MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	386076038
2	NC_017552	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	386076039
3	NC_017552	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	386076039
4	NC_017552	TC	3	6	4332	4337	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
5	NC_017552	TC	3	6	5788	5793	0 %	50 %	0 %	50 %	386076041
6	NC_017552	TC	3	6	6724	6729	0 %	50 %	0 %	50 %	386076042
7	NC_017552	TA	3	6	7027	7032	50 %	50 %	0 %	0 %	386076042
8	NC_017552	AT	4	8	7110	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	386076042
9	NC_017552	AG	3	6	7216	7221	50 %	0 %	50 %	0 %	386076042
10	NC_017552	AT	3	6	10010	10015	50 %	50 %	0 %	0 %	386076045
11	NC_017552	CT	3	6	10130	10135	0 %	50 %	0 %	50 %	386076045
12	NC_017552	CT	3	6	10298	10303	0 %	50 %	0 %	50 %	386076045
13	NC_017552	AC	3	6	11450	11455	50 %	0 %	0 %	50 %	386076046
14	NC_017552	TA	3	6	11630	11635	50 %	50 %	0 %	0 %	386076046
15	NC_017552	TA	3	6	11949	11954	50 %	50 %	0 %	0 %	386076046
16	NC_017552	TA	4	8	12444	12451	50 %	50 %	0 %	0 %	386076047
17	NC_017552	GA	3	6	12746	12751	50 %	0 %	50 %	0 %	386076047
18	NC_017552	AG	3	6	13370	13375	50 %	0 %	50 %	0 %	386076048
19	NC_017552	AG	3	6	13637	13642	50 %	0 %	50 %	0 %	386076048
20	NC_017552	GA	3	6	13741	13746	50 %	0 %	50 %	0 %	386076048
21	NC_017552	TA	3	6	14002	14007	50 %	50 %	0 %	0 %	386076049
22	NC_017552	GA	3	6	14332	14337	50 %	0 %	50 %	0 %	386076049
23	NC_017552	GA	3	6	14928	14933	50 %	0 %	50 %	0 %	386076049
24	NC_017552	CT	3	6	14995	15000	0 %	50 %	0 %	50 %	386076049
25	NC_017552	TC	3	6	15800	15805	0 %	50 %	0 %	50 %	386076050
26	NC_017552	GT	3	6	15957	15962	0 %	50 %	50 %	0 %	386076050
27	NC_017552	TA	3	6	16401	16406	50 %	50 %	0 %	0 %	386076051
28	NC_017552	CT	3	6	16680	16685	0 %	50 %	0 %	50 %	386076051
29	NC_017552	GT	3	6	16702	16707	0 %	50 %	50 %	0 %	386076051
30	NC_017552	AT	3	6	17040	17045	50 %	50 %	0 %	0 %	386076051
31	NC_017552	AT	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	386076052
32	NC_017552	AT	3	6	22832	22837	50 %	50 %	0 %	0 %	386076056
33	NC_017552	CG	3	6	23036	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	386076056
34	NC_017552	TA	3	6	26000	26005	50 %	50 %	0 %	0 %	386076059
35	NC_017552	TC	3	6	26565	26570	0 %	50 %	0 %	50 %	386076060
36	NC_017552	CA	3	6	26810	26815	50 %	0 %	0 %	50 %	386076060
37	NC_017552	CG	3	6	28213	28218	0 %	0 %	50 %	50 %	386076062
38	NC_017552	TC	3	6	28328	28333	0 %	50 %	0 %	50 %	386076062
39	NC_017552	TC	3	6	29545	29550	0 %	50 %	0 %	50 %	386076063
40	NC_017552	TA	3	6	29593	29598	50 %	50 %	0 %	0 %	386076063
41	NC_017552	AT	3	6	29909	29914	50 %	50 %	0 %	0 %	386076064
42	NC_017552	GA	3	6	30857	30862	50 %	0 %	50 %	0 %	386076065
43	NC_017552	AT	3	6	30996	31001	50 %	50 %	0 %	0 %	386076065
44	NC_017552	AG	3	6	31111	31116	50 %	0 %	50 %	0 %	386076065
45	NC_017552	TC	3	6	33343	33348	0 %	50 %	0 %	50 %	386076069
46	NC_017552	AG	3	6	36465	36470	50 %	0 %	50 %	0 %	386076072
47	NC_017552	AT	3	6	36881	36886	50 %	50 %	0 %	0 %	386076072
48	NC_017552	AG	3	6	36901	36906	50 %	0 %	50 %	0 %	386076072
49	NC_017552	CT	3	6	38209	38214	0 %	50 %	0 %	50 %	386076073
50	NC_017552	AT	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	386076073
51	NC_017552	AT	3	6	42103	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	386076076
52	NC_017552	TC	3	6	42618	42623	0 %	50 %	0 %	50 %	386076076
53	NC_017552	TA	3	6	43605	43610	50 %	50 %	0 %	0 %	386076078
54	NC_017552	AT	3	6	43805	43810	50 %	50 %	0 %	0 %	386076078
55	NC_017552	TC	3	6	44331	44336	0 %	50 %	0 %	50 %	386076078
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60	NC_017552	TA	3	6	46877	46882	50 %	50 %	0 %	0 %	386076081
61	NC_017552	GA	3	6	47117	47122	50 %	0 %	50 %	0 %	386076081
62	NC_017552	AT	3	6	47890	47895	50 %	50 %	0 %	0 %	386076082
63	NC_017552	AG	3	6	49207	49212	50 %	0 %	50 %	0 %	386076082
64	NC_017552	TC	3	6	49494	49499	0 %	50 %	0 %	50 %	386076082
65	NC_017552	CT	3	6	49790	49795	0 %	50 %	0 %	50 %	386076083
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70	NC_017552	TA	3	6	51800	51805	50 %	50 %	0 %	0 %	386076085
71	NC_017552	TA	3	6	52307	52312	50 %	50 %	0 %	0 %	386076085
72	NC_017552	GA	3	6	52941	52946	50 %	0 %	50 %	0 %	386076087
73	NC_017552	GA	3	6	54843	54848	50 %	0 %	50 %	0 %	386076088
74	NC_017552	GA	3	6	59270	59275	50 %	0 %	50 %	0 %	386076092
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93	NC_017552	TA	3	6	76248	76253	50 %	50 %	0 %	0 %	386076106
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104	NC_017552	AT	3	6	86776	86781	50 %	50 %	0 %	0 %	386076114
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109	NC_017552	TA	3	6	97092	97097	50 %	50 %	0 %	0 %	386076123
110	NC_017552	GA	3	6	97480	97485	50 %	0 %	50 %	0 %	386076124
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113	NC_017552	AG	3	6	99090	99095	50 %	0 %	50 %	0 %	386076124
114	NC_017552	GA	3	6	99320	99325	50 %	0 %	50 %	0 %	386076124
115	NC_017552	AT	3	6	99380	99385	50 %	50 %	0 %	0 %	386076124
116	NC_017552	AT	3	6	100405	100410	50 %	50 %	0 %	0 %	386076124
117	NC_017552	TA	3	6	100551	100556	50 %	50 %	0 %	0 %	386076124
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119	NC_017552	GA	3	6	105849	105854	50 %	0 %	50 %	0 %	386076128
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124	NC_017552	TA	3	6	112133	112138	50 %	50 %	0 %	0 %	386076133
125	NC_017552	AT	3	6	113556	113561	50 %	50 %	0 %	0 %	386076133
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.