MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 3226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	386072489
2	NC_017551	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	386072489
3	NC_017551	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	386072493
4	NC_017551	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	386072493
5	NC_017551	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	386072493
6	NC_017551	AGTTA	2	10	8422	8431	40 %	40 %	20 %	0 %	386072493
7	NC_017551	GGAGG	2	10	9308	9317	20 %	0 %	80 %	0 %	386072494
8	NC_017551	GAGAT	2	10	9908	9917	40 %	20 %	40 %	0 %	386072494
9	NC_017551	AAGGA	2	10	10489	10498	60 %	0 %	40 %	0 %	386072494
10	NC_017551	GGTTT	2	10	11874	11883	0 %	60 %	40 %	0 %	386072495
11	NC_017551	GTTTT	2	10	12046	12055	0 %	80 %	20 %	0 %	386072495
12	NC_017551	ATGGA	2	10	12833	12842	40 %	20 %	40 %	0 %	386072497
13	NC_017551	TCAAG	2	10	13231	13240	40 %	20 %	20 %	20 %	386072497
14	NC_017551	GGATC	2	10	15268	15277	20 %	20 %	40 %	20 %	386072499
15	NC_017551	GTTTT	2	10	17761	17770	0 %	80 %	20 %	0 %	386072501
16	NC_017551	TTAGA	2	10	17848	17857	40 %	40 %	20 %	0 %	386072501
17	NC_017551	TAAAA	2	10	18315	18324	80 %	20 %	0 %	0 %	386072501
18	NC_017551	GATTC	2	10	20612	20621	20 %	40 %	20 %	20 %	386072504
19	NC_017551	ATATT	2	10	21237	21246	40 %	60 %	0 %	0 %	386072505
20	NC_017551	AAAAT	2	10	21410	21419	80 %	20 %	0 %	0 %	386072505
21	NC_017551	ATTTT	2	10	24274	24283	20 %	80 %	0 %	0 %	386072509
22	NC_017551	GAAGT	2	10	28128	28137	40 %	20 %	40 %	0 %	386072511
23	NC_017551	GAAAA	2	10	29596	29605	80 %	0 %	20 %	0 %	386072512
24	NC_017551	TATTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	386072512
25	NC_017551	CGATC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	20 %	40 %	386072512
26	NC_017551	GAAAA	2	10	33464	33473	80 %	0 %	20 %	0 %	386072514
27	NC_017551	TATTT	2	10	34033	34042	20 %	80 %	0 %	0 %	386072515
28	NC_017551	GTTTG	2	10	34333	34342	0 %	60 %	40 %	0 %	386072515
29	NC_017551	TACTT	2	10	34446	34455	20 %	60 %	0 %	20 %	386072515
30	NC_017551	TTTCT	2	10	35375	35384	0 %	80 %	0 %	20 %	386072517
31	NC_017551	AGAAT	2	10	35668	35677	60 %	20 %	20 %	0 %	386072517
32	NC_017551	TACAT	2	10	36613	36622	40 %	40 %	0 %	20 %	386072518
33	NC_017551	ATTTC	2	10	37447	37456	20 %	60 %	0 %	20 %	386072519
34	NC_017551	GTTTG	2	10	38454	38463	0 %	60 %	40 %	0 %	386072519
35	NC_017551	AAAAT	2	10	40324	40333	80 %	20 %	0 %	0 %	386072520
36	NC_017551	TGGAA	2	10	41429	41438	40 %	20 %	40 %	0 %	386072522
37	NC_017551	TTAAA	2	10	42426	42435	60 %	40 %	0 %	0 %	386072523
38	NC_017551	GGAAA	2	10	42924	42933	60 %	0 %	40 %	0 %	386072523
39	NC_017551	ATCGA	2	10	43914	43923	40 %	20 %	20 %	20 %	386072523
40	NC_017551	GAATT	2	10	44747	44756	40 %	40 %	20 %	0 %	386072525
41	NC_017551	AAAAT	2	10	47121	47130	80 %	20 %	0 %	0 %	386072526
42	NC_017551	TAAAG	2	10	49738	49747	60 %	20 %	20 %	0 %	386072528
43	NC_017551	AGATC	2	10	52231	52240	40 %	20 %	20 %	20 %	386072531
44	NC_017551	AAAAG	2	10	52927	52936	80 %	0 %	20 %	0 %	386072531
45	NC_017551	AACAT	2	10	55650	55659	60 %	20 %	0 %	20 %	386072533
