MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	TATAA	2	10	2310	2319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017551	GAAAA	2	10	3074	3083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017551	TTTAA	2	10	4423	4432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017551	ATTTA	2	10	19462	19471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017551	ATAAA	2	10	19891	19900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017551	AGATT	2	10	19909	19918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017551	GCCTT	2	10	20709	20718	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017551	TTATT	2	10	25847	25856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017551	TAAAA	2	10	26312	26321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017551	ACTAA	2	10	27361	27370	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017551	TGTAA	2	10	37058	37067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017551	TAAAA	2	10	39505	39514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017551	TTCAA	2	10	47983	47992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017551	TTTAT	2	10	63953	63962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	AGATA	2	10	71417	71426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017551	CTAAA	2	10	83242	83251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017551	TTCTT	2	10	85564	85573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017551	ATTAA	2	10	86553	86562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017551	TTGAG	2	10	94658	94667	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017551	CCCAC	2	10	94825	94834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_017551	ATTTT	2	10	96711	96720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	GTTTT	2	10	98200	98209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	ATTTT	2	10	100496	100505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	TAAAA	2	10	104105	104114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017551	ATATT	2	10	104729	104738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017551	AATTT	2	10	117826	117835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017551	ATACA	2	10	120677	120686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017551	CCTTT	2	10	123941	123950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017551	AATCG	2	10	127810	127819	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017551	ATTTT	2	10	129003	129012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017551	TTTTA	2	10	134059	134068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	ATTCG	2	10	137389	137398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017551	AGTAT	2	10	151789	151798	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017551	AAATT	2	10	151822	151831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017551	ATTTT	2	10	151977	151986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	TAATA	2	10	152739	152748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017551	AAAAT	2	10	157860	157869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017551	TAAAT	2	10	166656	166665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017551	TGGTT	2	10	170832	170841	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017551	TCTAA	2	10	176556	176565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017551	ATTTT	2	10	177273	177282	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017551	ATTGG	2	10	179301	179310	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017551	AGATT	2	10	179475	179484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017551	ATTTT	2	10	183851	183860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017551	TTTTC	2	10	184255	184264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017551	TATTC	2	10	190686	190695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017551	TGGAA	2	10	191031	191040	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017551	ATATT	2	10	194776	194785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017551	ATAAA	2	10	198974	198983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017551	CAATA	2	10	199825	199834	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017551	TAATT	2	10	201609	201618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017551	TTTTA	2	10	217516	217525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017551	AAAAG	2	10	225691	225700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017551	TGAAA	2	10	226956	226965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017551	TTTAT	2	10	227055	227064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017551	CGATT	2	10	240178	240187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017551	TAATA	2	10	240946	240955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017551	TAAAA	2	10	247285	247294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	TAAAA	2	10	257057	257066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	ATTGG	2	10	263367	263376	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	ATTTT	2	10	271445	271454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017551	ACAAA	2	10	272701	272710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017551	TTTAT	2	10	276226	276235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017551	TTTCT	2	10	278419	278428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017551	ATTCT	2	10	280015	280024	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017551	CAAAA	2	10	282979	282988	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017551	AAAGA	2	10	283056	283065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017551	AATTT	2	10	300613	300622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017551	GTTCT	2	10	304983	304992	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017551	ATTTT	2	10	305723	305732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017551	GAAAT	2	10	305787	305796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017551	ATTTT	2	10	317331	317340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017551	ATTTG	2	10	321178	321187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017551	TATAA	2	10	321677	321686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017551	TAATA	2	10	321723	321732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017551	GGGAA	2	10	329884	329893	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017551	TTTTA	2	10	330404	330413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017551	TATTC	2	10	335154	335163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017551	ATTGA	2	10	335487	335496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017551	AAATA	2	10	336401	336410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017551	ATTTT	2	10	336420	336429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017551	TCAAT	2	10	338079	338088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017551	TTTAT	2	10	345380	345389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017551	AATTC	2	10	347201	347210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017551	TTAAT	2	10	348250	348259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017551	TCTAT	2	10	348272	348281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017551	CATTG	2	10	350950	350959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017551	ATTCT	2	10	356584	356593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017551	TATAG	2	10	357373	357382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017551	CATTT	2	10	358139	358148	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017551	GTGAA	2	10	373539	373548	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017551	CAAAA	2	10	375070	375079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017551	TCAAT	2	10	376900	376909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017551	AGATT	2	10	377114	377123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017551	TTTAA	2	10	387774	387783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017551	TTTTG	2	10	388684	388693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017551	TCTTA	2	10	389492	389501	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017551	GAATA	2	10	390000	390009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017551	GTTGT	2	10	393639	393648	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017551	AATAG	2	10	393722	393731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017551	TGCAC	2	10	395202	395211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017551	ATTTT	2	10	396936	396945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017551	AATTA	2	10	397940	397949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017551	TTGGT	2	10	404587	404596	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017551	GCATT	2	10	414471	414480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017551	AAATT	2	10	418719	418728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017551	TTTAA	2	10	419859	419868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	TATTC	2	10	420215	420224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017551	GAATT	2	10	420307	420316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017551	AGGGT	2	10	422037	422046	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017551	AGGGT	2	10	425781	425790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017551	TTTAT	2	10	426077	426086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017551	TTTTG	2	10	428586	428595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017551	TCTAT	2	10	428718	428727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017551	ATTTC	2	10	429545	429554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017551	TATTC	2	10	431068	431077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017551	TTTAT	2	10	433658	433667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017551	AAAAT	2	10	433900	433909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017551	ATTAT	2	10	435994	436003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	CTTTC	2	10	438208	438217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017551	ATTGA	2	10	438361	438370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017551	ATTTT	2	10	443913	443922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017551	AATTT	2	10	446591	446600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017551	AATTG	2	10	451673	451682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017551	TAAAA	2	10	453667	453676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017551	TTCTA	2	10	454519	454528	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017551	AATTC	2	10	455490	455499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017551	TTTTA	2	10	460485	460494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017551	TCTAT	2	10	465749	465758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017551	TTTTA	2	10	467297	467306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017551	TGCAG	2	10	469762	469771	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017551	TCCTT	2	10	470601	470610	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017551	ATGAA	2	10	473375	473384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017551	ATTAA	2	10	475567	475576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017551	ATTTA	2	10	478656	478665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	TGGGA	2	10	483201	483210	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017551	TTTAT	2	10	483629	483638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017551	GTTTT	2	10	483701	483710	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017551	TATAA	2	10	483848	483857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017551	TTCAG	2	10	485933	485942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017551	ACTCA	2	10	486541	486550	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017551	ATAAA	2	10	487565	487574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017551	TTATT	2	10	488311	488320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017551	TCTTG	2	10	489056	489065	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017551	CAATC	2	10	499577	499586	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017551	TATTC	2	10	501319	501328	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017551	ATTTT	2	10	501942	501951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017551	TAAAG	2	10	504135	504144	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017551	TAAAA	2	10	505303	505312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_017551	TTAAG	2	10	928486	928495	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017551	GATTT	2	10	947458	947467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017551	GTTTT	2	10	954235	954244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017551	CCGGA	2	10	959101	959110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_017551	TTCAG	2	10	982603	982612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_017551	AAAAG	2	10	1004787	1004796	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_017551	TTTGA	2	10	1671930	1671939	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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