MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 9699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
2	NC_017551	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	386072489
3	NC_017551	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
4	NC_017551	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
5	NC_017551	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
6	NC_017551	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
7	NC_017551	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
8	NC_017551	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	386072490
9	NC_017551	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	386072490
10	NC_017551	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	386072490
11	NC_017551	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	386072490
12	NC_017551	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	386072492
13	NC_017551	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	386072492
14	NC_017551	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
15	NC_017551	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
16	NC_017551	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
17	NC_017551	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
18	NC_017551	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	386072493
19	NC_017551	GAAC	2	8	8791	8798	50 %	0 %	25 %	25 %	386072494
20	NC_017551	TGAT	2	8	8940	8947	25 %	50 %	25 %	0 %	386072494
21	NC_017551	ACTT	2	8	9129	9136	25 %	50 %	0 %	25 %	386072494
22	NC_017551	TAAA	2	8	9435	9442	75 %	25 %	0 %	0 %	386072494
23	NC_017551	ACTT	2	8	9925	9932	25 %	50 %	0 %	25 %	386072494
24	NC_017551	TTGT	2	8	10032	10039	0 %	75 %	25 %	0 %	386072494
25	NC_017551	TTCT	2	8	12680	12687	0 %	75 %	0 %	25 %	386072497
26	NC_017551	TTTC	2	8	13747	13754	0 %	75 %	0 %	25 %	386072498
27	NC_017551	CATT	2	8	13997	14004	25 %	50 %	0 %	25 %	386072498
28	NC_017551	TCTT	2	8	14020	14027	0 %	75 %	0 %	25 %	386072498
29	NC_017551	AGTA	2	8	14034	14041	50 %	25 %	25 %	0 %	386072498
30	NC_017551	AGAT	2	8	14062	14069	50 %	25 %	25 %	0 %	386072498
31	NC_017551	TCCA	2	8	15608	15615	25 %	25 %	0 %	50 %	386072499
32	NC_017551	ATTT	2	8	15865	15872	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
33	NC_017551	ATGG	2	8	15936	15943	25 %	25 %	50 %	0 %	386072500
34	NC_017551	AGAA	2	8	15962	15969	75 %	0 %	25 %	0 %	386072500
35	NC_017551	ATTT	2	8	16798	16805	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
36	NC_017551	ATTT	2	8	16875	16882	25 %	75 %	0 %	0 %	386072500
37	NC_017551	AATC	3	12	16969	16980	50 %	25 %	0 %	25 %	386072500
38	NC_017551	ACAA	2	8	17045	17052	75 %	0 %	0 %	25 %	386072500
39	NC_017551	AGAA	2	8	17873	17880	75 %	0 %	25 %	0 %	386072501
40	NC_017551	TGAG	2	8	17956	17963	25 %	25 %	50 %	0 %	386072501
41	NC_017551	TTGC	2	8	20439	20446	0 %	50 %	25 %	25 %	386072504
42	NC_017551	ATCG	2	8	22021	22028	25 %	25 %	25 %	25 %	386072506
43	NC_017551	ATTT	2	8	22305	22312	25 %	75 %	0 %	0 %	386072507
44	NC_017551	AAAG	2	8	22678	22685	75 %	0 %	25 %	0 %	386072507
45	NC_017551	TTCT	2	8	23061	23068	0 %	75 %	0 %	25 %	386072508
