MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	386076038
2	NC_017552	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
3	NC_017552	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	386076038
4	NC_017552	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	386076038
5	NC_017552	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	386076038
6	NC_017552	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	386076038
7	NC_017552	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	386076038
8	NC_017552	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
9	NC_017552	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	386076039
10	NC_017552	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	386076039
11	NC_017552	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	386076039
12	NC_017552	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	386076040
13	NC_017552	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
14	NC_017552	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	386076040
15	NC_017552	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	386076041
16	NC_017552	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
17	NC_017552	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
18	NC_017552	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	386076041
19	NC_017552	AAAT	2	8	6801	6808	75 %	25 %	0 %	0 %	386076042
20	NC_017552	TCAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
21	NC_017552	CTTT	2	8	7920	7927	0 %	75 %	0 %	25 %	386076043
22	NC_017552	CAAA	2	8	8252	8259	75 %	0 %	0 %	25 %	386076043
23	NC_017552	TTAC	2	8	8746	8753	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
24	NC_017552	TATC	2	8	8791	8798	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
25	NC_017552	GATA	2	8	9186	9193	50 %	25 %	25 %	0 %	386076044
26	NC_017552	TTCT	2	8	9533	9540	0 %	75 %	0 %	25 %	386076044
27	NC_017552	GTTC	2	8	9924	9931	0 %	50 %	25 %	25 %	386076045
28	NC_017552	ATTC	2	8	10908	10915	25 %	50 %	0 %	25 %	386076045
29	NC_017552	TTTC	2	8	11660	11667	0 %	75 %	0 %	25 %	386076046
30	NC_017552	TGTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	25 %	0 %	386076046
31	NC_017552	GAAA	2	8	12258	12265	75 %	0 %	25 %	0 %	386076047
32	NC_017552	GGCG	2	8	12303	12310	0 %	0 %	75 %	25 %	386076047
33	NC_017552	GAAA	2	8	12553	12560	75 %	0 %	25 %	0 %	386076047
34	NC_017552	ATTT	2	8	13212	13219	25 %	75 %	0 %	0 %	386076048
35	NC_017552	TTGG	2	8	13662	13669	0 %	50 %	50 %	0 %	386076048
36	NC_017552	CTTT	2	8	13906	13913	0 %	75 %	0 %	25 %	386076049
37	NC_017552	TACT	2	8	14103	14110	25 %	50 %	0 %	25 %	386076049
38	NC_017552	TATT	2	8	15249	15256	25 %	75 %	0 %	0 %	386076050
39	NC_017552	CAAA	2	8	15347	15354	75 %	0 %	0 %	25 %	386076050
40	NC_017552	GATG	2	8	15988	15995	25 %	25 %	50 %	0 %	386076050
41	NC_017552	TCCA	2	8	16515	16522	25 %	25 %	0 %	50 %	386076051
42	NC_017552	AGAA	2	8	17079	17086	75 %	0 %	25 %	0 %	386076051
43	NC_017552	AACC	2	8	17223	17230	50 %	0 %	0 %	50 %	386076051
44	NC_017552	GGAA	2	8	17561	17568	50 %	0 %	50 %	0 %	386076051
45	NC_017552	GAAA	2	8	18434	18441	75 %	0 %	25 %	0 %	386076052
