MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 13317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	GTTT	2	8	111	118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017551	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
3	NC_017551	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	386072489
4	NC_017551	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
5	NC_017551	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
6	NC_017551	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
7	NC_017551	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
8	NC_017551	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
9	NC_017551	ATTC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017551	GGTT	2	8	2058	2065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017551	TTTA	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017551	TAAA	2	8	2533	2540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017551	AATT	2	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017551	AAAT	2	8	2999	3006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	TTAA	2	8	3192	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017551	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	386072490
17	NC_017551	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	386072490
18	NC_017551	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	386072490
19	NC_017551	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	386072490
20	NC_017551	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	386072492
21	NC_017551	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	386072492
22	NC_017551	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
23	NC_017551	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
24	NC_017551	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
25	NC_017551	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
26	NC_017551	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	386072493
27	NC_017551	GAAC	2	8	8791	8798	50 %	0 %	25 %	25 %	386072494
28	NC_017551	TGAT	2	8	8940	8947	25 %	50 %	25 %	0 %	386072494
29	NC_017551	ACTT	2	8	9129	9136	25 %	50 %	0 %	25 %	386072494
30	NC_017551	TAAA	2	8	9435	9442	75 %	25 %	0 %	0 %	386072494
31	NC_017551	ACTT	2	8	9925	9932	25 %	50 %	0 %	25 %	386072494
32	NC_017551	TTGT	2	8	10032	10039	0 %	75 %	25 %	0 %	386072494
33	NC_017551	TTCT	2	8	12680	12687	0 %	75 %	0 %	25 %	386072497
34	NC_017551	GATT	2	8	13535	13542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017551	TTCT	2	8	13721	13728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017551	TTTC	2	8	13747	13754	0 %	75 %	0 %	25 %	386072498
37	NC_017551	CATT	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	386072498
38	NC_017551	TCTT	2	8	14020	14027	0 %	75 %	0 %	25 %	386072498
39	NC_017551	AGTA	2	8	14034	14041	50 %	25 %	25 %	0 %	386072498
40	NC_017551	AGAT	2	8	14062	14069	50 %	25 %	25 %	0 %	386072498
41	NC_017551	TGTA	2	8	14811	14818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017551	ACTT	2	8	14962	14969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017551	TCCA	2	8	15608	15615	25 %	25 %	0 %	50 %	386072499
44	NC_017551	ATTT	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
45	NC_017551	ATGG	2	8	15936	15943	25 %	25 %	50 %	0 %	386072500
46	NC_017551	AGAA	2	8	15962	15969	75 %	0 %	25 %	0 %	386072500
47	NC_017551	ATTT	2	8	16798	16805	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
48	NC_017551	ATTT	2	8	16875	16882	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
49	NC_017551	AATC	3	12	16969	16980	50 %	25 %	0 %	25 %	386072500
50	NC_017551	ACAA	2	8	17045	17052	75 %	0 %	0 %	25 %	386072500
51	NC_017551	AGAA	2	8	17873	17880	75 %	0 %	25 %	0 %	386072501
52	NC_017551	TGAG	2	8	17956	17963	25 %	25 %	50 %	0 %	386072501
53	NC_017551	TAAA	2	8	19846	19853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017551	TTGC	2	8	20439	20446	0 %	50 %	25 %	25 %	386072504
55	NC_017551	AAAG	2	8	21723	21730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017551	ATCG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	25 %	25 %	386072506
57	NC_017551	ATTT	2	8	22305	22312	25 %	75 %	0 %	0 %	386072507
58	NC_017551	AAAG	2	8	22678	22685	75 %	0 %	25 %	0 %	386072507
59	NC_017551	TTCT	2	8	23061	23068	0 %	75 %	0 %	25 %	386072508
60	NC_017551	AGAA	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	386072508
61	NC_017551	ATTT	2	8	23435	23442	25 %	75 %	0 %	0 %	386072508
62	NC_017551	TGTT	2	8	23993	24000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017551	TACA	2	8	24550	24557	50 %	25 %	0 %	25 %	386072509
64	NC_017551	ATTG	2	8	24662	24669	25 %	50 %	25 %	0 %	386072509
65	NC_017551	TATT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
66	NC_017551	ATTA	2	8	24891	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	386072509
67	NC_017551	CGGT	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	386072509
68	NC_017551	TTAT	2	8	25198	25205	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
69	NC_017551	AATG	2	8	25266	25273	50 %	25 %	25 %	0 %	386072509
70	NC_017551	GGAT	2	8	25310	25317	25 %	25 %	50 %	0 %	386072509
71	NC_017551	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
