MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 3800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
2	NC_017552	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
3	NC_017552	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
4	NC_017552	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
5	NC_017552	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
6	NC_017552	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
7	NC_017552	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076038
8	NC_017552	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
9	NC_017552	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
10	NC_017552	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
11	NC_017552	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
12	NC_017552	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076038
13	NC_017552	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
14	NC_017552	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
15	NC_017552	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076038
16	NC_017552	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
17	NC_017552	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
18	NC_017552	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
19	NC_017552	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076038
20	NC_017552	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
21	NC_017552	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076038
22	NC_017552	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
23	NC_017552	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
24	NC_017552	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
25	NC_017552	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
26	NC_017552	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
27	NC_017552	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386076038
28	NC_017552	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076039
29	NC_017552	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076039
30	NC_017552	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076039
31	NC_017552	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076039
32	NC_017552	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
33	NC_017552	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076039
34	NC_017552	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
35	NC_017552	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
36	NC_017552	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
37	NC_017552	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017552	GTT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017552	AGT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017552	TAG	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017552	GGA	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017552	GGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
43	NC_017552	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
44	NC_017552	TGT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
45	NC_017552	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
46	NC_017552	CCA	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076040
47	NC_017552	TTC	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
48	NC_017552	AAG	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
49	NC_017552	AGA	3	9	4553	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
50	NC_017552	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
51	NC_017552	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
52	NC_017552	TTC	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
53	NC_017552	TGT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
54	NC_017552	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
55	NC_017552	TCT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017552	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017552	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017552	GAA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017552	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
60	NC_017552	CAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076041
61	NC_017552	TTC	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
62	NC_017552	CCT	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076041
63	NC_017552	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
64	NC_017552	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076041
65	NC_017552	ATC	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076041
66	NC_017552	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
67	NC_017552	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
68	NC_017552	AGA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017552	GCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017552	AAC	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017552	TCT	3	9	6167	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017552	AAT	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017552	CTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017552	CTC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076042
75	NC_017552	GGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076042
76	NC_017552	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076042
77	NC_017552	GTA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076042
78	NC_017552	GAA	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076042
79	NC_017552	GAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076042
80	NC_017552	CTC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076043
81	NC_017552	TAC	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076043
82	NC_017552	TTC	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
83	NC_017552	CTT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
84	NC_017552	TTC	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
85	NC_017552	TGC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076043
86	NC_017552	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076043
87	NC_017552	AGA	3	9	8039	8047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076043
88	NC_017552	GGT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076043
89	NC_017552	TTC	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
90	NC_017552	TTC	2	6	8276	8281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
91	NC_017552	AAT	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386076043
92	NC_017552	ATC	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076043
93	NC_017552	GAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076043
94	NC_017552	AGA	2	6	8875	8880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076043
95	NC_017552	TCT	2	6	9025	9030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076044
96	NC_017552	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076044
97	NC_017552	AGA	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076044
98	NC_017552	ATG	2	6	9340	9345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076044
99	NC_017552	GAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076044
100	NC_017552	CTA	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076044
101	NC_017552	TTC	2	6	9492	9497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076044
102	NC_017552	GGA	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076044
103	NC_017552	AGA	2	6	9555	9560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076044
104	NC_017552	CTT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076044
105	NC_017552	GCC	2	6	9781	9786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076044
106	NC_017552	AGA	2	6	9787	9792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076044
107	NC_017552	GAA	2	6	9870	9875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076045
108	NC_017552	ATT	2	6	10018	10023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076045
109	NC_017552	AGA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076045
110	NC_017552	TGA	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076045
111	NC_017552	GCT	2	6	10239	10244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076045
112	NC_017552	TCT	3	9	10338	10346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076045
113	NC_017552	GAT	2	6	10401	10406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076045
114	NC_017552	TTG	2	6	10491	10496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076045
115	NC_017552	TGA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076045
116	NC_017552	GGA	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076045
117	NC_017552	GTT	2	6	10678	10683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076045
118	NC_017552	GAT	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076045
119	NC_017552	CAA	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076045
120	NC_017552	ATG	3	9	11080	11088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076045
121	NC_017552	TGG	2	6	11216	11221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076046
122	NC_017552	GGT	2	6	11372	11377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076046
123	NC_017552	ATC	2	6	11520	11525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076046
124	NC_017552	GGA	2	6	11713	11718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076046
125	NC_017552	TTC	2	6	12033	12038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076046
126	NC_017552	GGA	2	6	12040	12045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076046
127	NC_017552	AAG	2	6	12125	12130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
128	NC_017552	AGA	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
129	NC_017552	TCC	2	6	12276	12281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076047
130	NC_017552	GAA	2	6	12346	12351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
131	NC_017552	GAA	2	6	12430	12435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
132	NC_017552	AGG	2	6	12492	12497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076047
133	NC_017552	GAA	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
134	NC_017552	GAA	2	6	12604	12609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076047
135	NC_017552	GAG	2	6	12701	12706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076047
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141	NC_017552	GGT	2	6	13160	13165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076048
142	NC_017552	GAG	2	6	13344	13349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076048
143	NC_017552	GAT	2	6	13465	13470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076048
144	NC_017552	TTA	2	6	13577	13582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076048
145	NC_017552	AGA	2	6	13594	13599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076048
146	NC_017552	ACT	2	6	13759	13764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076048
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148	NC_017552	ATT	2	6	14033	14038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076049
149	NC_017552	GGA	2	6	14092	14097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076049
150	NC_017552	GAA	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076049
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152	NC_017552	TCA	2	6	14766	14771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076049
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155	NC_017552	AAG	2	6	15147	15152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017552	TTA	2	6	15180	15185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076050
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160	NC_017552	GAA	2	6	15425	15430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076050
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164	NC_017552	AGA	2	6	15530	15535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076050
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255	NC_017552	GTT	2	6	22697	22702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076056
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257	NC_017552	TAT	3	9	22835	22843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076056
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259	NC_017552	AGA	2	6	23106	23111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076056
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