	17086	75 %	0 %	25 %	0 %	386076051
50	NC_017552	AACC	2	8	17223	17230	50 %	0 %	0 %	50 %	386076051
51	NC_017552	GGAA	2	8	17561	17568	50 %	0 %	50 %	0 %	386076051
52	NC_017552	AACC	2	8	17820	17827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017552	GGTT	2	8	18131	18138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017552	GAAA	2	8	18434	18441	75 %	0 %	25 %	0 %	386076052
55	NC_017552	ACTC	2	8	18473	18480	25 %	25 %	0 %	50 %	386076052
56	NC_017552	GATT	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	386076052
57	NC_017552	AATT	2	8	19737	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017552	AAAT	2	8	20434	20441	75 %	25 %	0 %	0 %	386076054
59	NC_017552	TTGT	2	8	20700	20707	0 %	75 %	25 %	0 %	386076054
60	NC_017552	GTTT	2	8	22088	22095	0 %	75 %	25 %	0 %	386076055
61	NC_017552	TGAA	2	8	22280	22287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017552	CAGA	2	8	22334	22341	50 %	0 %	25 %	25 %	386076056
63	NC_017552	AAAC	2	8	22470	22477	75 %	0 %	0 %	25 %	386076056
64	NC_017552	GTTC	2	8	22815	22822	0 %	50 %	25 %	25 %	386076056
65	NC_017552	AAAG	2	8	22979	22986	75 %	0 %	25 %	0 %	386076056
66	NC_017552	TTAT	2	8	23098	23105	25 %	75 %	0 %	0 %	386076056
67	NC_017552	ATCC	2	8	23321	23328	25 %	25 %	0 %	50 %	386076057
68	NC_017552	GATT	2	8	23390	23397	25 %	50 %	25 %	0 %	386076057
69	NC_017552	AGAA	2	8	23963	23970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017552	TCAA	2	8	24811	24818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017552	ATTT	2	8	24825	24832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017552	ATAG	2	8	25150	25157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017552	TGTT	2	8	25467	25474	0 %	75 %	25 %	0 %	386076059
74	NC_017552	AAAG	2	8	25828	25835	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
75	NC_017552	TAAG	2	8	26027	26034	50 %	25 %	25 %	0 %	386076059
76	NC_017552	AATT	2	8	26048	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	386076059
77	NC_017552	AGAA	2	8	26144	26151	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
78	NC_017552	AAAG	2	8	26295	26302	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
79	NC_017552	ATGT	2	8	26554	26561	25 %	50 %	25 %	0 %	386076060
80	NC_017552	AATT	2	8	26935	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017552	TTAT	2	8	27138	27145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017552	TAAA	2	8	27187	27194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017552	GCTA	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	386076061
84	NC_017552	TGTC	2	8	28057	28064	0 %	50 %	25 %	25 %	386076062
85	NC_017552	CTTC	2	8	28137	28144	0 %	50 %	0 %	50 %	386076062
86	NC_017552	AACT	2	8	28233	28240	50 %	25 %	0 %	25 %	386076062
87	NC_017552	GAAA	2	8	28349	28356	75 %	0 %	25 %	0 %	386076062
88	NC_017552	TCAA	2	8	28568	28575	50 %	25 %	0 %	25 %	386076063
89	NC_017552	AGAA	2	8	29232	29239	75 %	0 %	25 %	0 %	386076063
90	NC_017552	TGAT	2	8	29270	29277	25 %	50 %	25 %	0 %	386076063
91	NC_017552	AACG	2	8	29281	29288	50 %	0 %	25 %	25 %	386076063
92	NC_017552	TGGT	2	8	29676	29683	0 %	50 %	50 %	0 %	386076063
93	NC_017552	AACG	2	8	29993	30000	50 %	0 %	25 %	25 %	386076064
94	NC_017552	AAAC	2	8	30114	30121	75 %	0 %	0 %	25 %	386076064
95	NC_017552	AAAC	2	8	30678	30685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017552	AAAG	2	8	31846	31853	75 %	0 %	25 %	0 %	386076067