46	NC_017551	AGAA	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	386072508
47	NC_017551	ATTT	2	8	23435	23442	25 %	75 %	0 %	0 %	386072508
48	NC_017551	TACA	2	8	24550	24557	50 %	25 %	0 %	25 %	386072509
49	NC_017551	ATTG	2	8	24662	24669	25 %	50 %	25 %	0 %	386072509
50	NC_017551	TATT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
51	NC_017551	ATTA	2	8	24891	24898	50 %	50 %	0 %	0 %	386072509
52	NC_017551	CGGT	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	386072509
53	NC_017551	TTAT	2	8	25198	25205	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
54	NC_017551	AATG	2	8	25266	25273	50 %	25 %	25 %	0 %	386072509
55	NC_017551	GGAT	2	8	25310	25317	25 %	25 %	50 %	0 %	386072509
56	NC_017551	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	386072509
57	NC_017551	TTGG	2	8	25431	25438	0 %	50 %	50 %	0 %	386072509
58	NC_017551	AAAC	2	8	28077	28084	75 %	0 %	0 %	25 %	386072511
59	NC_017551	GATT	2	8	28294	28301	25 %	50 %	25 %	0 %	386072511
60	NC_017551	ACTT	2	8	28363	28370	25 %	50 %	0 %	25 %	386072511
61	NC_017551	TTCT	2	8	28470	28477	0 %	75 %	0 %	25 %	386072511
62	NC_017551	TTCT	2	8	28506	28513	0 %	75 %	0 %	25 %	386072511
63	NC_017551	AGTC	2	8	28570	28577	25 %	25 %	25 %	25 %	386072511
64	NC_017551	GAAA	2	8	28610	28617	75 %	0 %	25 %	0 %	386072511
65	NC_017551	GTCG	2	8	28691	28698	0 %	25 %	50 %	25 %	386072511
66	NC_017551	ACTT	2	8	28926	28933	25 %	50 %	0 %	25 %	386072511
67	NC_017551	CATA	2	8	29167	29174	50 %	25 %	0 %	25 %	386072512
68	NC_017551	AGAT	2	8	29282	29289	50 %	25 %	25 %	0 %	386072512
69	NC_017551	ATTA	2	8	29396	29403	50 %	50 %	0 %	0 %	386072512
70	NC_017551	ATTC	2	8	29490	29497	25 %	50 %	0 %	25 %	386072512
71	NC_017551	ATTT	2	8	29538	29545	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
72	NC_017551	AAAC	2	8	29613	29620	75 %	0 %	0 %	25 %	386072512
73	NC_017551	ATTT	2	8	29892	29899	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
74	NC_017551	TGTA	2	8	30329	30336	25 %	50 %	25 %	0 %	386072512
75	NC_017551	TTTA	2	8	30412	30419	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
76	NC_017551	TAAA	2	8	30490	30497	75 %	25 %	0 %	0 %	386072512
77	NC_017551	AGAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	386072512
78	NC_017551	TAGA	2	8	30559	30566	50 %	25 %	25 %	0 %	386072512
79	NC_017551	AAAG	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	386072512
80	NC_017551	AATC	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	386072512
81	NC_017551	ATTT	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	386072512
82	NC_017551	TCAA	2	8	33195	33202	50 %	25 %	0 %	25 %	386072514
83	NC_017551	TTCT	2	8	34113	34120	0 %	75 %	0 %	25 %	386072515
84	NC_017551	TCAT	2	8	34235	34242	25 %	50 %	0 %	25 %	386072515
85	NC_017551	GAAA	2	8	35155	35162	75 %	0 %	25 %	0 %	386072517
86	NC_017551	GCTG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	50 %	25 %	386072517
87	NC_017551	ATCG	2	8	35604	35611	25 %	25 %	25 %	25 %	386072517
88	NC_017551	GGAA	2	8	35679	35686	50 %	0 %	50 %	0 %	386072517
89	NC_017551	TCTT	2	8	35751	35758	0 %	75 %	0 %	25 %	386072517
90	NC_017551	ATCA	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	386072518
