MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 46551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	CTT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017551	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072489
3	NC_017551	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
4	NC_017551	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072489
5	NC_017551	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072489
6	NC_017551	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
7	NC_017551	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072489
8	NC_017551	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072489
9	NC_017551	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
10	NC_017551	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
11	NC_017551	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
12	NC_017551	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
13	NC_017551	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072489
14	NC_017551	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017551	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017551	AGT	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017551	TCA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017551	TCA	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017551	AGA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017551	CGA	2	6	2025	2030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017551	ATT	2	6	2047	2052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017551	AGT	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017551	AAG	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017551	CAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017551	TGA	2	6	2373	2378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017551	ATG	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017551	AAT	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017551	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017551	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017551	TAC	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017551	GTT	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017551	TAT	2	6	2791	2796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017551	ATT	2	6	2857	2862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017551	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017551	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017551	TAC	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017551	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017551	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072490
39	NC_017551	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
40	NC_017551	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386072490
41	NC_017551	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
42	NC_017551	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
43	NC_017551	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
44	NC_017551	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
45	NC_017551	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072490
46	NC_017551	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
47	NC_017551	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
48	NC_017551	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
49	NC_017551	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072490
50	NC_017551	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
51	NC_017551	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
52	NC_017551	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
53	NC_017551	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
54	NC_017551	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
55	NC_017551	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
56	NC_017551	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072490
57	NC_017551	TAT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017551	TAT	2	6	4357	4362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017551	ATA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017551	TAT	2	6	4509	4514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017551	TTA	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017551	AGA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017551	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
64	NC_017551	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
65	NC_017551	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
66	NC_017551	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
67	NC_017551	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
68	NC_017551	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072491
69	NC_017551	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
70	NC_017551	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
71	NC_017551	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072491
72	NC_017551	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072491
73	NC_017551	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072491
74	NC_017551	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
75	NC_017551	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072491
76	NC_017551	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072491
77	NC_017551	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
78	NC_017551	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
79	NC_017551	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
80	NC_017551	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
81	NC_017551	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
82	NC_017551	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072491
83	NC_017551	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072492
84	NC_017551	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072492
85	NC_017551	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072492
86	NC_017551	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
87	NC_017551	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
88	NC_017551	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
89	NC_017551	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072493
90	NC_017551	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
91	NC_017551	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072493
92	NC_017551	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
93	NC_017551	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
94	NC_017551	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386072493
95	NC_017551	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072493
96	NC_017551	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
97	NC_017551	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
98	NC_017551	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
99	NC_017551	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
100	NC_017551	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
101	NC_017551	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
102	NC_017551	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
103	NC_017551	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072493
104	NC_017551	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072493
105	NC_017551	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
106	NC_017551	AAG	2	6	8688	8693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
107	NC_017551	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
108	NC_017551	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072494
109	NC_017551	ATC	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
110	NC_017551	CGG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072494
111	NC_017551	GAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
112	NC_017551	TTA	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
113	NC_017551	ATG	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
114	NC_017551	AAC	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072494
115	NC_017551	TTC	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
116	NC_017551	TCC	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072494
117	NC_017551	ATT	2	6	9299	9304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072494
118	NC_017551	AGA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
119	NC_017551	AGA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
120	NC_017551	TCC	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072494
121	NC_017551	ACA	2	6	9853	9858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072494
122	NC_017551	TGA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
123	NC_017551	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
124	NC_017551	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
125	NC_017551	ATC	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
126	NC_017551	AAG	2	6	10050	10055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
127	NC_017551	TTC	2	6	10114	10119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
128	NC_017551	GAA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
129	NC_017551	GGT	2	6	10226	10231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072494
130	NC_017551	GAT	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072494
131	NC_017551	ATA	2	6	10302	10307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072494
132	NC_017551	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072494
133	NC_017551	ATC	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072494
134	NC_017551	TCT	2	6	10474	10479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072494
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258	NC_017551	GTT	2	6	21653	21658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_017551	AGA	2	6	21761	21766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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