72	NC_017551	TTGG	2	8	25431	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	386072509
73	NC_017551	AATT	2	8	25860	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017551	TAGT	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017551	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017551	TTCA	2	8	27078	27085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017551	AGAC	2	8	27220	27227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017551	TTAA	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017551	TAAT	2	8	27814	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017551	GAAT	2	8	27845	27852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017551	TTTC	2	8	27986	27993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017551	ATGA	2	8	28020	28027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017551	AAAC	2	8	28077	28084	75 %	0 %	0 %	25 %	386072511
84	NC_017551	GATT	2	8	28294	28301	25 %	50 %	25 %	0 %	386072511
85	NC_017551	ACTT	2	8	28363	28370	25 %	50 %	0 %	25 %	386072511
86	NC_017551	TTCT	2	8	28470	28477	0 %	75 %	0 %	25 %	386072511
87	NC_017551	TTCT	2	8	28506	28513	0 %	75 %	0 %	25 %	386072511
88	NC_017551	AGTC	2	8	28570	28577	25 %	25 %	25 %	25 %	386072511
89	NC_017551	GAAA	2	8	28610	28617	75 %	0 %	25 %	0 %	386072511
90	NC_017551	GTCG	2	8	28691	28698	0 %	25 %	50 %	25 %	386072511
91	NC_017551	ACTT	2	8	28926	28933	25 %	50 %	0 %	25 %	386072511
92	NC_017551	CATA	2	8	29167	29174	50 %	25 %	0 %	25 %	386072512
93	NC_017551	AGAT	2	8	29282	29289	50 %	25 %	25 %	0 %	386072512
94	NC_017551	ATTA	2	8	29396	29403	50 %	50 %	0 %	0 %	386072512
95	NC_017551	ATTC	2	8	29490	29497	25 %	50 %	0 %	25 %	386072512
96	NC_017551	ATTT	2	8	29538	29545	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
97	NC_017551	AAAC	2	8	29613	29620	75 %	0 %	0 %	25 %	386072512
98	NC_017551	ATTT	2	8	29892	29899	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
99	NC_017551	TGTA	2	8	30329	30336	25 %	50 %	25 %	0 %	386072512
100	NC_017551	TTTA	2	8	30412	30419	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
101	NC_017551	TAAA	2	8	30490	30497	75 %	25 %	0 %	0 %	386072512
102	NC_017551	AGAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	386072512
103	NC_017551	TAGA	2	8	30559	30566	50 %	25 %	25 %	0 %	386072512
104	NC_017551	AAAG	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	386072512
105	NC_017551	AATC	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	386072512
106	NC_017551	ATTT	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
107	NC_017551	GTTT	2	8	31424	31431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	ACAG	2	8	31832	31839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017551	AATT	2	8	32010	32017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017551	TCAA	2	8	33195	33202	50 %	25 %	0 %	25 %	386072514
111	NC_017551	GTTT	2	8	33792	33799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017551	TTCT	2	8	34113	34120	0 %	75 %	0 %	25 %	386072515
113	NC_017551	TCAT	2	8	34235	34242	25 %	50 %	0 %	25 %	386072515
114	NC_017551	GAAA	2	8	35155	35162	75 %	0 %	25 %	0 %	386072517
115	NC_017551	GCTG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	50 %	25 %	386072517
116	NC_017551	ATCG	2	8	35604	35611	25 %	25 %	25 %	25 %	386072517
117	NC_017551	GGAA	2	8	35679	35686	50 %	0 %	50 %	0 %	386072517
118	NC_017551	TCTT	2	8	35751	35758	0 %	75 %	0 %	25 %	386072517
119	NC_017551	ATCA	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	386072518
120	NC_017551	TTCT	2	8	36105	36112	0 %	75 %	0 %	25 %	386072518
121	NC_017551	ATCG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	386072518
122	NC_017551	TGAA	2	8	36214	36221	50 %	25 %	25 %	0 %	386072518
123	NC_017551	ATGT	2	8	36929	36936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017551	AATT	2	8	37176	37183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017551	TCTT	2	8	37308	37315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017551	AGAA	2	8	37462	37469	75 %	0 %	25 %	0 %	386072519
127	NC_017551	TTTC	2	8	37513	37520	0 %	75 %	0 %	25 %	386072519
128	NC_017551	AATG	2	8	37597	37604	50 %	25 %	25 %	0 %	386072519
129	NC_017551	CATC	2	8	37921	37928	25 %	25 %	0 %	50 %	386072519
130	NC_017551	TGAA	2	8	38779	38786	50 %	25 %	25 %	0 %	386072519
131	NC_017551	TATT	2	8	38927	38934	25 %	75 %	0 %	0 %	386072519
132	NC_017551	CCAA	2	8	39019	39026	50 %	0 %	0 %	50 %	386072519
133	NC_017551	TTTC	2	8	39348	39355	0 %	75 %	0 %	25 %	386072519
134	NC_017551	CTTT	2	8	39436	39443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017551	GAAA	2	8	39445	39452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017551	TTAA	2	8	39454	39461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017551	AAGT	2	8	39802	39809	50 %	25 %	25 %	0 %	386072520
138	NC_017551	TATC	2	8	39986	39993	25 %	50 %	0 %	25 %	386072520
139	NC_017551	GAAG	2	8	40151	40158	50 %	0 %	50 %	0 %	386072520
140	NC_017551	AATT	2	8	40339	40346	50 %	50 %	0 %	0 %	386072520
141	NC_017551	TTCT	2	8	40547	40554	0 %	75 %	0 %	25 %	386072521
142	NC_017551	AGGA	2	8	40562	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	386072521
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