91	NC_017551	TTCT	2	8	36105	36112	0 %	75 %	0 %	25 %	386072518
92	NC_017551	ATCG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	386072518
93	NC_017551	TGAA	2	8	36214	36221	50 %	25 %	25 %	0 %	386072518
94	NC_017551	AGAA	2	8	37462	37469	75 %	0 %	25 %	0 %	386072519
95	NC_017551	TTTC	2	8	37513	37520	0 %	75 %	0 %	25 %	386072519
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98	NC_017551	TGAA	2	8	38779	38786	50 %	25 %	25 %	0 %	386072519
99	NC_017551	TATT	2	8	38927	38934	25 %	75 %	0 %	0 %	386072519
100	NC_017551	CCAA	2	8	39019	39026	50 %	0 %	0 %	50 %	386072519
101	NC_017551	TTTC	2	8	39348	39355	0 %	75 %	0 %	25 %	386072519
102	NC_017551	AAGT	2	8	39802	39809	50 %	25 %	25 %	0 %	386072520
103	NC_017551	TATC	2	8	39986	39993	25 %	50 %	0 %	25 %	386072520
104	NC_017551	GAAG	2	8	40151	40158	50 %	0 %	50 %	0 %	386072520
105	NC_017551	AATT	2	8	40339	40346	50 %	50 %	0 %	0 %	386072520
106	NC_017551	TTCT	2	8	40547	40554	0 %	75 %	0 %	25 %	386072521
107	NC_017551	AGGA	2	8	40562	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	386072521
108	NC_017551	AAAT	2	8	41761	41768	75 %	25 %	0 %	0 %	386072523
109	NC_017551	AAAG	2	8	42974	42981	75 %	0 %	25 %	0 %	386072523
110	NC_017551	GAAT	3	12	43044	43055	50 %	25 %	25 %	0 %	386072523
111	NC_017551	GAAA	2	8	43111	43118	75 %	0 %	25 %	0 %	386072523
112	NC_017551	ATGA	2	8	43283	43290	50 %	25 %	25 %	0 %	386072523
113	NC_017551	TTCG	2	8	43371	43378	0 %	50 %	25 %	25 %	386072523
114	NC_017551	AAAG	2	8	43966	43973	75 %	0 %	25 %	0 %	386072523
115	NC_017551	GAAA	2	8	44281	44288	75 %	0 %	25 %	0 %	386072524
116	NC_017551	AGAC	2	8	44582	44589	50 %	0 %	25 %	25 %	386072524
117	NC_017551	TTGG	2	8	45664	45671	0 %	50 %	50 %	0 %	386072525
118	NC_017551	TTCT	2	8	46447	46454	0 %	75 %	0 %	25 %	386072526
119	NC_017551	AGAT	2	8	47640	47647	50 %	25 %	25 %	0 %	386072526
120	NC_017551	TATT	2	8	47696	47703	25 %	75 %	0 %	0 %	386072526
121	NC_017551	ATAC	2	8	47749	47756	50 %	25 %	0 %	25 %	386072526
122	NC_017551	GAAA	2	8	48324	48331	75 %	0 %	25 %	0 %	386072527
123	NC_017551	TAAA	2	8	48413	48420	75 %	25 %	0 %	0 %	386072527
124	NC_017551	TGGA	2	8	48861	48868	25 %	25 %	50 %	0 %	386072528
125	NC_017551	AGCT	2	8	49352	49359	25 %	25 %	25 %	25 %	386072528
126	NC_017551	ATTC	2	8	49857	49864	25 %	50 %	0 %	25 %	386072529
127	NC_017551	TTCC	2	8	52053	52060	0 %	50 %	0 %	50 %	386072531
128	NC_017551	AACA	2	8	52752	52759	75 %	0 %	0 %	25 %	386072531
129	NC_017551	TCTT	2	8	52903	52910	0 %	75 %	0 %	25 %	386072531
130	NC_017551	AGAA	2	8	53348	53355	75 %	0 %	25 %	0 %	386072531
131	NC_017551	TCAA	2	8	53367	53374	50 %	25 %	0 %	25 %	386072531
132	NC_017551	AATC	2	8	54618	54625	50 %	25 %	0 %	25 %	386072532
133	NC_017551	ATCA	2	8	55297	55304	50 %	25 %	0 %	25 %	386072533
134	NC_017551	AAAC	2	8	55324	55331	75 %	0 %	0 %	25 %	386072533
135	NC_017551	GGAA	2	8	55940	55947	50 %	0 %	50 %	0 %	386072533
136	NC_017551	CATT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	0 %	25 %	386072534
137	NC_017551	ATTT	2	8	56323	56330	25 %	75 %	0 %	0 %	386072534
138	NC_017551	CGAT	2	8	56783	56790	25 %	25 %	25 %	25 %	386072534
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