46	NC_017552	ACTC	2	8	18473	18480	25 %	25 %	0 %	50 %	386076052
47	NC_017552	GATT	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	386076052
48	NC_017552	AAAT	2	8	20434	20441	75 %	25 %	0 %	0 %	386076054
49	NC_017552	TTGT	2	8	20700	20707	0 %	75 %	25 %	0 %	386076054
50	NC_017552	GTTT	2	8	22088	22095	0 %	75 %	25 %	0 %	386076055
51	NC_017552	CAGA	2	8	22334	22341	50 %	0 %	25 %	25 %	386076056
52	NC_017552	AAAC	2	8	22470	22477	75 %	0 %	0 %	25 %	386076056
53	NC_017552	GTTC	2	8	22815	22822	0 %	50 %	25 %	25 %	386076056
54	NC_017552	AAAG	2	8	22979	22986	75 %	0 %	25 %	0 %	386076056
55	NC_017552	TTAT	2	8	23098	23105	25 %	75 %	0 %	0 %	386076056
56	NC_017552	ATCC	2	8	23321	23328	25 %	25 %	0 %	50 %	386076057
57	NC_017552	GATT	2	8	23390	23397	25 %	50 %	25 %	0 %	386076057
58	NC_017552	TGTT	2	8	25467	25474	0 %	75 %	25 %	0 %	386076059
59	NC_017552	AAAG	2	8	25828	25835	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
60	NC_017552	TAAG	2	8	26027	26034	50 %	25 %	25 %	0 %	386076059
61	NC_017552	AATT	2	8	26048	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	386076059
62	NC_017552	AGAA	2	8	26144	26151	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
63	NC_017552	AAAG	2	8	26295	26302	75 %	0 %	25 %	0 %	386076059
64	NC_017552	ATGT	2	8	26554	26561	25 %	50 %	25 %	0 %	386076060
65	NC_017552	GCTA	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	386076061
66	NC_017552	TGTC	2	8	28057	28064	0 %	50 %	25 %	25 %	386076062
67	NC_017552	CTTC	2	8	28137	28144	0 %	50 %	0 %	50 %	386076062
68	NC_017552	AACT	2	8	28233	28240	50 %	25 %	0 %	25 %	386076062
69	NC_017552	GAAA	2	8	28349	28356	75 %	0 %	25 %	0 %	386076062
70	NC_017552	TCAA	2	8	28568	28575	50 %	25 %	0 %	25 %	386076063
71	NC_017552	AGAA	2	8	29232	29239	75 %	0 %	25 %	0 %	386076063
72	NC_017552	TGAT	2	8	29270	29277	25 %	50 %	25 %	0 %	386076063
73	NC_017552	AACG	2	8	29281	29288	50 %	0 %	25 %	25 %	386076063
74	NC_017552	TGGT	2	8	29676	29683	0 %	50 %	50 %	0 %	386076063
75	NC_017552	AACG	2	8	29993	30000	50 %	0 %	25 %	25 %	386076064
76	NC_017552	AAAC	2	8	30114	30121	75 %	0 %	0 %	25 %	386076064
77	NC_017552	AAAG	2	8	31846	31853	75 %	0 %	25 %	0 %	386076067
78	NC_017552	GAAA	2	8	31900	31907	75 %	0 %	25 %	0 %	386076067
79	NC_017552	ACTT	2	8	33021	33028	25 %	50 %	0 %	25 %	386076069
80	NC_017552	TCAT	2	8	33223	33230	25 %	50 %	0 %	25 %	386076069
81	NC_017552	TCTT	2	8	33996	34003	0 %	75 %	0 %	25 %	386076070
82	NC_017552	GAGT	2	8	34238	34245	25 %	25 %	50 %	0 %	386076070
83	NC_017552	TTTG	2	8	36017	36024	0 %	75 %	25 %	0 %	386076072
84	NC_017552	AAAG	2	8	36300	36307	75 %	0 %	25 %	0 %	386076072
85	NC_017552	GGTT	2	8	37251	37258	0 %	50 %	50 %	0 %	386076072
86	NC_017552	GAAA	2	8	37956	37963	75 %	0 %	25 %	0 %	386076073
87	NC_017552	ACTC	2	8	37995	38002	25 %	25 %	0 %	50 %	386076073
88	NC_017552	TTTA	2	8	38365	38372	25 %	75 %	0 %	0 %	386076073
89	NC_017552	TGTA	2	8	42049	42056	25 %	50 %	25 %	0 %	386076076
90	NC_017552	AAAG	2	8	42075	42082	75 %	0 %	25 %	0 %	386076076
91	NC_017552	AAAT	2	8	42487	42494	75 %	25 %	0 %	0 %	386076076
92	NC_017552	GGAA	2	8	43440	43447	50 %	0 %	50 %	0 %	386076077
