MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 3618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	GTTT	2	8	111	118	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017551	ATTC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017551	GGTT	2	8	2058	2065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017551	TTTA	2	8	2384	2391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017551	TAAA	2	8	2533	2540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017551	AATT	2	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017551	AAAT	2	8	2999	3006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017551	TTAA	2	8	3192	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017551	GATT	2	8	13535	13542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017551	TTCT	2	8	13721	13728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017551	TGTA	2	8	14811	14818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017551	ACTT	2	8	14962	14969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017551	TAAA	2	8	19846	19853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017551	AAAG	2	8	21723	21730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	TGTT	2	8	23993	24000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017551	AATT	2	8	25860	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017551	TAGT	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017551	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017551	TTCA	2	8	27078	27085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017551	AGAC	2	8	27220	27227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017551	TTAA	2	8	27372	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	TAAT	2	8	27814	27821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	GAAT	2	8	27845	27852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	TTTC	2	8	27986	27993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017551	ATGA	2	8	28020	28027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017551	GTTT	2	8	31424	31431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017551	ACAG	2	8	31832	31839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017551	AATT	2	8	32010	32017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017551	GTTT	2	8	33792	33799	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017551	ATGT	2	8	36929	36936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017551	AATT	2	8	37176	37183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	TCTT	2	8	37308	37315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017551	CTTT	2	8	39436	39443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017551	GAAA	2	8	39445	39452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017551	TTAA	2	8	39454	39461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	AAAT	2	8	43981	43988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017551	CCAT	2	8	44128	44135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017551	AATT	2	8	48008	48015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017551	TTTA	2	8	50840	50847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017551	AATT	2	8	51464	51471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017551	GAAT	2	8	51636	51643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017551	CAGG	2	8	53893	53900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017551	GATT	2	8	54105	54112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017551	CTTA	2	8	62325	62332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017551	CGAA	2	8	65107	65114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017551	AAAT	2	8	67665	67672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017551	TTCT	2	8	68784	68791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017551	TTTG	2	8	68844	68851	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017551	GGCA	2	8	71319	71326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017551	ATGT	2	8	71368	71375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017551	AGTT	2	8	74571	74578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017551	AAGA	2	8	79027	79034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017551	ATTT	2	8	79381	79388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017551	CGTT	2	8	79544	79551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017551	AAAT	2	8	82962	82969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017551	AAAT	2	8	83180	83187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017551	CGAG	2	8	86477	86484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017551	ATTT	2	8	92478	92485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	TTTA	2	8	94394	94401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	GATT	2	8	94681	94688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	TGGG	2	8	96239	96246	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017551	GGTT	2	8	96428	96435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017551	TGAT	2	8	96499	96506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017551	AATT	2	8	100053	100060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017551	AAAC	2	8	100515	100522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017551	TAGA	2	8	101852	101859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017551	AATT	2	8	103153	103160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017551	ATTT	2	8	103269	103276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017551	TACT	2	8	104233	104240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017551	CGTA	2	8	104471	104478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017551	TATT	2	8	104715	104722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017551	TATT	2	8	104767	104774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017551	AACA	2	8	104911	104918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017551	TATT	2	8	110679	110686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017551	ATTT	2	8	110752	110759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017551	TAAC	2	8	110932	110939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017551	ACTT	2	8	111061	111068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017551	TCAA	2	8	114311	114318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017551	GTTT	2	8	115397	115404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017551	TTTA	2	8	120392	120399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017551	TCGA	2	8	120603	120610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017551	AATT	2	8	120635	120642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017551	CATT	2	8	121035	121042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017551	TTAA	2	8	121216	121223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017551	TAAA	2	8	121261	121268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017551	TGAA	2	8	123928	123935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017551	TTTA	2	8	126168	126175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017551	TAAA	2	8	127835	127842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017551	ACTT	2	8	127958	127965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017551	AATT	2	8	127986	127993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017551	GAAG	2	8	129405	129412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017551	TTTC	2	8	132770	132777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017551	ATCT	2	8	132808	132815	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017551	AAAG	2	8	134678	134685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017551	TTCT	2	8	134940	134947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017551	ATTG	2	8	136845	136852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017551	TTAC	2	8	137453	137460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017551	TATT	2	8	138688	138695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017551	ATTT	2	8	139349	139356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017551	ATTT	2	8	139441	139448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017551	AAAT	2	8	139602	139609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017551	AATA	2	8	140262	140269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017551	TAAT	2	8	140307	140314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017551	GCTT	2	8	140518	140525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017551	TAAT	2	8	142543	142550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017551	ATTT	2	8	151322	151329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017551	AATT	2	8	151501	151508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017551	TAAA	2	8	151778	151785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017551	TTCT	2	8	155137	155144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017551	GTTT	2	8	157583	157590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017551	AAAC	2	8	157797	157804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017551	AGAA	2	8	160120	160127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017551	TAAA	2	8	166781	166788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017551	AAAT	2	8	166962	166969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017551	TAAG	2	8	167429	167436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017551	AGAA	2	8	167555	167562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017551	ATAA	2	8	167749	167756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017551	ATAA	2	8	167798	167805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017551	AATT	2	8	170679	170686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017551	GTAG	2	8	170869	170876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017551	GTTG	2	8	173383	173390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017551	CAAA	2	8	174065	174072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017551	GTTT	2	8	174122	174129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017551	CAAA	2	8	174282	174289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017551	TAGT	2	8	176390	176397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017551	TCAA	2	8	176481	176488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017551	GATT	2	8	176966	176973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017551	TAAA	2	8	178363	178370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017551	AAAT	2	8	178398	178405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017551	AGAA	2	8	179060	179067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017551	ATAG	2	8	179095	179102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017551	TAAA	2	8	179203	179210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017551	ATCT	2	8	179377	179384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017551	AATA	2	8	179391	179398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017551	CTTA	2	8	179498	179505	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017551	GAAA	2	8	179506	179513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017551	CTTT	2	8	183249	183256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017551	ATAA	2	8	183300	183307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017551	TTCG	2	8	184242	184249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017551	AAAG	2	8	184760	184767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017551	AATT	2	8	190488	190495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017551	ATAC	2	8	190577	190584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017551	ATTT	2	8	190700	190707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017551	TTTA	2	8	193250	193257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017551	TGAA	2	8	196683	196690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017551	TTCT	2	8	198618	198625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017551	ATTG	2	8	198833	198840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017551	CATT	2	8	198882	198889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017551	ATTA	2	8	198951	198958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017551	ACTT	2	8	199941	199948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017551	AGGA	2	8	199956	199963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017551	TTGA	2	8	200342	200349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017551	ATTT	2	8	200974	200981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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