97	NC_017552	GAAA	2	8	31900	31907	75 %	0 %	25 %	0 %	386076067
98	NC_017552	ACTT	2	8	33021	33028	25 %	50 %	0 %	25 %	386076069
99	NC_017552	TCAT	2	8	33223	33230	25 %	50 %	0 %	25 %	386076069
100	NC_017552	ATTT	2	8	33455	33462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017552	TCTT	2	8	33996	34003	0 %	75 %	0 %	25 %	386076070
102	NC_017552	GAGT	2	8	34238	34245	25 %	25 %	50 %	0 %	386076070
103	NC_017552	AGTC	2	8	35013	35020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017552	TTTG	2	8	36017	36024	0 %	75 %	25 %	0 %	386076072
105	NC_017552	AAAG	2	8	36300	36307	75 %	0 %	25 %	0 %	386076072
106	NC_017552	GGTT	2	8	37251	37258	0 %	50 %	50 %	0 %	386076072
107	NC_017552	GAAA	2	8	37956	37963	75 %	0 %	25 %	0 %	386076073
108	NC_017552	ACTC	2	8	37995	38002	25 %	25 %	0 %	50 %	386076073
109	NC_017552	TTTA	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	386076073
110	NC_017552	CGTT	2	8	39461	39468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017552	TGTA	2	8	42049	42056	25 %	50 %	25 %	0 %	386076076
112	NC_017552	AAAG	2	8	42075	42082	75 %	0 %	25 %	0 %	386076076
113	NC_017552	AAAT	2	8	42487	42494	75 %	25 %	0 %	0 %	386076076
114	NC_017552	GGAA	2	8	43440	43447	50 %	0 %	50 %	0 %	386076077
115	NC_017552	TTCT	2	8	44069	44076	0 %	75 %	0 %	25 %	386076078
116	NC_017552	TCGA	2	8	44338	44345	25 %	25 %	25 %	25 %	386076078
117	NC_017552	TATG	2	8	44476	44483	25 %	50 %	25 %	0 %	386076078
118	NC_017552	GATA	2	8	44795	44802	50 %	25 %	25 %	0 %	386076079
119	NC_017552	TCAT	2	8	45250	45257	25 %	50 %	0 %	25 %	386076079
120	NC_017552	TCTT	2	8	47160	47167	0 %	75 %	0 %	25 %	386076081
121	NC_017552	ATTT	2	8	47398	47405	25 %	75 %	0 %	0 %	386076081
122	NC_017552	ATCA	2	8	48120	48127	50 %	25 %	0 %	25 %	386076082
123	NC_017552	AAAC	2	8	48483	48490	75 %	0 %	0 %	25 %	386076082
124	NC_017552	ATCA	2	8	48667	48674	50 %	25 %	0 %	25 %	386076082
125	NC_017552	AGAA	2	8	48903	48910	75 %	0 %	25 %	0 %	386076082
126	NC_017552	TGAC	2	8	48949	48956	25 %	25 %	25 %	25 %	386076082
127	NC_017552	AATC	2	8	50164	50171	50 %	25 %	0 %	25 %	386076083
128	NC_017552	TTGT	2	8	50625	50632	0 %	75 %	25 %	0 %	386076084
129	NC_017552	AGGA	2	8	50658	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	386076084
130	NC_017552	ATAA	2	8	50831	50838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017552	GGAA	2	8	51234	51241	50 %	0 %	50 %	0 %	386076085
132	NC_017552	AAAG	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	386076085
133	NC_017552	TTCT	2	8	51578	51585	0 %	75 %	0 %	25 %	386076085
134	NC_017552	ACAA	2	8	52102	52109	75 %	0 %	0 %	25 %	386076085
135	NC_017552	ATTT	2	8	52124	52131	25 %	75 %	0 %	0 %	386076085
136	NC_017552	ACCA	2	8	52485	52492	50 %	0 %	0 %	50 %	386076085
137	NC_017552	TCCA	2	8	52844	52851	25 %	25 %	0 %	50 %	386076086
138	NC_017552	TTTC	2	8	52879	52886	0 %	75 %	0 %	25 %	386076086
139	NC_017552	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	386076087
140	NC_017552	AGTT	2	8	53930	53937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017552	TCGG	2	8	53944	53951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017552	GATC	2	8	54648	54655	25 %	25 %	25 %	25 %	386076088
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144	NC_017552	CTTA	2	8	55109	55116	25 %	50 %	0 %	25 %	386076089
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