46	NC_017551	TTTGA	2	10	58539	58548	20 %	60 %	20 %	0 %	386072536
47	NC_017551	TCGAT	2	10	59417	59426	20 %	40 %	20 %	20 %	386072537
48	NC_017551	AGGAT	2	10	59470	59479	40 %	20 %	40 %	0 %	386072537
49	NC_017551	TTTGT	2	10	60770	60779	0 %	80 %	20 %	0 %	386072538
50	NC_017551	GAAGA	2	10	61675	61684	60 %	0 %	40 %	0 %	386072538
51	NC_017551	GAAAA	2	10	64961	64970	80 %	0 %	20 %	0 %	386072540
52	NC_017551	AAAAC	2	10	66616	66625	80 %	0 %	0 %	20 %	386072542
53	NC_017551	AATCT	2	10	67040	67049	40 %	40 %	0 %	20 %	386072542
54	NC_017551	GGGTT	2	10	69351	69360	0 %	40 %	60 %	0 %	386072544
55	NC_017551	ATACC	2	10	70795	70804	40 %	20 %	0 %	40 %	386072545
56	NC_017551	AAAAT	2	10	72234	72243	80 %	20 %	0 %	0 %	386072546
57	NC_017551	GAGAA	2	10	72539	72548	60 %	0 %	40 %	0 %	386072546
58	NC_017551	TTGAA	2	10	73686	73695	40 %	40 %	20 %	0 %	386072547
59	NC_017551	AAAGA	2	10	75262	75271	80 %	0 %	20 %	0 %	386072548
60	NC_017551	GGATT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	40 %	0 %	386072548
61	NC_017551	GGAAA	2	10	76061	76070	60 %	0 %	40 %	0 %	386072548
62	NC_017551	ATTTG	2	10	77817	77826	20 %	60 %	20 %	0 %	386072548
63	NC_017551	GGTTT	2	10	78368	78377	0 %	60 %	40 %	0 %	386072549
64	NC_017551	TTTTG	2	10	78388	78397	0 %	80 %	20 %	0 %	386072549
65	NC_017551	TCACT	2	10	80077	80086	20 %	40 %	0 %	40 %	386072550
66	NC_017551	AAGAA	2	10	81439	81448	80 %	0 %	20 %	0 %	386072550
67	NC_017551	AGAAT	2	10	82322	82331	60 %	20 %	20 %	0 %	386072550
68	NC_017551	AATCA	2	10	85078	85087	60 %	20 %	0 %	20 %	386072553
69	NC_017551	AATAC	2	10	85416	85425	60 %	20 %	0 %	20 %	386072553
70	NC_017551	ATTTT	2	10	87569	87578	20 %	80 %	0 %	0 %	386072556
71	NC_017551	GGATT	2	10	87990	87999	20 %	40 %	40 %	0 %	386072557
72	NC_017551	ATATT	2	10	88932	88941	40 %	60 %	0 %	0 %	386072557
73	NC_017551	AAGGA	2	10	90309	90318	60 %	0 %	40 %	0 %	386072558
74	NC_017551	AGGAA	2	10	91245	91254	60 %	0 %	40 %	0 %	386072559
75	NC_017551	CGGAA	2	10	94233	94242	40 %	0 %	40 %	20 %	386072563
76	NC_017551	TGGTT	2	10	95861	95870	0 %	60 %	40 %	0 %	386072564
77	NC_017551	TCAGA	2	10	97479	97488	40 %	20 %	20 %	20 %	386072566
78	NC_017551	GTAGA	2	10	101154	101163	40 %	20 %	40 %	0 %	386072571
79	NC_017551	CTTTC	2	10	102476	102485	0 %	60 %	0 %	40 %	386072572
80	NC_017551	GATTG	2	10	102842	102851	20 %	40 %	40 %	0 %	386072572
81	NC_017551	TTGTA	2	10	105232	105241	20 %	60 %	20 %	0 %	386072574
82	NC_017551	TGTAC	2	10	105551	105560	20 %	40 %	20 %	20 %	386072574
83	NC_017551	CTTTT	2	10	105689	105698	0 %	80 %	0 %	20 %	386072574
84	NC_017551	ATTTT	2	10	109811	109820	20 %	80 %	0 %	0 %	386072578
85	NC_017551	CAAAT	2	10	110318	110327	60 %	20 %	0 %	20 %	386072578
86	NC_017551	TTATT	2	10	110463	110472	20 %	80 %	0 %	0 %	386072578
87	NC_017551	TATAA	2	10	111380	111389	60 %	40 %	0 %	0 %	386072579
88	NC_017551	ATTTT	2	10	112538	112547	20 %	80 %	0 %	0 %	386072580
89	NC_017551	TTTAT	2	10	113366	113375	20 %	80 %	0 %	0 %	386072580
90	NC_017551	AAAAT	2	10	116295	116304	80 %	20 %	0 %	0 %	386072584
91	NC_017551	TTTGT	2	10	116363	116372	0 %	80 %	20 %	0 %	386072584