93	NC_017552	TTCT	2	8	44069	44076	0 %	75 %	0 %	25 %	386076078
94	NC_017552	TCGA	2	8	44338	44345	25 %	25 %	25 %	25 %	386076078
95	NC_017552	TATG	2	8	44476	44483	25 %	50 %	25 %	0 %	386076078
96	NC_017552	GATA	2	8	44795	44802	50 %	25 %	25 %	0 %	386076079
97	NC_017552	TCAT	2	8	45250	45257	25 %	50 %	0 %	25 %	386076079
98	NC_017552	TCTT	2	8	47160	47167	0 %	75 %	0 %	25 %	386076081
99	NC_017552	ATTT	2	8	47398	47405	25 %	75 %	0 %	0 %	386076081
100	NC_017552	ATCA	2	8	48120	48127	50 %	25 %	0 %	25 %	386076082
101	NC_017552	AAAC	2	8	48483	48490	75 %	0 %	0 %	25 %	386076082
102	NC_017552	ATCA	2	8	48667	48674	50 %	25 %	0 %	25 %	386076082
103	NC_017552	AGAA	2	8	48903	48910	75 %	0 %	25 %	0 %	386076082
104	NC_017552	TGAC	2	8	48949	48956	25 %	25 %	25 %	25 %	386076082
105	NC_017552	AATC	2	8	50164	50171	50 %	25 %	0 %	25 %	386076083
106	NC_017552	TTGT	2	8	50625	50632	0 %	75 %	25 %	0 %	386076084
107	NC_017552	AGGA	2	8	50658	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	386076084
108	NC_017552	GGAA	2	8	51234	51241	50 %	0 %	50 %	0 %	386076085
109	NC_017552	AAAG	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	386076085
110	NC_017552	TTCT	2	8	51578	51585	0 %	75 %	0 %	25 %	386076085
111	NC_017552	ACAA	2	8	52102	52109	75 %	0 %	0 %	25 %	386076085
112	NC_017552	ATTT	2	8	52124	52131	25 %	75 %	0 %	0 %	386076085
113	NC_017552	ACCA	2	8	52485	52492	50 %	0 %	0 %	50 %	386076085
114	NC_017552	TCCA	2	8	52844	52851	25 %	25 %	0 %	50 %	386076086
115	NC_017552	TTTC	2	8	52879	52886	0 %	75 %	0 %	25 %	386076086
116	NC_017552	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	386076087
117	NC_017552	GATC	2	8	54648	54655	25 %	25 %	25 %	25 %	386076088
118	NC_017552	TTCT	2	8	55045	55052	0 %	75 %	0 %	25 %	386076089
119	NC_017552	CTTA	2	8	55109	55116	25 %	50 %	0 %	25 %	386076089
120	NC_017552	TTCG	2	8	57850	57857	0 %	50 %	25 %	25 %	386076091
121	NC_017552	TTGG	2	8	59695	59702	0 %	50 %	50 %	0 %	386076092
122	NC_017552	TTGG	2	8	60533	60540	0 %	50 %	50 %	0 %	386076093
123	NC_017552	AAGA	2	8	61430	61437	75 %	0 %	25 %	0 %	386076094
124	NC_017552	AAAG	2	8	62408	62415	75 %	0 %	25 %	0 %	386076095
125	NC_017552	CTGG	2	8	62545	62552	0 %	25 %	50 %	25 %	386076095
126	NC_017552	CGGG	2	8	62582	62589	0 %	0 %	75 %	25 %	386076095
127	NC_017552	AGAA	2	8	63173	63180	75 %	0 %	25 %	0 %	386076096
128	NC_017552	AAAG	2	8	64286	64293	75 %	0 %	25 %	0 %	386076096
129	NC_017552	TTTC	2	8	64338	64345	0 %	75 %	0 %	25 %	386076096
130	NC_017552	CATA	2	8	64483	64490	50 %	25 %	0 %	25 %	386076096
131	NC_017552	AGAA	2	8	65084	65091	75 %	0 %	25 %	0 %	386076097
132	NC_017552	ATCA	2	8	65291	65298	50 %	25 %	0 %	25 %	386076097
133	NC_017552	TCTT	2	8	65319	65326	0 %	75 %	0 %	25 %	386076097
134	NC_017552	ATTT	2	8	65339	65346	25 %	75 %	0 %	0 %	386076097
135	NC_017552	TTTA	2	8	65713	65720	25 %	75 %	0 %	0 %	386076097
136	NC_017552	CTGG	2	8	65754	65761	0 %	25 %	50 %	25 %	386076097
137	NC_017552	CAAA	2	8	66089	66096	75 %	0 %	0 %	25 %	386076097
138	NC_017552	TTAA	2	8	66240	66247	50 %	50 %	0 %	0 %	386076097
139	NC_017552	GAAA	2	8	67786	67793	75 %	0 %	25 %	0 %	386076098
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