92	NC_017551	AAAAT	2	10	116626	116635	80 %	20 %	0 %	0 %	386072584
93	NC_017551	TGGTT	2	10	116831	116840	0 %	60 %	40 %	0 %	386072584
94	NC_017551	ACTTT	2	10	118004	118013	20 %	60 %	0 %	20 %	386072585
95	NC_017551	AAGAA	2	10	118842	118851	80 %	0 %	20 %	0 %	386072585
96	NC_017551	AAATC	2	10	119328	119337	60 %	20 %	0 %	20 %	386072585
97	NC_017551	TTTCT	2	10	124485	124494	0 %	80 %	0 %	20 %	386072589
98	NC_017551	AAAAT	2	10	124696	124705	80 %	20 %	0 %	0 %	386072590
99	NC_017551	ATTAA	2	10	128232	128241	60 %	40 %	0 %	0 %	386072593
100	NC_017551	TCCAA	2	10	128690	128699	40 %	20 %	0 %	40 %	386072593
101	NC_017551	ACAAT	2	10	129202	129211	60 %	20 %	0 %	20 %	386072594
102	NC_017551	CTTTT	2	10	129329	129338	0 %	80 %	0 %	20 %	386072594
103	NC_017551	AAAAT	2	10	132852	132861	80 %	20 %	0 %	0 %	386072599
104	NC_017551	AGATC	2	10	133903	133912	40 %	20 %	20 %	20 %	386072599
105	NC_017551	GAAAA	2	10	135292	135301	80 %	0 %	20 %	0 %	386072601
106	NC_017551	ATTTT	2	10	135574	135583	20 %	80 %	0 %	0 %	386072601
107	NC_017551	GAAAA	2	10	135657	135666	80 %	0 %	20 %	0 %	386072601
108	NC_017551	AAAGA	2	10	136164	136173	80 %	0 %	20 %	0 %	386072601
109	NC_017551	TAGGT	2	10	138209	138218	20 %	40 %	40 %	0 %	386072602
110	NC_017551	GTCCC	2	10	140953	140962	0 %	20 %	20 %	60 %	386072605
111	NC_017551	ATTCA	2	10	141149	141158	40 %	40 %	0 %	20 %	386072605
112	NC_017551	TATTT	2	10	141216	141225	20 %	80 %	0 %	0 %	386072605
113	NC_017551	AAATT	2	10	143809	143818	60 %	40 %	0 %	0 %	386072607
114	NC_017551	GAAAT	2	10	144654	144663	60 %	20 %	20 %	0 %	386072607
115	NC_017551	TTCCT	2	10	147475	147484	0 %	60 %	0 %	40 %	386072609
116	NC_017551	CGATT	2	10	147579	147588	20 %	40 %	20 %	20 %	386072609
117	NC_017551	AAGAA	2	10	148905	148914	80 %	0 %	20 %	0 %	386072610
118	NC_017551	CATTT	2	10	149101	149110	20 %	60 %	0 %	20 %	386072610
119	NC_017551	CAACA	2	10	150035	150044	60 %	0 %	0 %	40 %	386072610
120	NC_017551	TTGAA	2	10	150785	150794	40 %	40 %	20 %	0 %	386072610
121	NC_017551	TATCG	2	10	151114	151123	20 %	40 %	20 %	20 %	386072610
122	NC_017551	CGTAT	2	10	152451	152460	20 %	40 %	20 %	20 %	386072611
123	NC_017551	TTATA	2	10	152978	152987	40 %	60 %	0 %	0 %	386072612
124	NC_017551	TTCTA	2	10	153147	153156	20 %	60 %	0 %	20 %	386072612
125	NC_017551	CGAAA	2	10	154715	154724	60 %	0 %	20 %	20 %	386072614
126	NC_017551	GATTC	2	10	154744	154753	20 %	40 %	20 %	20 %	386072614
127	NC_017551	CTTTC	2	10	155924	155933	0 %	60 %	0 %	40 %	386072616
128	NC_017551	TTAAG	2	10	156674	156683	40 %	40 %	20 %	0 %	386072616
129	NC_017551	GATTT	2	10	158002	158011	20 %	60 %	20 %	0 %	386072617
130	NC_017551	ATTTT	2	10	161006	161015	20 %	80 %	0 %	0 %	386072619
131	NC_017551	TAGTC	2	10	161981	161990	20 %	40 %	20 %	20 %	386072620
132	NC_017551	GATTC	2	10	163074	163083	20 %	40 %	20 %	20 %	386072621
133	NC_017551	GGAAG	2	10	168184	168193	40 %	0 %	60 %	0 %	386072624
134	NC_017551	TTTCT	2	10	168987	168996	0 %	80 %	0 %	20 %	386072624
135	NC_017551	CAGAC	2	10	169159	169168	40 %	0 %	20 %	40 %	386072624
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